| 摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 缩略语 | 第11-12页 |
| 第一部分 引言 | 第12-22页 |
| 1. 军团菌及军团菌病的历史与现状 | 第12-14页 |
| 2. 水环境中的军团菌 | 第14页 |
| 3. 军团菌的基因分型方法 | 第14-17页 |
| 4. 嗜肺军团菌的群体遗传学结构 | 第17-18页 |
| 5. 嗜肺军团菌环境分离株的遗传多态性 | 第18-20页 |
| 6. 本研究的技术路线 | 第20-21页 |
| 7. 本研究的目的和意义 | 第21-22页 |
| 第二部分 中国城市自然水环境中军团菌的分布 | 第22-46页 |
| 1. 前言 | 第22页 |
| 2. 材料 | 第22-24页 |
| 2.1. 培养基 | 第22-23页 |
| 2.2. 酶与试剂 | 第23-24页 |
| 2.3. 主要仪器 | 第24页 |
| 3. 方法 | 第24-29页 |
| 3.1. 主要培养基的配置 | 第24页 |
| 3.2. 主要溶液的配置 | 第24-25页 |
| 3.3. 采样城市 | 第25页 |
| 3.4. 水样采集策略及水样采集 | 第25页 |
| 3.5. 水源温度及pH值测定 | 第25页 |
| 3.6. 水样的处理 | 第25-26页 |
| 3.7. 军团菌的分离培养 | 第26页 |
| 3.8. DNA提取 | 第26-27页 |
| 3.9. mip基因测序 | 第27-28页 |
| 3.10. 部分 16S rRNA基因序列测定 | 第28页 |
| 3.11. 数据分析 | 第28-29页 |
| 4. 结果 | 第29-41页 |
| 4.1. 水样采集 | 第29页 |
| 4.2. 菌种分布 | 第29-32页 |
| 4.3. 样品分离阳性率 | 第32-37页 |
| 4.4. 军团菌在各个城市中的分布 | 第37-39页 |
| 4.5. 同一样本中的不同种军团菌 | 第39-41页 |
| 5. 讨论 | 第41-45页 |
| 6. 小结 | 第45-46页 |
| 第三部分 中国城市自然水环境中嗜肺军团菌的遗传多态性 | 第46-76页 |
| 1. 前言 | 第46-47页 |
| 2. 材料 | 第47-48页 |
| 2.1. 菌株 | 第47页 |
| 2.2. 培养基 | 第47页 |
| 2.3. 酶与试剂 | 第47页 |
| 2.4. 主要仪器 | 第47页 |
| 2.5. 相关软件 | 第47-48页 |
| 3. 方法 | 第48-51页 |
| 3.1. 血清分型 | 第48页 |
| 3.2. lag-1 基因的扩增 | 第48-49页 |
| 3.3. SBT | 第49-51页 |
| 3.4. 群体遗传学分析 | 第51页 |
| 3.5. 重组分析 | 第51页 |
| 3.6. 统计分析 | 第51页 |
| 4. 结果 | 第51-70页 |
| 4.1. 血清型分布 | 第51-52页 |
| 4.2. 嗜肺军团菌菌株中lag-1 基因分布 | 第52-53页 |
| 4.3. SBT | 第53-57页 |
| 4.4. 自然水环境菌株的种群结构 | 第57-58页 |
| 4.5. 系统发育关系 | 第58-60页 |
| 4.6. 不同地区菌株分布 | 第60-63页 |
| 4.7. 不同水环境中菌株分布 | 第63-65页 |
| 4.8. 基因内及基因间重组 | 第65-67页 |
| 4.9. 自然水环境菌株与人工水环境菌株的异同 | 第67-70页 |
| 5. 讨论 | 第70-75页 |
| 6. 小结 | 第75-76页 |
| 参考文献 | 第76-84页 |
| 附表 | 第84-117页 |
| 综述 | 第117-132页 |
| 1. SBT 发展过程及所选用的基因 | 第117-119页 |
| 2. 如何利用 SBT 对嗜肺军团菌进行分型 | 第119-121页 |
| 3. SBT 数据库现状 | 第121-123页 |
| 4. SBT 与其它分子分型方法相比的优缺点 | 第123页 |
| 5. SBT 在嗜肺军团菌研究中的应用 | 第123-127页 |
| 6. 结语 | 第127-128页 |
| 参考文献 | 第128-132页 |
| 个人简历 | 第132-133页 |
| 致谢 | 第133-134页 |