| 中文摘要 | 第1-10页 |
| 英文摘要 | 第10-13页 |
| 第一部分 文献综述 | 第13-40页 |
| 第一章 常用分子标记的起源、开发方法及应用 | 第13-33页 |
| ·分子标记的性质与特点概述 | 第13-14页 |
| ·常用分子标记的原理及开发方法 | 第14-33页 |
| ·鱼类线粒体基因组(mtDNA)及其分子标记 | 第14-18页 |
| ·随机扩增多态DNA(RAPD)标记 | 第18-19页 |
| ·扩增片段长度多态(AFLP)标记 | 第19-21页 |
| ·序列表达标签(EST) | 第21-23页 |
| ·微卫星(microsatellite)标记 | 第23-33页 |
| ·未知功能的微卫星标记(anonymous microsatellite)的分离 | 第25-29页 |
| ·FIASCO 方法 | 第25-28页 |
| ·TOMMI 方法 | 第28-29页 |
| ·与基因连锁的微卫星标记(genic microsatellite)的分离 | 第29-33页 |
| ·通过数据发掘(Data mining)分离EST-SSR | 第30-31页 |
| ·cDNA 富集方法分离EST-SSR | 第31-33页 |
| 第二章 长江鱼类分子群体遗传分析的现状及展望 | 第33-40页 |
| 第二部分 长江流域几种重要鱼类的分子标记开发 | 第40-75页 |
| 第三章 铜鱼微卫星DNA 标记的开发 | 第40-48页 |
| ·引言 | 第40页 |
| ·材料与方法 | 第40-47页 |
| ·主要仪器设备 | 第40-41页 |
| ·主要试剂 | 第41页 |
| ·实验材料 | 第41页 |
| ·基因组DNA 抽提 | 第41-42页 |
| ·高效感受态细胞的制备 | 第42-43页 |
| ·微卫星富集文库的构建 | 第43-45页 |
| ·重复序列寻找及引物设计 | 第45页 |
| ·多态性微卫星位点筛选及数据分析 | 第45-47页 |
| ·结果及讨论 | 第47-48页 |
| 第四章 圆口铜鱼微卫星 DNA 标记的开发以及不同类型、来源微卫星之间的比较 | 第48-57页 |
| ·引言 | 第48-49页 |
| ·材料与方法 | 第49-51页 |
| ·主要仪器设备 | 第49页 |
| ·主要试剂 | 第49-50页 |
| ·实验材料 | 第50页 |
| ·基因组DNA 抽提 | 第50页 |
| ·微卫星富集文库的构建 | 第50页 |
| ·微卫星跨种扩增 | 第50-51页 |
| ·数据处理 | 第51页 |
| ·实验结果 | 第51-55页 |
| ·从富集文库得到的多态性微卫星标记 | 第51-53页 |
| ·通过跨种扩增得到的多态性微卫星标记 | 第53页 |
| ·Pearson correlations 与t-检验 | 第53-55页 |
| ·讨论 | 第55-57页 |
| 第五章 稀有鮈鲫微卫星DNA 标记的开发 | 第57-64页 |
| ·引言 | 第57-58页 |
| ·材料与方法 | 第58-60页 |
| ·主要仪器设备 | 第58页 |
| ·主要试剂 | 第58页 |
| ·实验材料 | 第58页 |
| ·基因组DNA 抽提 | 第58-59页 |
| ·微卫星富集文库的构建 | 第59页 |
| ·PCR 产物电泳及银染 | 第59页 |
| ·数据处理 | 第59-60页 |
| ·结果及讨论 | 第60-64页 |
| 第六章 鲤鱼EST-SSR标记开发初探 | 第64-67页 |
| ·引言 | 第64页 |
| ·材料与方法 | 第64-65页 |
| ·结果与讨论 | 第65-67页 |
| 第七章 能区分鮈亚科7种鱼的RAPD-SCAR标记的获得 | 第67-75页 |
| ·引言 | 第67页 |
| ·材料与方法 | 第67-71页 |
| ·主要仪器设备 | 第67-68页 |
| ·主要试剂 | 第68页 |
| ·实验材料 | 第68页 |
| ·基因组DNA 抽提 | 第68页 |
| ·实验方法 | 第68-71页 |
| ·RAPD 反应的PCR 扩增、特异片段纯化与克隆 | 第69页 |
| ·特异DNA 片段的PCR 检测 | 第69页 |
| ·微卫星位点的扩增及检测 | 第69-71页 |
| ·结果与讨论 | 第71-75页 |
| 第三部分 长江流域四种重要鱼类的分子群体遗传分析 | 第75-121页 |
| 第八章 长江水系草鱼遗传多样性的微卫星DNA 分析 | 第75-86页 |
| ·引言 | 第75-76页 |
| ·材料与方法 | 第76-78页 |
| ·主要仪器设备 | 第76页 |
| ·主要试剂 | 第76页 |
| ·实验材料 | 第76-77页 |
| ·基因组DNA 抽提 | 第77页 |
| ·微卫星位点筛选 P、CR 扩增及其产物分离 | 第77页 |
| ·PCR 产物测序 | 第77页 |
| ·数据统计分析 | 第77-78页 |
| ·实验结果 | 第78-82页 |
| ·草鱼微卫星位点筛选 | 第78页 |
| ·草鱼微卫星等位基因与位点变异 | 第78-80页 |
| ·哈代-温伯格平衡与群体内遗传变异 | 第80-81页 |
| ·群体间遗传变异 | 第81-82页 |
| ·讨论 | 第82-86页 |
| ·微卫星位点的保守性与变异 | 第82-83页 |
| ·哈代-温伯格平衡与群体内遗传变异 | 第83-85页 |
| ·群体间遗传变异 | 第85-86页 |
| 第九章 洞庭湖、鄱阳湖与长江干流鲤鱼群体遗传多样性研究 | 第86-95页 |
| ·引言 | 第86-87页 |
| ·材料与方法 | 第87-88页 |
| ·实验材料与基因组DNA 抽提 | 第87页 |
| ·微卫星座位筛选 P、CR 扩增及其产物分离 | 第87-88页 |
| ·数据统计分析 | 第88页 |
| ·实验结果 | 第88-90页 |
| ·微卫星多态性与孟德尔遗传 | 第88-89页 |
| ·哈迪-温博格平衡 | 第89页 |
| ·群体内与群体间遗传变异 | 第89-90页 |
| ·讨论 | 第90-95页 |
| ·鲤鱼中微卫星位点多态性 | 第90-92页 |
| ·长江鲤鱼群体间遗传分化 | 第92-93页 |
| ·长江鲤鱼杂合度的变化 | 第93-95页 |
| 第十章 长江水系铜鱼分子群体遗传分析 | 第95-108页 |
| ·引言 | 第95-96页 |
| ·材料与方法 | 第96-98页 |
| ·实验材料 | 第96页 |
| ·基因组DNA 抽提 | 第96-97页 |
| ·微卫星分析及线粒体D-loop测序 | 第97-98页 |
| ·数据分析 | 第98页 |
| ·实验结果 | 第98-106页 |
| ·群体内遗传变异 | 第98-105页 |
| ·群体间遗传变异 | 第105-106页 |
| ·讨论 | 第106-108页 |
| 第十一章 长江水系圆口铜鱼分子群体遗传分析 | 第108-121页 |
| ·引言 | 第108-109页 |
| ·材料与方法 | 第109-111页 |
| ·实验材料 | 第109页 |
| ·基因组DNA 抽提 | 第109页 |
| ·微卫星分析及线粒体D-loop 测序 | 第109-110页 |
| ·数据分析 | 第110-111页 |
| ·实验结果 | 第111-118页 |
| ·群体内遗传变异 | 第111页 |
| ·群体间遗传变异 | 第111-118页 |
| ·讨论 | 第118-121页 |
| 参考文献 | 第121-143页 |
| 在学期间论文发表情况 | 第143-144页 |
| 致谢 | 第144-145页 |
