| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-17页 |
| 1 基因芯片的概念原理及分类 | 第9-10页 |
| ·基因芯片的分类 | 第9-10页 |
| 2 基因芯片技术流程 | 第10-13页 |
| ·支持物的制备 | 第10页 |
| ·探针的制备 | 第10页 |
| ·基因芯片制备技术 | 第10-12页 |
| ·点接触法 | 第11页 |
| ·喷墨法 | 第11页 |
| ·分子印章法 | 第11页 |
| ·光刻 DNA 合成法 | 第11-12页 |
| ·点样后处理 | 第12页 |
| ·样品的制备 | 第12页 |
| ·芯片的杂交 | 第12页 |
| ·杂交后的检测与分析 | 第12-13页 |
| 3 基因芯片在水产研究中的应用 | 第13-16页 |
| ·基因测序 | 第14页 |
| ·基因表达分析 | 第14页 |
| ·发现新的功能基因 | 第14-15页 |
| ·基因多态性检测 | 第15页 |
| ·水产病害的检测 | 第15页 |
| ·基因芯片在水产动物育种中的开发和应用 | 第15-16页 |
| 4 存在的问题及展望 | 第16-17页 |
| 第二章 鲤鱼免疫相关功能基因的获取和注释 | 第17-27页 |
| 1.研究背景 | 第17-18页 |
| 2 实验材料与方法 | 第18-19页 |
| ·实验材料 | 第18页 |
| ·实验方法 | 第18-19页 |
| 3 实验结果 | 第19-25页 |
| ·EST 序列 GO 注释分类 | 第19-20页 |
| ·经过 GO 注释获取的 EST 序列 | 第20-24页 |
| ·已知核酸序列的获取 | 第24-25页 |
| 4 讨论 | 第25-27页 |
| 第三章 鲤鱼免疫相关基因芯片的制备，制备条件的优化及初步应用 | 第27-49页 |
| 1.研究背景 | 第27-28页 |
| 2.实验材料与方 | 第28-36页 |
| ·实验材料 | 第28-30页 |
| ·主要仪器设备 | 第28页 |
| ·分子生物学试剂 | 第28-29页 |
| ·实验室常用试剂的配置 | 第29-30页 |
| ·引物、内参基因及待测样品 | 第30页 |
| ·探针的制备 | 第30-32页 |
| ·DNA 的提取方法 | 第31页 |
| ·Axygen PCR 纯化试剂盒纯化步骤（离心法） | 第31-32页 |
| ·矩阵的设计 | 第32页 |
| ·基因芯片的制备 | 第32-34页 |
| ·点样步骤 | 第32-33页 |
| ·芯片的封闭 | 第33-34页 |
| ·杂交 | 第34-36页 |
| ·靶物的制备 | 第34-36页 |
| ·RNA 提取 | 第34-35页 |
| ·靶物的标记 | 第35-36页 |
| ·杂交 | 第36页 |
| ·镜鲤在未染病鱼和染病鱼差异表达免疫相关基因筛选 | 第36页 |
| ·标记、杂交 | 第36页 |
| ·扫描 | 第36页 |
| ·数据分析 | 第36页 |
| 3 实验结果 | 第36-48页 |
| ·引物的筛选及扩增条件的优化 | 第36-45页 |
| ·基因芯片的制备和条件的优化 | 第45-46页 |
| ·基因芯片的制备 | 第45页 |
| ·探针的制备 | 第45页 |
| ·点样条件 | 第45页 |
| ·杂交 | 第45-46页 |
| ·杂交条件 | 第45-46页 |
| ·镜鲤在未染病鱼和染病鱼差异表达免疫相关基因筛选 | 第46-48页 |
| ·总 RNA 的提取 | 第46页 |
| ·扫描结果 | 第46-47页 |
| ·数据分析 | 第47-48页 |
| 4.讨论 | 第48-49页 |
| 小结 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-55页 |
| 主要试剂和配制 | 第55-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第58页 |