| 0 前言 | 第1-9页 |
| 1 绪论 | 第9-15页 |
| ·蛋白质结构与功能研究的背景 | 第9-11页 |
| ·人类基因组计划 | 第9-10页 |
| ·生物信息学 | 第10-11页 |
| ·蛋白质结构与功能预测的意义 | 第11-13页 |
| ·本文的主要工作 | 第13-15页 |
| 2 蛋白质结构与功能预测的若干基本知识 | 第15-22页 |
| ·蛋白质的生物学功能 | 第15-16页 |
| ·蛋白质的结构层次 | 第16-19页 |
| ·维持蛋白质构象的化学键 | 第19-20页 |
| ·蛋白质序列与结构数据库 | 第20-22页 |
| 3 蛋白质结构预测 | 第22-28页 |
| ·蛋白质结构预测的一般流程 | 第22-23页 |
| ·同源模建方法 | 第23-24页 |
| ·折叠识别方法 | 第24-25页 |
| ·从头预测方法 | 第25-27页 |
| ·蛋白质结构预测模型 | 第25-27页 |
| ·全局优化方法 | 第27页 |
| ·CASP简介 | 第27-28页 |
| 4 蛋白质结构预测的优化模型 | 第28-36页 |
| ·蛋白质结构预测模型概述 | 第28-29页 |
| ·联合残基力场模型 | 第29-31页 |
| ·蛋白质结构预测的九个优化模型 | 第31-36页 |
| 5 模拟退火算法的改进及其在蛋白质结构预测中的应用 | 第36-53页 |
| ·模拟退火算法 | 第36-38页 |
| ·改进的模拟退火算法 | 第38-40页 |
| ·数值试验 | 第40-42页 |
| ·改进的模拟退火算法在蛋白质结构预测上的应用 | 第42-48页 |
| ·在Lennard-Jones簇问题上的应用 | 第42-47页 |
| ·蛋白质结构预测及结果分析 | 第47-48页 |
| ·对本文算法的讨论 | 第48-49页 |
| ·改进的模拟退火算法的收敛性分析 | 第49-53页 |
| 6 蛋白质功能研究 | 第53-59页 |
| ·基于序列的蛋白质功能预测 | 第53-55页 |
| ·基于两序列相似性分析的蛋白质功能预测 | 第53-54页 |
| ·基于多序列迭代的的蛋白质功能预测 | 第54-55页 |
| ·中介序列检索 | 第54-55页 |
| ·序列谱检索方法 | 第55页 |
| ·非同源方法预测蛋白质功能 | 第55-57页 |
| ·功能域融合方法 | 第56页 |
| ·系统进化谱分析方法 | 第56-57页 |
| ·表达簇分析方法 | 第57页 |
| ·基于结构分析的蛋白质功能预测 | 第57-58页 |
| ·综合的功能预测方法 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-63页 |
| 附录 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64-66页 |