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家蚕大规模EST测序及脂肪体基因表达谱分析

中文摘要第1-12页
英文摘要第12-15页
第一章 文献综述第15-30页
 1.1 大规模EST测序战略第15-22页
  1.1.1 大规模EST测序战略的提出第15页
  1.1.2 cDNA文库的构建第15-19页
  1.1.3 EST测序及分析第19-20页
  1.1.4 EST的应用第20-22页
 1.2 基因表达谱第22-27页
  1.2.1 基因表达谱概念的提出第22-23页
  1.2.2 基因表达谱的编制第23-24页
  1.2.3 比较基因表达谱第24-25页
  1.2.4 基因表达谱比较研究的应用第25-27页
 1.3 家蚕EST计划第27页
 1.4 家蚕脂肪体的研究第27-30页
第二章 引言第30-32页
 2.1 研究的目的和意义第30页
 2.2 研究的主要内容第30-31页
  2.2.1 构建家蚕代表性组织的cDNA文库第30-31页
  2.2.2 家蚕大规模EST测序分析第31页
  2.2.3 家蚕脂肪体基因表达谱分析第31页
 2.3 实验技术路线第31-32页
第三章 家蚕cDNA文库的构建第32-46页
 3.1 材料与方法第32-39页
  3.1.1 实验材料第32-33页
  3.1.2 实验方法第33-39页
 3.2 结果与分析第39-42页
  3.2.1 总RNA的抽提和mRNA的分离第39-40页
  3.2.2 双链cDNA的合成第40页
  3.2.3 双链cDNA回收定量第40-41页
  3.2.4 cDNA与载体的重组及重组子的转化铺板第41页
  3.2.5 重组质粒外源插入cDNA片段大小鉴定第41-42页
 3.3 讨论第42-46页
  3.3.1 家蚕cDNA文库构建方法第42-43页
  3.3.2 模板的准备第43页
  3.3.3 双链cDNA的合成第43-45页
  3.3.4 大规模EST分析研究中文库构建的要点第45-46页
第四章 家蚕大规模EST测序与初步分析第46-51页
 4.1 方法第46页
  4.1.1 家蚕不同组织cDNA文库的大规模EST测序第46页
  4.1.2 EST数据的初步分析第46页
 4.2 结果与分析第46-49页
  4.2.1 EST测序第46-47页
  4.2.2 聚类分析第47-48页
  4.2.3 同源性检索分析第48-49页
 4.3 讨论第49-51页
  4.3.1 家蚕EST测序分析的规模化第49页
  4.3.2 后期研究计划第49-51页
第五章 脂肪体基因表达谱分析第51-71页
 5.1 分析方法第51-52页
  5.1.1 基因表达谱的分析第51页
  5.1.2 与特定功能基因同源的EST数据的生物信息学分析第51-52页
 5.2 结果与分析第52-65页
  5.2.1 脂肪体EST数据的聚类第52-53页
  5.2.2 脂肪体EST数据的同源性分析第53页
  5.2.3 脂肪体已知基因的表达丰度第53页
  5.2.4 脂肪体已知基因的分子细胞生物学功能分类第53-54页
  5.2.5 脂肪体已知基因在不同发育时期的表达差异第54-55页
  5.2.6 幼虫期脂肪体已知基因表达的性别差异第55-56页
  5.2.7 脂肪体发育特异性EST数据的的生物信息学分析第56-65页
 5.3 讨论第65-71页
  5.3.1 利用ESTs分析脂肪体基因表达谱和发现新基因第65-66页
  5.3.2 脂肪体部分特异表达基因的生物信息学分析第66-67页
  5.3.3 脂肪体在不同发育时期的基因表达特征第67-68页
  5.3.4 脂肪体基因表达与变态调控的关系第68-71页
第六章 结论第71-73页
 6.1 建立完善了家蚕EST研究相关的分析方法第71页
 6.2 构建了12种家蚕不同发育时期不同组织的cDNA文库第71页
 6.3 完成了家蚕不同发育时期不同组织的大规模EST测序第71页
 6.4 初步分析了脂肪体的基因表达概况第71-72页
 6.5 脂肪体部分已知基因的表达在不同发育阶段存在差异第72页
 6.6 家蚕脂肪体部分基因与变态调控有关第72-73页
参考文献第73-78页
附录第78-85页
致谢第85页

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