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基于PCR结合MALDI-TOF MS技术检测胶质瘤IDH突变的研究

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
第一章 绪论第9-19页
    1.1 胶质瘤与IDH简介第9-10页
    1.2 IDH基因突变与胶质瘤发病联系第10-11页
    1.3 PCR技术及质谱技术简介第11-14页
        1.3.1 PCR原理与应用第11-12页
        1.3.2 质谱分析及其在核酸领域的应用第12-14页
    1.4 基因突变及其检测技术第14-15页
    1.5 IDH突变与核酸质谱技术的研究进展第15-17页
        1.5.1 胶质瘤IDH基因突变的研究进展第15-16页
        1.5.2 MALDI-TOF质谱技术应用于核酸突变检测的研究进展第16页
        1.5.3 综合进展第16-17页
    1.6 论文研究意义及内容第17-19页
第二章 材料与方法第19-30页
    2.1 实验材料与仪器第19-22页
        2.1.1 主要试剂及产地第19-20页
        2.1.2 主要仪器及生产公司第20-21页
        2.1.3 主要溶液的配制第21-22页
    2.2 细胞、组织来源及细胞培养第22页
        2.2.1 胶质瘤细胞来源第22页
        2.2.2 胶质瘤组织来源及信息第22页
        2.2.3 胶质瘤细胞培养第22页
    2.3 DNA的提取及其浓度的测定第22-25页
        2.3.1 胶质瘤细胞样品中基因组DNA的提取第22-23页
        2.3.2 胶质瘤组织样品中基因组DNA的提取第23-25页
        2.3.3 核酸浓度及纯度的测定第25页
    2.4 引物设计与PCR反应的优化第25-26页
        2.4.1 引物设计及合成第25-26页
        2.4.2 PCR反应退火温度的优化第26页
        2.4.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳第26页
    2.5 限制酶酶切反应第26-27页
    2.6 MALDI-TOF质谱检测第27-29页
        2.6.1 MALDI靶板及基质准备第27-28页
            2.6.1.1 靶板的清洗第27-28页
            2.6.1.2 基质的准备第28页
        2.6.2 MALDI-TOF样品的制备第28页
        2.6.3 MALDI-TOF质谱检测第28-29页
    2.7 ESI-Orbitrap质谱验证第29页
    2.8 基因测序验证第29-30页
第三章 结果与讨论第30-61页
    3.1 PCR及酶切反应结果第30-34页
        3.1.1 基因组DNA的获得第30-31页
        3.1.2 PCR反应结果及退火温度的选择第31-33页
        3.1.3 限制酶的酶切反应结果第33-34页
    3.2 寡核苷酸序列分子量计算第34-37页
    3.3 MALDI-TOF MS的方法优化第37-51页
        3.3.1 不同MALDI基质对质谱结果的影响第37-46页
        3.3.2 TOF的线性模式与反射模式对结果的影响第46-48页
        3.3.3 MALDI正离子与负离子模式对结果的影响第48页
        3.3.4 不同MALDI激光能量对结果的影响第48-51页
    3.4 方法验证第51-55页
        3.4.1 ESI-Orbitrap MS验证第51-53页
        3.4.2 基因测序比对第53-55页
    3.5 实验方法小结第55页
    3.6 胶质瘤样品突变检测结果第55-61页
        3.6.1 样本信息统计第55-56页
        3.6.2 胶质瘤样本分类与突变信息统计第56-59页
        3.6.3 基因测序结果与比对第59-60页
        3.6.4 胶质瘤样品IDH基因检测结果小结第60-61页
结论第61-62页
参考文献第62-67页
致谢第67-68页
附录第68-73页

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