代谢网络通量和结构分析
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 引言 | 第8-9页 |
| 1 绪论 | 第9-26页 |
| ·代谢组学和代谢途径数据库 | 第9-12页 |
| ·代谢网络的基本性质 | 第12-14页 |
| ·小世界性质 | 第12页 |
| ·无标度性质 | 第12-13页 |
| ·鲁棒性、冗余度 | 第13-14页 |
| ·基于网络的通量分析 | 第14-20页 |
| ·代谢通量分析 | 第14-15页 |
| ·代谢平衡分析 | 第15页 |
| ·代谢平衡分析模型 | 第15-17页 |
| ·代谢平衡分析方法的扩展 | 第17-20页 |
| ·基于网络的路径分析 | 第20-25页 |
| ·基元模式 | 第20-22页 |
| ·极端路径 | 第22-23页 |
| ·基元通量模式与极端路径比较 | 第23-25页 |
| ·小结 | 第25-26页 |
| 2 基于约束方法预测大肠杆菌代谢行为 | 第26-35页 |
| ·代谢流优化解决方法 | 第26-28页 |
| ·基本的代谢平衡分析方法 | 第26页 |
| ·最小代谢调节方法 | 第26-27页 |
| ·标准化的最小代谢调节 | 第27页 |
| ·生长能力和最小代谢调节的结合方法 | 第27-28页 |
| ·大肠杆菌代谢网络构建 | 第28-35页 |
| ·代谢反应方程 | 第29-31页 |
| ·代谢反应网络图 | 第31-32页 |
| ·计算过程 | 第32-33页 |
| ·结果与讨论 | 第33-35页 |
| 3 基元通量模式预测酵母生长现象 | 第35-43页 |
| ·啤酒酵母中心碳代谢网络构建 | 第35-39页 |
| ·结果与分析 | 第39-42页 |
| ·讨论 | 第42-43页 |
| 4 路径重要性与转录水平之间的关系 | 第43-51页 |
| ·路径重要性定义 | 第43-44页 |
| ·网络模型 | 第44-46页 |
| ·EFM计算与分析 | 第46页 |
| ·路径有效性计算与分析 | 第46-51页 |
| 结论和展望 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-60页 |
| 附录A EFM矩阵计算过程 | 第60-66页 |
| 附录B 代谢网络各代谢物缩写以及对应的中英文名称 | 第66-68页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 大连理工大学学位论文版权使用授权书 | 第70页 |
