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基于GPU的字符串核函数并行实现

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-10页
第一章 绪论第10-16页
   ·研究背景第10-13页
     ·字符串处理的广泛应用第10-12页
     ·GPU简介第12-13页
   ·国内外研究现状第13-14页
   ·论文研究内容第14页
   ·论文的组织结构第14-16页
第二章 GPU架构和CUDA平台简介第16-28页
   ·GPU发展简介第16-17页
   ·GPU通用计算概述第17-19页
     ·传统GPGPU开发第18页
     ·从GPGPU到CUDA第18-19页
   ·CUDA基础第19-27页
     ·CUDA编程模型第19-25页
     ·CUDA架构下的存储系统第25-27页
   ·CPU与GPU的比较第27-28页
第三章 字符串核函数在GPU上的实现第28-53页
   ·字符串核函数定义及其GPU加速的可行性分析第32-36页
     ·字符串核函数定义第32-34页
     ·GPU加速字符串核函数的可行性分析第34-36页
   ·GPU加速字符串核函数的优化策略第36-41页
     ·任务划分和格块设计第37-38页
     ·存储器优化第38-41页
   ·P频谱核函数第41-48页
     ·P频谱核函数CPU实现第42-45页
     ·P频谱核函数GPU加速的难点及实现细节第45-48页
   ·编辑距离核函数和间隔加权子序列核函数第48-53页
     ·编辑距离核函数CPU实现第48-49页
     ·间隔加权子序列核函数CPU实现第49-50页
     ·动态规划核函数GPU加速的难点及实现细节第50-53页
第四章 性能测试第53-56页
第五章 总结和展望第56-57页
参考文献第57-60页
致谢第60-61页
攻读学位期间发表的主要学术论文目录第61-62页
攻读学位期间参与科研项目第62-63页
学位论文评阅及答辩情况表第63页

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