| 致谢 | 第1-5页 |
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 第一章 VibB、VibD以及两者的相互作用在霍乱弧菌铁载体合成中发挥作用的研究概述 | 第9-19页 |
| 第一节 引言 | 第9-10页 |
| 第二节 铁载体(Siderophores)结构和功能的研究进展 | 第10-12页 |
| 一、铁载体(Siderophores)的定义 | 第10页 |
| 二、铁载体(Siderophores)的结构和类型 | 第10-11页 |
| 三、铁载体(Siderophores)获取铁的途径多样性 | 第11-12页 |
| 第三节 霍乱弧菌铁载体合成蛋白分子水平的鉴定和表征 | 第12-17页 |
| 一、vibB、vibD基因的分离鉴定 | 第12-13页 |
| 二、VibB蛋白家族的特征 | 第13-15页 |
| 三、VibD编码一个磷酸泛酰巯基转移酶 | 第15页 |
| 四、VibD对VibB蛋白的修饰机制 | 第15-17页 |
| 第四节 霍乱弧菌铁载体的合成机制 | 第17-19页 |
| 第二章 VibB以及VibB-VibD复合物的表达、纯化和结晶 | 第19-51页 |
| 第一节 引言 | 第19-20页 |
| 第二节 VibB以及VibB-VibD的基因克隆、表达和纯化 | 第20-46页 |
| 一、实验材料 | 第20页 |
| 二、实验方法 | 第20-24页 |
| 三、实验的结果和讨论 | 第24-46页 |
| 第三节 VibB以及VibB-VibD复合物的结晶筛选和晶体优化 | 第46-51页 |
| 一、结晶筛选和晶体优化的基本原理 | 第46-47页 |
| 二、晶体筛选和优化的结果 | 第47-51页 |
| 第三章 VibB晶体结构的解析 | 第51-64页 |
| 第一节 衍射数据的收集与处理 | 第51-58页 |
| 一、X射线衍射的基本原理 | 第51-53页 |
| 二、衍射数据收集 | 第53-54页 |
| 二、衍射数据处理的实施过程和结果 | 第54-58页 |
| 第二节 相角的求解 | 第58-61页 |
| 一、相角(phase)问题简介 | 第58页 |
| 二、分子置换法的基本原理 | 第58-60页 |
| 三、分子置换法的实施过程和结果 | 第60-61页 |
| 第三节 结构的修正 | 第61-64页 |
| 一、结构修正的原理 | 第61-62页 |
| 二、结构修正的实施过程和结果 | 第62-64页 |
| 第四章 VibB活性中心的催化机制以及VibB与VibD的相互作用分析 | 第64-79页 |
| 第一节 实验的理论技术和方法 | 第64-69页 |
| 一、突变体的克隆、纯化和表达 | 第64-65页 |
| 二、VibB突变体的酶活测定 | 第65-66页 |
| 三、最适pH值曲线的测定 | 第66页 |
| 四、基因敲除(Gene knockout) | 第66-69页 |
| 第二节 VibB活性中心的催化机制 | 第69-75页 |
| 一、VibB ISC结构域的总体特征 | 第69-70页 |
| 二、VibB活性中心的构象 | 第70-72页 |
| 三、VibB活性中心的质子传递机制 | 第72-74页 |
| 四、针对VibB-ISC进行药物设计的可行性测试 | 第74-75页 |
| 第三节 VibD对VibB的磷酸泛酰巯基乙胺化修饰 | 第75-79页 |
| 参考文献 | 第79-83页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第83页 |
