基于高通量Illumina测序技术的干旱胁迫下大豆根和叶mRNA表达谱研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 第一章 前言 | 第8-19页 |
| ·干旱对植物的影响 | 第8-9页 |
| ·作物耐旱机理 | 第9-11页 |
| ·耐旱相关基因的研究进展 | 第11-14页 |
| ·测序技术的研究进展 | 第14-17页 |
| ·实验目的和意义 | 第17-19页 |
| 第二章 材料与方法 | 第19-24页 |
| ·实验材料 | 第19-20页 |
| ·植物材料 | 第19页 |
| ·数据材料 | 第19页 |
| ·酶及生化试剂 | 第19页 |
| ·PCR引物 | 第19-20页 |
| ·实验方法 | 第20-24页 |
| ·PEG处理大豆和取样 | 第20页 |
| ·测序和基本数据处理及生物信息分析 | 第20-21页 |
| ·测序结果报告的数据分析 | 第21-22页 |
| ·Real-time PCR验证分析 | 第22-24页 |
| 第三章 结果与分析 | 第24-42页 |
| ·材料确定和干旱处理条件摸索 | 第24-25页 |
| ·测序质量评估 | 第25-29页 |
| ·测序质量 | 第25-26页 |
| ·clean tag拷贝数分布 | 第26-27页 |
| ·clean tag比对 | 第27-29页 |
| ·差异表达基因分析 | 第29-39页 |
| ·干旱胁迫下根和叶差异表达基因 | 第29-30页 |
| ·干旱处理组和对照组信号强度 | 第30-31页 |
| ·差异表达基因的主要生物学功能 | 第31-36页 |
| ·差异基因表达模式聚类分析 | 第36-38页 |
| ·Pathway分析 | 第38-39页 |
| ·Real-time PCR | 第39-42页 |
| ·总RNA的提取 | 第39-40页 |
| ·样品的重复性和灵敏度 | 第40-41页 |
| ·实时荧光定量PCR验证分析 | 第41-42页 |
| 第四章 讨论 | 第42-46页 |
| ·表达谱成为研究基因工程的工具 | 第42页 |
| ·新一代测序技术在基因差异表达研究中的应用 | 第42-43页 |
| ·干旱胁迫下大豆根和叶差异表达基因分析 | 第43-44页 |
| ·干旱胁迫调控相关基因 | 第44-45页 |
| ·聚类分析在干旱胁迫相关基因表达谱研究中的应用 | 第45-46页 |
| 第五章 结论 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-52页 |
| 附录 | 第52-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 个人简介 | 第57页 |
