中文摘要 | 第1-12页 |
英文摘要 | 第12-15页 |
第一章 文献综述 | 第15-30页 |
1.1 大规模EST测序战略 | 第15-22页 |
1.1.1 大规模EST测序战略的提出 | 第15页 |
1.1.2 cDNA文库的构建 | 第15-19页 |
1.1.3 EST测序及分析 | 第19-20页 |
1.1.4 EST的应用 | 第20-22页 |
1.2 基因表达谱 | 第22-27页 |
1.2.1 基因表达谱概念的提出 | 第22-23页 |
1.2.2 基因表达谱的编制 | 第23-24页 |
1.2.3 比较基因表达谱 | 第24-25页 |
1.2.4 基因表达谱比较研究的应用 | 第25-27页 |
1.3 家蚕EST计划 | 第27页 |
1.4 家蚕脂肪体的研究 | 第27-30页 |
第二章 引言 | 第30-32页 |
2.1 研究的目的和意义 | 第30页 |
2.2 研究的主要内容 | 第30-31页 |
2.2.1 构建家蚕代表性组织的cDNA文库 | 第30-31页 |
2.2.2 家蚕大规模EST测序分析 | 第31页 |
2.2.3 家蚕脂肪体基因表达谱分析 | 第31页 |
2.3 实验技术路线 | 第31-32页 |
第三章 家蚕cDNA文库的构建 | 第32-46页 |
3.1 材料与方法 | 第32-39页 |
3.1.1 实验材料 | 第32-33页 |
3.1.2 实验方法 | 第33-39页 |
3.2 结果与分析 | 第39-42页 |
3.2.1 总RNA的抽提和mRNA的分离 | 第39-40页 |
3.2.2 双链cDNA的合成 | 第40页 |
3.2.3 双链cDNA回收定量 | 第40-41页 |
3.2.4 cDNA与载体的重组及重组子的转化铺板 | 第41页 |
3.2.5 重组质粒外源插入cDNA片段大小鉴定 | 第41-42页 |
3.3 讨论 | 第42-46页 |
3.3.1 家蚕cDNA文库构建方法 | 第42-43页 |
3.3.2 模板的准备 | 第43页 |
3.3.3 双链cDNA的合成 | 第43-45页 |
3.3.4 大规模EST分析研究中文库构建的要点 | 第45-46页 |
第四章 家蚕大规模EST测序与初步分析 | 第46-51页 |
4.1 方法 | 第46页 |
4.1.1 家蚕不同组织cDNA文库的大规模EST测序 | 第46页 |
4.1.2 EST数据的初步分析 | 第46页 |
4.2 结果与分析 | 第46-49页 |
4.2.1 EST测序 | 第46-47页 |
4.2.2 聚类分析 | 第47-48页 |
4.2.3 同源性检索分析 | 第48-49页 |
4.3 讨论 | 第49-51页 |
4.3.1 家蚕EST测序分析的规模化 | 第49页 |
4.3.2 后期研究计划 | 第49-51页 |
第五章 脂肪体基因表达谱分析 | 第51-71页 |
5.1 分析方法 | 第51-52页 |
5.1.1 基因表达谱的分析 | 第51页 |
5.1.2 与特定功能基因同源的EST数据的生物信息学分析 | 第51-52页 |
5.2 结果与分析 | 第52-65页 |
5.2.1 脂肪体EST数据的聚类 | 第52-53页 |
5.2.2 脂肪体EST数据的同源性分析 | 第53页 |
5.2.3 脂肪体已知基因的表达丰度 | 第53页 |
5.2.4 脂肪体已知基因的分子细胞生物学功能分类 | 第53-54页 |
5.2.5 脂肪体已知基因在不同发育时期的表达差异 | 第54-55页 |
5.2.6 幼虫期脂肪体已知基因表达的性别差异 | 第55-56页 |
5.2.7 脂肪体发育特异性EST数据的的生物信息学分析 | 第56-65页 |
5.3 讨论 | 第65-71页 |
5.3.1 利用ESTs分析脂肪体基因表达谱和发现新基因 | 第65-66页 |
5.3.2 脂肪体部分特异表达基因的生物信息学分析 | 第66-67页 |
5.3.3 脂肪体在不同发育时期的基因表达特征 | 第67-68页 |
5.3.4 脂肪体基因表达与变态调控的关系 | 第68-71页 |
第六章 结论 | 第71-73页 |
6.1 建立完善了家蚕EST研究相关的分析方法 | 第71页 |
6.2 构建了12种家蚕不同发育时期不同组织的cDNA文库 | 第71页 |
6.3 完成了家蚕不同发育时期不同组织的大规模EST测序 | 第71页 |
6.4 初步分析了脂肪体的基因表达概况 | 第71-72页 |
6.5 脂肪体部分已知基因的表达在不同发育阶段存在差异 | 第72页 |
6.6 家蚕脂肪体部分基因与变态调控有关 | 第72-73页 |
参考文献 | 第73-78页 |
附录 | 第78-85页 |
致谢 | 第85页 |