天牛科线粒体基因特征与系统发育初步研究
| 致谢 | 第1-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| 1 文献综述 | 第10-25页 |
| ·天牛科昆虫概述 | 第10-15页 |
| ·天牛科形态特征与经济意义 | 第10-11页 |
| ·天牛科分类系统 | 第11-12页 |
| ·天牛科起源及系统演化关系 | 第12-15页 |
| ·分子系统学研究进展 | 第15-25页 |
| ·分子系统学理论基础 | 第15-20页 |
| ·分子系统学概述 | 第15-17页 |
| ·分子进化相关理论 | 第17页 |
| ·系统树 | 第17-18页 |
| ·分子系统学与分类学的关系 | 第18-19页 |
| ·分子系统学研究的成就和问题 | 第19-20页 |
| ·线粒体 DNA 组成及结构特征 | 第20-21页 |
| ·分子系统学研究方法 | 第21-25页 |
| ·进化模型及其作用 | 第21-22页 |
| ·距离法 | 第22页 |
| ·简约法 | 第22-23页 |
| ·最大似然法 | 第23页 |
| ·贝叶斯法 | 第23-25页 |
| 2 引言 | 第25-26页 |
| 3 材料与方法 | 第26-33页 |
| ·研究材料 | 第26-29页 |
| ·标本采集与保存 | 第26-28页 |
| ·主要试剂 | 第28页 |
| ·仪器设备 | 第28-29页 |
| ·研究方法 | 第29-33页 |
| ·基因组 DNA 的提取、检测与保存 | 第29页 |
| ·PCR 扩增、检测与测序 | 第29-31页 |
| ·引物选取与合成 | 第29-30页 |
| ·扩增体系 | 第30页 |
| ·反应程序 | 第30页 |
| ·PCR 产物检测 | 第30页 |
| ·产物回收与测序 | 第30-31页 |
| ·序列处理与分析 | 第31-32页 |
| ·序列检测、比对与格式转换 | 第31页 |
| ·序列组成分析 | 第31页 |
| ·遗传距离分析 | 第31页 |
| ·置换饱和度分析 | 第31-32页 |
| ·分子系统树构建 | 第32-33页 |
| ·外群的选择 | 第32页 |
| ·碱基置换模型选取 | 第32页 |
| ·最大似然法建树 | 第32页 |
| ·贝叶斯推论法建树 | 第32-33页 |
| 4 结果与分析 | 第33-56页 |
| ·基因组 DNA 提取 | 第33-34页 |
| ·PCR 扩增与序列验证 | 第34-36页 |
| ·序列分析 | 第36-41页 |
| ·序列长度及碱基组成 | 第36-37页 |
| ·碱基置换分析 | 第37-38页 |
| ·密码子使用偏向性 | 第38-39页 |
| ·置换饱和度分析 | 第39-41页 |
| ·遗传距离分析 | 第41-44页 |
| ·COI 遗传距离 | 第41页 |
| ·COII 遗传距离 | 第41-42页 |
| ·16SrRNA 遗传距离 | 第42-43页 |
| ·联合序列遗传距离 | 第43-44页 |
| ·分子进化树 | 第44-56页 |
| ·COI 进化树 | 第44-45页 |
| ·COI 最大似然树 | 第44页 |
| ·COI 贝叶斯树 | 第44-45页 |
| ·COII 进化树 | 第45-46页 |
| ·COII 最大似然树 | 第45页 |
| ·COII 贝叶斯树 | 第45-46页 |
| ·16SrRNA 进化树 | 第46页 |
| ·16SrRNA 最大似然树 | 第46页 |
| ·16SrRNA 贝叶斯树 | 第46页 |
| ·联合序列进化树 | 第46-56页 |
| ·联合序列最大似然树 | 第46-47页 |
| ·联合序列贝叶斯树 | 第47-56页 |
| 5 结论与讨论 | 第56-60页 |
| ·结论 | 第56-58页 |
| ·讨论 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-65页 |
| Abstract | 第65-66页 |
