禽呼肠孤病毒基因组序列模体特征分析
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-16页 |
| ·研究课题的背景和意义 | 第10-12页 |
| ·国内外研究现状和进展 | 第12-13页 |
| ·本文使用的蛋白质数据库和模体搜索工具 | 第13-15页 |
| ·NCBI数据库 | 第13-14页 |
| ·蛋白质PROSITE数据库 | 第14页 |
| ·模体搜索工具 | 第14-15页 |
| ·论文结构安排 | 第15-16页 |
| 第二章 禽呼肠孤病毒数据集的建立 | 第16-23页 |
| ·禽呼肠孤病毒概述 | 第16页 |
| ·建立禽呼肠孤病毒数据集 | 第16-22页 |
| ·建立禽呼肠孤病毒大基因组数据集 | 第17-18页 |
| ·建立禽呼肠孤病毒中基因组数据集 | 第18-19页 |
| ·建立禽呼肠孤病毒小基因组数据集 | 第19-22页 |
| ·数据集序列相似性比对分析 | 第22-23页 |
| 第三章 禽呼肠孤病毒模体特征分析 | 第23-35页 |
| ·从MEME中提取序列模体 | 第23-26页 |
| ·小基因组模体的提取 | 第23-25页 |
| ·中基因组模体的提取 | 第25页 |
| ·大基因组模体的提取 | 第25-26页 |
| ·从PROSITE中提取序列模体 | 第26-30页 |
| ·小基因组模体的提取 | 第26-27页 |
| ·中基因组模体的提取 | 第27-28页 |
| ·大基因组模体的提取 | 第28-30页 |
| ·模体频数统计 | 第30-32页 |
| ·模体特征分析 | 第32-33页 |
| ·禽呼肠孤病毒与人呼吸道合胞病毒相关性 | 第33-35页 |
| 第四章 总结与展望 | 第35-36页 |
| ·全文总结 | 第35页 |
| ·展望 | 第35-36页 |
| 参考文献 | 第36-43页 |
| 附录 | 第43-45页 |
| 致谢 | 第45-46页 |
| 攻读硕士学位期间发表和完成的论文目录 | 第46页 |