流感病毒多重序列比对数据库构建与重配规律分析
| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-11页 |
| 第一章 流感病毒重配及其挖掘方法研究进展 | 第11-21页 |
| ·流感病毒简介 | 第11-13页 |
| ·流感病毒的分类与命名 | 第11页 |
| ·流感病毒基因组及其病毒颗粒结构 | 第11-12页 |
| ·流感病毒数据库资源介绍 | 第12-13页 |
| ·甲型流感病毒的宿主特异性 | 第13-14页 |
| ·流感病毒重配 | 第14-17页 |
| ·流感病毒基因组片段包裹 | 第14-15页 |
| ·流感大流行与流感病毒自然重配 | 第15-17页 |
| ·流感病毒重配挖掘方法 | 第17-19页 |
| ·多重序列比对 | 第19-21页 |
| 第二章 流感病毒多重序列比对数据库构建 | 第21-28页 |
| ·材料 | 第21页 |
| ·实验数据 | 第21页 |
| ·相关工具与软件 | 第21页 |
| ·方法 | 第21-25页 |
| ·数据采集 | 第21-22页 |
| ·数据分类 | 第22-23页 |
| ·多重序列比对数据库构建 | 第23-24页 |
| ·多重序列比对数据库检索平台搭建 | 第24-25页 |
| ·结果 | 第25-26页 |
| ·多重序列比对数据库检索平台 | 第25页 |
| ·自动更新模块 | 第25-26页 |
| ·讨论 | 第26页 |
| ·小结 | 第26-28页 |
| 第三章 H3N2 亚型流感病毒重配速率分析 | 第28-36页 |
| ·材料 | 第28-29页 |
| ·实验数据 | 第28页 |
| ·相关工具与软件 | 第28-29页 |
| ·方法 | 第29-33页 |
| ·数据采集 | 第29-30页 |
| ·系统发育树构建及相关参数评估 | 第30页 |
| ·重配频率估计 | 第30-33页 |
| ·结果 | 第33-34页 |
| ·重配频数与 NJ 树差异呈线性关系 | 第33-34页 |
| ·H3N2 流感病毒无重配偏好性 | 第34页 |
| ·讨论 | 第34-35页 |
| ·H3N2 流感病毒无重配偏好性 | 第34页 |
| ·H3N2 流感病毒具有高水平重配频率 | 第34-35页 |
| ·NJ 构树法具有较高准确性 | 第35页 |
| ·小结 | 第35-36页 |
| 第四章 两种重配群划分方法的研究 | 第36-45页 |
| ·材料 | 第36页 |
| ·相关工具与软件 | 第36页 |
| ·方法 | 第36-41页 |
| ·相关标记介绍 | 第36-37页 |
| ·重配群聚类介绍 | 第37-39页 |
| ·重配群随机划分介绍 | 第39-41页 |
| ·结果 | 第41-42页 |
| ·重配群聚类分析 | 第41页 |
| ·重配群随机划分分析 | 第41-42页 |
| ·讨论 | 第42-44页 |
| ·累积概率与重配距离 | 第42-43页 |
| ·重配群划分算法结果评估 | 第43-44页 |
| ·小结 | 第44-45页 |
| 结论 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-53页 |
| 致谢 | 第53-54页 |
| 作者简介 | 第54页 |
