| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6页 |
| 第一章 引言 | 第9-15页 |
| 1.1 研究问题的由来 | 第9页 |
| 1.2 miRNA的研究进展 | 第9-13页 |
| 1.2.1 miRNA的发现 | 第9页 |
| 1.2.2 miRNA的形成机制 | 第9-10页 |
| 1.2.3 miRNA的表达调控 | 第10-11页 |
| 1.2.4 miRNA与高通量测序 | 第11-12页 |
| 1.2.5 miRNA表达检测 | 第12-13页 |
| 1.3 牛miRNA研究进展与不足 | 第13页 |
| 1.4 本实验研究目的及意义 | 第13-15页 |
| 第二章 材料与方法 | 第15-21页 |
| 2.1 材料 | 第15页 |
| 2.1.1 组织样品 | 第15页 |
| 2.1.2 生物学试剂 | 第15页 |
| 2.1.3 主要生物学仪器 | 第15页 |
| 2.2 方法 | 第15-21页 |
| 2.2.1 总RNA的提取 | 第15-16页 |
| 2.2.2 总RNA的质量检测 | 第16页 |
| 2.2.3 miRNA文库构建 | 第16-18页 |
| 2.2.4 测序数据的预处理 | 第18页 |
| 2.2.5 Solexa高通量数据的生物信息学分析 | 第18页 |
| 2.2.6 miRNA组织表达的定量检测 | 第18-21页 |
| 第三章 结果与分析 | 第21-31页 |
| 3.1 总RNA的质量检测 | 第21-23页 |
| 3.2 高通量测序结果 | 第23-31页 |
| 3.2.1 原始测序数据统计 | 第23页 |
| 3.2.2 测序数据的质量评估 | 第23-24页 |
| 3.2.3 测序数据预处理结果统计 | 第24-25页 |
| 3.2.4 测序序列长度分布 | 第25-26页 |
| 3.2.5 miRNA分类注释 | 第26页 |
| 3.2.6 miRDeep分析miRNA | 第26页 |
| 3.2.7 miRNA验证及组织表达定量检测 | 第26-31页 |
| 第四章 讨论 | 第31-35页 |
| 4.1 高质量的RNA的制备是miRNA的分离、鉴定及相应文库构建的关键因素 | 第31页 |
| 4.2 对miRNA发掘方法的讨论 | 第31-32页 |
| 4.3 miRNA的测序质量 | 第32页 |
| 4.4 miRDeep分析检测miRNA | 第32-33页 |
| 4.5 与已报道mi RNA的比较 | 第33页 |
| 4.6 miRNA验证及表达谱分析 | 第33-35页 |
| 第五章 结论 | 第35-36页 |
| 参考文献 | 第36-40页 |
| 附录 | 第40-72页 |
| 在读期间发表论文 | 第72-73页 |
| 作者简介 | 第73-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |