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海洋细菌来源的新型糖胺聚糖降解酶的筛选、鉴定与应用

中文摘要第13-16页
ABSTRACT第16-18页
符号说明第19-21页
第一章 绪论第21-43页
    1.1 本章引论第21-24页
    1.2 CS/DS/HA糖链降解酶第24-30页
        1.2.1 透明质酸降解酶(Hyaluronidase,HAase)第25-27页
        1.2.2 硫酸软骨素降解酶(Chondroitinase,CSase)第27-29页
        1.2.3 新型糖胺聚糖降解酶第29-30页
        1.2.4 HAase和CSase的命名问题第30页
    1.3 CS/DS硫酸酯酶第30-32页
        1.3.1 外切型硫酸酯酶第31页
        1.3.2 内切型硫酸酯酶第31-32页
        1.3.3 硫酸酯酶的作用第32页
    1.4 选题意义第32-33页
    1.5 论文结构第33页
    参考文献第33-43页
第二章 海洋来源糖胺聚糖降解菌的筛选、鉴定及基因组DNA序列分析第43-54页
    2.1 材料与试剂第43-44页
        2.1.1 材料第43页
        2.1.2 试剂第43页
        2.1.3 人工海水培养基的配制第43-44页
    2.2 实验方法第44-48页
        2.2.1 糖胺聚糖降解菌的筛选第44页
        2.2.2 降解菌的多糖利用能力分析第44-45页
        2.2.3 糖胺聚糖降解菌的分子鉴定第45-46页
        2.2.4 降解菌胞外粗酶的制备第46页
        2.2.5 胞外粗酶降解多糖的作用分析第46-47页
        2.2.6 降解菌的基因组DNA制备第47-48页
        2.2.7 降解菌的全基因组DNA测序与分析第48页
    2.3 结果与分析第48-52页
        2.3.1 降解菌的多糖利用能力第48-49页
        2.3.2 FC509菌株的鉴定第49-50页
        2.3.3 FC509胞外粗酶的多糖降解活性第50-51页
        2.3.4 降解菌的全基因组测序与分析第51-52页
    2.4 本章小结第52页
    参考文献第52-54页
第三章 新型糖胺聚糖降解酶的表达与纯化第54-65页
    3.1 材料与试剂第54页
        3.1.1 材料第54页
        3.1.2 试剂第54页
    3.2 实验方法第54-57页
        3.2.1 糖胺聚糖降解酶基因的序列分析第54-55页
        3.2.2 糖胺聚糖降解酶基因异源表达载体的构建第55页
        3.2.3 糖胺聚糖降解酶的异源表达及表达条件的优化第55-56页
        3.2.4 重组蛋白的表达与纯化第56-57页
    3.3 结果与分析第57-63页
        3.3.1 糖胺聚糖降解酶基因及蛋白分析第57-60页
        3.3.2 糖胺聚糖降解酶的异源表达与纯化第60-63页
    3.4 本章小结第63页
    参考文献第63-65页
第四章 新型内切型糖胺聚糖裂解酶HCLASE的鉴定第65-86页
    4.1 材料与试剂第65页
        4.1.1 材料第65页
        4.1.2 试剂第65页
    4.2 实验方法第65-71页
        4.2.1 糖胺聚糖裂解酶HCLase底物专一性分析第65-66页
        4.2.2 重组蛋白最适反应条件分析第66-67页
        4.2.3 重组蛋白HCLase的酶活测定第67页
        4.2.4 裂解酶HCLase底物降解模式第67-68页
        4.2.5 裂解酶HCLase最终产物的质谱分析第68-69页
        4.2.6 糖胺聚糖聚合度均一性寡糖制备第69页
        4.2.7 HCLase抗性四糖的收集及测序第69-70页
        4.2.8 荧光标记对HCLase降解的影响第70-71页
        4.2.9 HCLase活性位点分析第71页
    4.3 结果与分析第71-81页
        4.3.1 重组酶的底物特异性分析第71页
        4.3.2 最适反应特性分析第71-74页
        4.3.3 HCLase的多糖降解特性第74-75页
        4.3.4 最终产物分析第75-77页
        4.3.5 HCLase抗性四糖结构测定第77-79页
        4.3.6 荧光标记对HCLase活性的影响分析第79-80页
        4.3.7 HCLase活性位点分析第80-81页
    4.4 本章小结第81-82页
    参考文献第82-86页
第五章 新型外切型糖胺聚糖裂解酶HCDLASE的鉴定第86-103页
    5.1 材料与试剂第86页
        5.1.1 材料第86页
        5.1.2 试剂第86页
    5.2 实验方法第86-91页
        5.2.1 重组蛋白HCDLase底物专一性分析第86-87页
        5.2.2 裂解酶HCDLase最适反应条件分析第87-88页
        5.2.3 裂解酶HCDLase的酶活测定第88页
        5.2.4 外切酶活性鉴定第88-89页
        5.2.5 最终产物的质谱分析第89页
        5.2.6 结构均一的CS四糖以及六糖制备第89-90页
        5.2.7 荧光标记的影响第90页
        5.2.8 外切型糖胺聚糖裂解酶HCDLase的切割方向分析第90-91页
        5.2.9 HCDLase降解荧光标记CS四糖分析第91页
    5.3 结果与分析第91-102页
        5.3.1 HCDLase底物特异性分析特性第91-92页
        5.3.2 最适反应特性分析第92-94页
        5.3.3 裂解酶HCDLase的多糖降解特性第94-95页
        5.3.4 裂解酶的最终产物分析第95-97页
        5.3.5 结构均一的糖胺聚糖四糖和六糖的制备和测序第97-98页
        5.3.6 荧光标记的影响第98-99页
        5.3.7 外切型糖胺聚糖裂解酶的切割方向分析第99-100页
        5.3.8 HCDLase降解荧光标记CS四糖分析第100-102页
    5.4 本章小结第102页
    参考文献第102-103页
第六章 新型内切型糖胺聚糖硫酸酯酶的酶学性质分析第103-117页
    6.1 材料与试剂第103页
        6.1.1 材料第103页
        6.1.2 试剂第103页
    6.2 实验方法第103-107页
        6.2.1 重组蛋白底物专一性分析第103-104页
        6.2.2 最适反应条件分析第104-105页
        6.2.3 重组蛋白4-O-Endosulfatase的多糖降解特征第105-107页
        6.2.4 重组蛋白的酶活测定第107页
    6.3 结果与分析第107-114页
        6.3.1 底物特异性分析特性第108-109页
        6.3.2 最适反应特性分析第109-111页
        6.3.3 硫酸酯酶4-O-Endosulfatase多糖降解特性第111-114页
    6.4 本章小结第114-115页
    参考文献第115-117页
第七章 新型糖胺聚糖工具酶的应用及相互作用第117-128页
    7.1 材料与试剂第117页
        7.1.1 材料第117页
        7.1.2 试剂第117页
    7.2 实验方法第117-121页
        7.2.1 高正电荷绿色荧光蛋白的表达纯化第117-118页
        7.2.2 内切型4-O-Endosulfatase对糖胺聚糖与蛋白结合作用的影响第118页
        7.2.3 HCDLase在CS六糖及八糖测序中的应用第118-120页
        7.2.5 内切型4-O-Endosulfatase与HCLase的协同作用分析第120-121页
    7.3 结果与分析第121-126页
        7.3.1 高正电荷绿色荧光蛋白的表达纯化第121-122页
        7.3.2 新型4-O-Endosulfatase对于糖胺聚糖与蛋白结合作用的影响第122-123页
        7.3.3 HCDLase在CS六糖及八糖测序中的应用第123-126页
        7.3.4 内切型4-O-Endosulfatase与HCLase的协同作用分析第126页
    7.4 本章小结第126-127页
    参考文献第127-128页
第八章 全文总结与展望第128-131页
    8.1 主要结果与意义第128-129页
    8.2 本论文的创新点第129-130页
    8.3 展望第130-131页
致谢第131-132页
攻读博士学位期间参与的项目第132-133页
获奖情况第133-134页
发表论文第134-135页
国家发明专利第135-136页
学位论文评阅及答辩情况表第136页

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