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短波长光质诱导津田芜菁花青素合成相关基因差异表达机制研究

摘要第1-6页
Abstract第6-16页
1 绪论第16-31页
   ·引言第16页
   ·光受体及光信号转导研究进展第16-22页
     ·光敏色素受体及其介导的红光、远红光信号转导第17-18页
     ·隐花色素受体及其介导的蓝光/UV-A信号转导第18-19页
     ·趋光素受体及其介导的蓝光信号转导第19-20页
     ·Zeitlupe类受体及其介导的蓝光信号转导第20-21页
     ·UV-B受体及其介导的UV-B光信号转导第21-22页
   ·植物花青素合成及调控的研究进展第22-26页
     ·植物花青素合成途径相关结构基因第23-24页
     ·植物花青素合成途径相关调节基因第24-26页
   ·基于下一代高通量测序技术的转录组学分析第26-29页
     ·传统转录组学研究进展第27页
     ·下一代高通量测序技术研究进展第27-29页
     ·转录组学测序技术(RNA-Seq)研究进展第29页
   ·研究的目的及意义第29-31页
第二章 不同短波长光质诱导津田芜菁花青素合成特性分析第31-37页
   ·引言第31页
   ·材料与方法第31-33页
     ·试验材料第31页
     ·试验光源第31页
     ·试验试剂及仪器第31-32页
     ·试验方法第32-33页
   ·结果与分析第33-35页
     ·不同短波长光质诱导津田芜菁幼苗的花青素合成特性分析第33-34页
     ·短波长光照诱导津田芜菁膨大的肉质根表皮花青素合成分析第34-35页
   ·讨论第35-36页
   ·本章小结第36-37页
第三章 不同短波长光质诱导津田芜菁CHS家族基因表达特性分析第37-59页
   ·引言第37页
   ·材料与方法第37-47页
     ·试验材料第37页
     ·试验光源第37页
     ·试验试剂及仪器第37-38页
     ·试验方法第38-47页
   ·结果与分析第47-57页
     ·津田芜菁BrCHS家族基因Southern杂交分析第47页
     ·津田芜菁BrCHS5和BrCHS6基因全长克隆及序列分析第47-51页
     ·津田芜菁BrCHS家族基因生物信息学分析第51-53页
     ·不同短波长光质诱导津田芜菁幼苗下胚轴不同部位BrCHS家族基因表达特性分析第53-54页
     ·不同时长的不同短波长光质诱导津田芜菁幼苗下胚轴不同部位BrCHS5和BrDFR基因表达特性分析第54-55页
     ·不同强度UV-A诱导津田芜菁幼苗下胚轴不同部位BrCHS5基因表达特性分析第55-56页
     ·不同短波长光质诱导成熟津田肉质根表皮BrCHS和BrDFR基因表达特性分析第56-57页
   ·讨论第57-58页
   ·本章小结第58-59页
第四章 不同短波长光质诱导津田芜菁花青素合成相关调节基因表达特性分析第59-77页
   ·引言第59-60页
   ·材料与方法第60-61页
     ·试验材料第60页
     ·试验光源第60页
     ·试验试剂及仪器第60页
     ·试验方法第60-61页
   ·结果与分析第61-75页
     ·津田芜菁R2R3类MYB基因的全长克隆第61-71页
     ·津田芜菁R2R3类MYB基因序列生物信息学分析第71-73页
     ·不同短波长光质诱导津田芜菁幼苗下胚轴不同部位色素合成相关调节基因表达特性分析第73-75页
     ·不同短波长光质诱导成熟津田芜菁肉质根表皮色素合成相关调节基因表达特性分析第75页
   ·讨论第75-76页
   ·本章小结第76-77页
第五章 津田芜菁BrPAP1和BrTT8蛋白与BrCHS启动子区Unit1元件相互作用分析第77-85页
   ·引言第77页
   ·材料与方法第77-80页
     ·试验材料第77-78页
     ·试验试剂及仪器第78页
     ·试验方法第78-80页
   ·结果与分析第80-83页
     ·津田芜菁BrCHS4、BrCHS5基因启动子区的克隆第80-81页
     ·津田芜菁BrCHS1,4,5基因启动子区生物信息学分析第81-83页
     ·酵母单杂交验证津田芜菁BrPAP1和BrTT8蛋白与BrCHS启动子区Unit1元件相互作用分析第83页
   ·讨论第83-84页
   ·本章小结第84-85页
第六章 基于RNA-Seq技术的津田芜菁不同光环境下转录组学分析第85-105页
   ·引言第85页
   ·材料与方法第85-91页
     ·试验材料第85页
     ·试验光源第85页
     ·试验试剂及仪器第85-86页
     ·试验方法第86-91页
   ·结果与分析第91-102页
     ·总RNA质检分析第91-92页
     ·文库构建及质检分析第92-93页
     ·测序及质控分析第93-94页
     ·测序结果统计分析第94-95页
     ·测序数据预处理第95页
     ·基于de Bruijn graphs法的De novo组装及下游分析第95-102页
   ·讨论第102-104页
   ·本章小结第104-105页
结论第105-106页
论文创新点第106-107页
参考文献第107-124页
附录第124-139页
攻读学位期间发表的学术论文第139-140页
致谢第140-141页

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