| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-25页 |
| ·引言 | 第10-14页 |
| ·物理学与生物学之间的联系 | 第10-11页 |
| ·物理学在生物领域中的研究热点 | 第11-14页 |
| ·生物大分子的结构特性 | 第14-17页 |
| ·生物大分子的结构与功能特点 | 第14-16页 |
| ·维持生物大分子稳定结构的相互作用力 | 第16-17页 |
| ·本文的研究背景、主要内容和未来展望 | 第17-24页 |
| ·生物大分子的结构层次 | 第17-19页 |
| ·生物大分子的折叠(Folding) | 第19-21页 |
| ·生物大分子结构的研究现状和未来展望 | 第21-22页 |
| ·本文研究的内容和意义 | 第22-24页 |
| 参考文献 | 第24-25页 |
| 第二章 蛋白质的空间结构和折叠过程 | 第25-101页 |
| ·概述 | 第26-35页 |
| ·蛋白质是重要的功能分子 | 第26页 |
| ·蛋白质的结构层次 | 第26-34页 |
| ·蛋白质的分类 | 第34-35页 |
| ·蛋白质三维结构的模建 | 第35-40页 |
| ·蛋白质二级结构的预测 | 第35-37页 |
| ·蛋白质三级结构的预测 | 第37-40页 |
| ·氨基酸形成紧密接触对的能力研究 | 第40-69页 |
| ·紧密接触对的概念 | 第40-42页 |
| ·粗粒化蛋白质模型——单原子C~α代表氨基酸 | 第42-57页 |
| ·原子历经模型——考虑组成氨基酸的所有原子 | 第57-68页 |
| ·小结 | 第68-69页 |
| ·球状蛋白质结构的统计性质 | 第69-82页 |
| ·不同结构类型的球状蛋白质 | 第69-79页 |
| ·氨基酸在球状蛋白质的紧密接触能力与其疏水性量度之间的关系 | 第79-81页 |
| ·小结 | 第81-82页 |
| ·蛋白质折叠速率的研究 | 第82-98页 |
| ·用原子历经模型对折叠速率的预测 | 第83-89页 |
| ·用神经网络模型对折叠速率的预测 | 第89-97页 |
| ·小结 | 第97-98页 |
| 参考文献 | 第98-101页 |
| 第三章 DNA的结构和序列分析 | 第101-149页 |
| ·概述 | 第102-116页 |
| ·核酸的化学组成 | 第102-104页 |
| ·DNA的结构层次 | 第104-111页 |
| ·DNA分子的复制 | 第111-112页 |
| ·DNA测序和基因工程 | 第112-116页 |
| ·弹性竿模型下超螺旋DNA分子的构象研究 | 第116-125页 |
| ·DNA超螺旋结构的Monte Carlo模拟 | 第116-120页 |
| ·结果和讨论 | 第120-125页 |
| ·小结 | 第125页 |
| ·基于二维行走模型下DNA序列的长程相关性研究 | 第125-140页 |
| ·DNA序列的二维行走模型 | 第126-127页 |
| ·结果和讨论 | 第127-139页 |
| ·小结 | 第139-140页 |
| ·DNA刚性分子链的动力学研究 | 第140-147页 |
| ·理论模型 | 第140-143页 |
| ·结果和讨论 | 第143-146页 |
| ·小结 | 第146-147页 |
| 参考文献 | 第147-149页 |
| 第四章 结冷胶摩擦行为的研究 | 第149-183页 |
| ·概述 | 第150-159页 |
| ·糖的分类和生物学作用 | 第150-154页 |
| ·多糖类的凝胶化及工业运用 | 第154-157页 |
| ·凝胶摩擦行为的研究意义和展望 | 第157-159页 |
| ·凝胶摩擦行为的理论模型 | 第159-167页 |
| ·排斥情形 | 第160-162页 |
| ·吸附情形 | 第162-167页 |
| ·实验材料和方法 | 第167-175页 |
| ·实验材料 | 第167-170页 |
| ·实验方法 | 第170-175页 |
| ·实验结果和讨论 | 第175-181页 |
| ·水环境中结冷胶的摩擦行为 | 第175-178页 |
| ·盐环境中结冷胶的摩擦行为 | 第178-180页 |
| ·小结 | 第180-181页 |
| 参考文献 | 第181-183页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文 | 第183-184页 |
| 致谢 | 第184页 |