| 中文摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-28页 |
| 1 水稻白叶枯病简介 | 第11页 |
| 2 水稻白叶枯病菌致病性分化 | 第11-14页 |
| ·水稻白叶枯病菌致病性分化研究 | 第11-13页 |
| ·水稻白叶枯病菌群体毒力结构分化和菌株间的互作分析 | 第13-14页 |
| 3 水稻白叶枯病菌遗传多样性分析 | 第14-17页 |
| 4 病原菌分子分类 | 第17页 |
| 5 水稻白叶枯病菌无毒基因研究进展 | 第17-23页 |
| ·无毒基因简介 | 第17-21页 |
| ·水稻白叶枯病原菌无毒基因avrXa3,avrxa5,avrXa7和avrXa10的研究概况 | 第21-22页 |
| ·白叶枯病原菌无毒基因avrXa21的研究概况 | 第22-23页 |
| 6 Xanthomonas基因组研究 | 第23-26页 |
| ·Xanthomonas oryzae pv.oryzae MAFF311018的基因组序列分析 | 第23-25页 |
| ·Xanthomonas oryzae pv.oryzae KACC10331的基因组序列分析 | 第25-26页 |
| ·Xanthomonas oryzae pv.oryzae PX099A的基因组序列分析 | 第26页 |
| 7 研究的目的意义 | 第26-28页 |
| 第二章 水稻白叶枯病菌遗传多样性分析 | 第28-50页 |
| 1 实验材料与方法 | 第29-32页 |
| ·水稻白叶枯病菌 | 第29-31页 |
| ·参试品种 | 第31页 |
| ·方法 | 第31-32页 |
| ·水稻种植和病菌接种鉴定 | 第31页 |
| ·DNA提取 | 第31页 |
| ·PCR反应条件 | 第31-32页 |
| ·数据分析 | 第32页 |
| 2 结果与分析 | 第32-48页 |
| ·IS-PCR和Rep-PCR谱型分析 | 第32-40页 |
| ·中国、日本和菲律宾水稻白叶枯病菌群体的IS-PCR和Rep-PCR谱型分析 | 第32-37页 |
| ·中国、日本和菲律宾水稻白叶枯病菌母株和单细胞系的IS-PCR和Rep-PCR谱型分析 | 第37-38页 |
| ·中国、日本和菲律宾水稻白叶枯病菌代表菌株的IS-PCR和Rep-PCR谱型分析 | 第38-40页 |
| ·UPGMA聚类分析 | 第40-45页 |
| ·中国、日本和菲律宾水稻白叶枯病菌群体PCR扩增结果的UPGMA聚类分析 | 第40-42页 |
| ·中国、日本和菲律宾水稻白叶枯病菌母株和单细胞系PCR扩增结果的UPGMA聚类分析 | 第42-44页 |
| ·中国、日本和菲律宾水稻白叶枯病菌代表菌株PCR扩增结果的UPGMA聚类分析 | 第44-45页 |
| ·病原型分析与分子分析的关系比较 | 第45-48页 |
| ·中国、日本和菲律宾水稻白叶枯病菌母株和单细胞系的病原型分析与分子分析的关系比较 | 第45-47页 |
| ·中国、日本和菲律宾水稻白叶枯病菌代表菌株的病原型分析与分子分析的关系比较 | 第47-48页 |
| 3 讨论 | 第48-50页 |
| ·中国、日本和菲律宾水稻白叶枯病菌分子检测结果比较 | 第48-49页 |
| ·中国、日本和菲律宾水稻白叶枯病菌群体分子检测结果比较 | 第48-49页 |
| ·中国、日本和菲律宾水稻白叶枯病菌母株和单细胞系分子检测结果比较 | 第49页 |
| ·中国、日本和菲律宾水稻白叶枯病菌病原型检测结果与分子检测结果比较 | 第49-50页 |
| 第三章 水稻白叶枯病菌毒力相关片段多样性分析 | 第50-80页 |
| 1 实验材料与方法 | 第50-52页 |
| ·水稻白叶枯病菌 | 第50-51页 |
| ·参试品种和病原菌田间鉴定 | 第51页 |
| ·DNA提取 | 第51页 |
| ·PCR反应条件 | 第51页 |
| ·RFLP反应条件 | 第51-52页 |
| ·数据分析 | 第52页 |
| 2 结果与分析 | 第52-77页 |
| ·毒力相关片段PCR结果分析 | 第52-55页 |
| ·引物HXA-1的PCR谱型分析 | 第52页 |
| ·引物HXA-2的PCR谱型分析 | 第52页 |
| ·引物HXA-9的PCR谱型分析 | 第52-53页 |
| ·引物HXA-14的PCR谱型分析 | 第53页 |
| ·引物HXA-15的PCR谱型分析 | 第53-55页 |
| ·RFLP结果分析 | 第55-61页 |
| ·avrXa10为探针的RFLP结果分析 | 第55-57页 |
| ·avrXa10的中心区域为探针的RFLP结果分析 | 第57页 |
| ·回收片段HXA14-3为探针的RFLP结果分析 | 第57-58页 |
| ·回收片段HXA15-3为探针的RFLP结果分析 | 第58-60页 |
| ·回收片段HXA15-2的RFLP结果分析 | 第60页 |
| ·回收片段HXA15-0.7为探针的RFLP结果分析 | 第60-61页 |
| ·毒力相关片段PCR结果的UPGMA聚类结果分析 | 第61-62页 |
| ·RFLP结果的UPGMA聚类结果分析 | 第62-76页 |
| ·同一探针不同内切酶消化的RFLP结果的UPGMA聚类结果分析 | 第62-71页 |
| ·同一内切酶消化不同探针的RFLP结果的UPGMA聚类结果分析 | 第71-74页 |
| ·6种探针3种内切酶消化的19菌株的RFLP结果的UPGMA综合聚类结果分析 | 第74-76页 |
| ·病原型分析与分子分析的关系比较 | 第76-77页 |
| ·19个菌株的病原型分析与毒力相关片段PCR结果的关系比较 | 第76页 |
| ·19个菌株的病原型分析与RFLP结果的关系比较 | 第76-77页 |
| 3 讨论 | 第77-80页 |
| ·以与病菌毒力相关的引物进行PCR扩增结果的讨论 | 第77-78页 |
| ·RFLP结果讨论 | 第78-79页 |
| ·中国、日本和菲律宾水稻白叶枯病菌病原型检测结果与分子检测结果比较 | 第79-80页 |
| 参考文献 | 第80-92页 |
| 附录 | 第92-95页 |
| 附录1 水稻种植和病菌接种鉴定 | 第92页 |
| 附录2 水稻白叶枯病菌DNA的提取 | 第92页 |
| 附录3 Southern杂交 | 第92-94页 |
| 附录4 在读期间发表的文章 | 第94-95页 |
| 致谢 | 第95页 |
