| 摘要 | 第3-4页 |
| abstract | 第4-5页 |
| 缩略词表 | 第9-10页 |
| 1 引言 | 第10-20页 |
| 1.1 猪瘟 | 第10-12页 |
| 1.2 猪瘟病毒 | 第12-16页 |
| 1.3 猪瘟病毒的入侵机制和在宿主体内的分布 | 第16-17页 |
| 1.4 猪瘟病毒与宿主细胞的相互作用 | 第17页 |
| 1.5 猪瘟兔化弱毒株与猪瘟病毒石门株的差异 | 第17-18页 |
| 1.6 利用RNA-seq技术研究病毒和宿主相互作用 | 第18-20页 |
| 2 研究一 C株和Shimen株在家兔脾脏内的增殖 | 第20-25页 |
| 2.1 材料 | 第20页 |
| 2.1.1 毒株和实验动物 | 第20页 |
| 2.1.2 主要试剂及仪器 | 第20页 |
| 2.2 方法 | 第20-22页 |
| 2.2.1 病毒感染滴度测定 | 第20-21页 |
| 2.2.2 接种家兔 | 第21页 |
| 2.2.3 总RNA的提取与反转录 | 第21页 |
| 2.2.4 引物设计合成与PCR检测 | 第21-22页 |
| 2.3 结果与分析 | 第22-24页 |
| 2.3.1 TCID50测定结果 | 第22页 |
| 2.3.2 体温测定结果 | 第22-23页 |
| 2.3.3 总RNA的提取结果 | 第23页 |
| 2.3.4 PCR检测结果 | 第23-24页 |
| 2.4 讨论 | 第24页 |
| 2.5 小结 | 第24-25页 |
| 3 研究二 猪瘟兔化弱毒株和石门株感染家兔脾脏组织的转录组分析 | 第25-52页 |
| 3.1 材料 | 第25-26页 |
| 3.1.1 试验样品 | 第25-26页 |
| 3.1.2 主要试剂及耗材 | 第26页 |
| 3.1.3 实验仪器 | 第26页 |
| 3.2 方法 | 第26-28页 |
| 3.2.1 cDNA文库的制备及质量检测 | 第26页 |
| 3.2.2 文库测序 | 第26-27页 |
| 3.2.3 测序数据质控 | 第27页 |
| 3.2.4 转录组数据分析 | 第27页 |
| 3.2.5 功能注释及差异基因的筛选及分析 | 第27页 |
| 3.2.6 GO(Gene Ontol ogy)功能显著性富集分析 | 第27页 |
| 3.2.7 KEGG pathway显著性富集分析 | 第27-28页 |
| 3.3 结果与分析 | 第28-48页 |
| 3.3.1 用于建库的样品RNA质量检测 | 第28页 |
| 3.3.2 cDNA文库质检 | 第28-29页 |
| 3.3.3 RNA-seq测序结果与分析 | 第29-30页 |
| 3.3.4 差异表达基因的筛选 | 第30-31页 |
| 3.3.5 共表达差异表达基因分析 | 第31-33页 |
| 3.3.6 差异表达基因GO功能注释及富集分析 | 第33-37页 |
| 3.3.7 差异表达基因KEGG Pathway显著性富集分析 | 第37-41页 |
| 3.3.8 Top10差异表达基因分析 | 第41-48页 |
| 3.4 讨论 | 第48-50页 |
| 3.5 小结 | 第50-52页 |
| 4 结论 | 第52-53页 |
| 致谢 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-62页 |
| 作者简介 | 第62页 |
