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乳腺癌中表观遗传学相关核酸的分析方法研究

中文摘要第9-11页
英文摘要第11-13页
本文的主要创新点第14-15页
第一章 绪论第15-45页
    §1.1 游离DNA的分析检测第15-22页
        1.1.1 血浆中游离DNA的来源和性质第16页
        1.1.2 游离DNA的取材第16页
        1.1.3 游离DNA的提取第16-17页
        1.1.4 血浆中游离DNA在肿瘤诊断中的应用第17-19页
            1.1.4.1 血浆中游离DNA的定量检测第17-18页
            1.1.4.2 血浆中游离DNA完整性分析第18页
            1.1.4.3 血浆中游离DNA癌基因或抑癌基因的突变分析第18页
            1.1.4.4 血浆中游离DNA微卫星分析第18-19页
            1.1.4.5 血浆中游离DNA甲基化异常分析第19页
        1.1.5 血浆中游离DNA检测的基因位点第19-22页
            1.1.5.1 P16~(INK4A)第19页
            1.1.5.2 RASSF1A第19-20页
            1.1.5.3 UHRF1第20-22页
                1.1.5.3.1 UHRF1的生物学功能第20页
                1.1.5.3.2 UHRF1在乳腺癌中的表达第20-22页
    §1.2 DNA甲基化分析第22-30页
        1.2.1 DNA甲基化的概述第22页
        1.2.2 DNA甲基化的生物学功能第22-23页
        1.2.3 DNA甲基化的常用研究方法第23-27页
            1.2.3.1 高效液相色谱柱(HPLC)及相关方法第23-24页
            1.2.3.2 甲基化敏感性限制性内切酶(MS-RE)法第24页
            1.2.3.3 直接测序法第24-25页
            1.2.3.4 甲基化特异性的PCR(MS-PCR)第25页
            1.2.3.5 荧光法(Methylight)第25-26页
            1.2.3.6 微阵列法第26-27页
            1.2.3.7 甲基化新位点定位技术第27页
        1.2.4 纳米技术在甲基化检测中的应用第27-30页
            1.2.4.1 量子点荧光共振能量转移第27-28页
            1.2.4.2 阳离子共轭聚合物(CCP)生物传感器第28-29页
            1.2.4.3 金纳米粒子第29-30页
    §1.3 miRNA的检测技术第30-39页
        1.3.1 miRNA概述第30-31页
        1.3.2 miRNA与肿瘤第31页
        1.3.3 miRNA的传统检测技术第31-34页
            1.3.3.1 Northern杂交分析第31-32页
            1.3.3.2 基于PCR反应的检测技术第32-33页
            1.3.3.3 基因芯片技术第33页
            1.3.3.4 新一代大规模测序技术第33-34页
        1.3.4 新型miRNA检测技术第34-37页
            1.3.4.1 化学生物发光技术第34-35页
            1.3.4.2 电化学技术第35-36页
            1.3.4.3 生物发光共振能量转移技术第36页
            1.3.4.4 滚环扩增(RCA)技术第36-37页
        1.3.5 细胞内的miRNA检测第37-39页
    §1.4 本论文的主要研究工作第39-40页
    参考文献第40-45页
第二章 乳腺癌患者血浆游离DNA中UHRF1基因的临床意义研究第45-63页
    §2.1 引言第45-46页
    §2.2 实验部分第46-53页
        2.2.1 试剂第46-47页
            2.2.1.1 核酸提取和PCR反应试剂第46页
            2.2.1.2 蛋白印记试验相关试剂第46页
            2.2.1.3 DNA引物及探针第46-47页
            2.2.1.4 主要缓冲液第47页
        2.2.2 主要仪器第47页
        2.2.3 标本来源第47页
        2.2.4 标本采集第47页
        2.2.5 方法第47-53页
            2.2.5.1 细胞培养第47-49页
            2.2.5.2 蛋白印记法分析UHRF1在组织中的表达第49-51页
                2.2.5.2.1 蛋白质提取第49-50页
                2.2.5.2.2 蛋白印记分析第50-51页
            2.2.5.3 组织标本RNA提取和cDNA转录第51-52页
            2.2.5.4 血浆标本游离DNA提取第52页
            2.2.5.5 荧光定量PCR检测第52-53页
            2.2.5.6 数据分析第53页
    §2.3 结果与讨论第53-58页
        2.3.1 UHRF1的蛋白印记分析第54页
        2.3.2 血浆总游离DNA的定量分析第54-55页
        2.3.3 UHRF1基因在组织中的表达以及在血浆游离DNA中的定量检测第55-56页
        2.3.4 血浆中UHRF1基因的含量与临床病征的关系第56-58页
    §2.4 讨论第58-60页
    参考文献第60-63页
第三章 超支链滚环扩增比色检测新方法及其在p16/CDKN2启动子甲基化分析的应用第63-75页
    §3.1 引言第63-65页
    §3.2 实验部分第65-67页
        3.2.1 材料和试剂第65页
        3.2.2 仪器第65页
        3.2.3 标本来源和采集第65-66页
        3.2.4 DNA模板的环化第66页
        3.2.5 血浆标本游离DNA提取第66页
        3.2.6 甲基化DNA的检测第66页
        3.2.7 数据分析第66-67页
    §3.3 结果第67-72页
        3.3.1 游离DNA的定量第67页
        3.3.2 检测条件的优化第67页
        3.3.3 HRCA信号增强第67-68页
        3.3.4 甲基化DNA的检测第68-70页
        3.3.5 血浆循环DNA中p16/CDKN2基因启动子的甲基化分析第70页
        3.3.6 血浆中p16/CDKN2基因启动子的甲基化与临床病征的关系第70-72页
    §3.4 讨论第72-73页
    参考文献第73-75页
第四章 壳聚糖/多聚谷氨酸复合物转运量子点标记探针实现细胞内miroRNA前体的原位检测第75-88页
    §4.1 引言第75-77页
    §4.2 实验部分第77-81页
        4.2.1 材料和试剂第77页
        4.2.2 量子点-RNA-金纳米粒子探针的合成第77页
        4.2.3 探针与壳聚糖聚谷氨酸载体的组装及表征第77-78页
        4.2.4 细胞培养第78-79页
        4.2.5 体外验证试验第79页
        4.2.6 细胞株RNA提取第79-80页
        4.2.7 荧光定量PCR检测第80页
        4.2.8 细胞毒性试验第80页
        4.2.9 细胞转染试验第80页
        4.2.10 细胞凋亡试验第80-81页
    §4.3 结果与讨论第81-85页
        4.3.1 CS/γ-PGA探针复合物表征第81页
        4.3.2 荧光定量PCR检测乳腺癌细胞株中micRNA的表达第81-82页
        4.3.3 体外检测验证CS/γ-PGA探针复合物的特异性和敏感性第82-83页
        4.3.4 细胞转染和识别MicroRNA第83-84页
        4.3.5 CS/γ-PGA的细胞毒性第84-85页
    §4.4 结论第85-86页
    参考文献第86-88页
附录第88-89页
致谢第89-90页

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