| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 目录 | 第8-10页 |
| 插图索引 | 第10-11页 |
| 附表索引 | 第11-12页 |
| 第1章 绪论 | 第12-20页 |
| ·项目来源 | 第12页 |
| ·研究背景和意义 | 第12-13页 |
| ·国内外研究现状与发展趋势 | 第13-17页 |
| ·生物信息处理 | 第13-15页 |
| ·生物序列比对的研究概况 | 第15-17页 |
| ·本文的工作 | 第17-18页 |
| ·本文结构 | 第18-20页 |
| 第2章 生物序列比对基础 | 第20-31页 |
| ·序列比对的相关概念 | 第20-27页 |
| ·序列比对描述 | 第20-21页 |
| ·空位罚分和替换矩阵 | 第21-24页 |
| ·目标函数 | 第24-26页 |
| ·多序列比对的评判标准 | 第26-27页 |
| ·序列比对的算法介绍 | 第27-30页 |
| ·双序列比对算法 | 第27-28页 |
| ·多序列比对算法 | 第28-30页 |
| ·小结 | 第30-31页 |
| 第3章 多种群遗传算法在多序列比对中的应用 | 第31-44页 |
| ·遗传算法 | 第31-34页 |
| ·遗传算法概述 | 第31-32页 |
| ·遗传算法原理及流程 | 第32-34页 |
| ·多种群遗传算法在多序列比对中的应用 | 第34-43页 |
| ·编码方法 | 第34页 |
| ·遗传算子 | 第34-35页 |
| ·选择算子 | 第35-36页 |
| ·迁移算子 | 第36页 |
| ·算法描述 | 第36-38页 |
| ·测试结果及分析 | 第38-43页 |
| ·小结 | 第43-44页 |
| 第4章 基于罚函数的小生境遗传算法的多序列比对 | 第44-54页 |
| ·引言 | 第44页 |
| ·小生境技术 | 第44-45页 |
| ·基于罚函数的排挤小生境遗传算法在多序列比对中的应用 | 第45-48页 |
| ·实验结果分析 | 第48-53页 |
| ·小结 | 第53-54页 |
| 结论 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 附录A 攻读学位期间所发表的学术论文目录 | 第62页 |