一种基于遗传算法的转录因子结合位点识别方法
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 第一章 引言 | 第8-13页 |
| ·生物信息学背景知识 | 第8-9页 |
| ·转录因子结合位点识别方法的研究目的与意义 | 第9页 |
| ·转录因子结合位点预测理论的研究现状 | 第9-11页 |
| ·本文主要内容 | 第11-13页 |
| 第二章 基本概念与原理 | 第13-18页 |
| ·基因表达 | 第13-14页 |
| ·基因表达调控 | 第14-15页 |
| ·转录调控 | 第15-17页 |
| ·转录因子 | 第15-17页 |
| ·转录因子结合位点 | 第17页 |
| ·本章小结 | 第17-18页 |
| 第三章 遗传算法基本原理 | 第18-26页 |
| ·遗传算法的基本概念 | 第18-19页 |
| ·遗传算法的基本流程 | 第19-25页 |
| ·参数编码 | 第20页 |
| ·初始群体的设定 | 第20页 |
| ·适应度函数的设计 | 第20-22页 |
| ·遗传操作设计 | 第22-25页 |
| ·操作参数设定 | 第25页 |
| ·本章小结 | 第25-26页 |
| 第四章 基于遗传算法的转录因子结合位点识别方法 | 第26-42页 |
| ·转录因子结合位点识别问题的描述 | 第26-30页 |
| ·生物序列比对 | 第30-33页 |
| ·序列比对问题 | 第30-31页 |
| ·局部序列比对 | 第31页 |
| ·基于动态规划算法的局部序列比对方法 | 第31-33页 |
| ·遗传算法在转录因子结合位点识别中的应用 | 第33-37页 |
| ·确定问题参数集 | 第33-34页 |
| ·参数编码 | 第34-35页 |
| ·产生初始群体 | 第35页 |
| ·适应度评价 | 第35-36页 |
| ·迭代终止条件 | 第36页 |
| ·遗传算子设计 | 第36-37页 |
| ·群体更新 | 第37页 |
| ·算法实现与实验结果分析 | 第37-41页 |
| ·实验数据 | 第37-38页 |
| ·控制参数的设置 | 第38-39页 |
| ·仿真程序流程 | 第39页 |
| ·基于遗传算法识别酵母转录因子结合位点的实验过程 | 第39-40页 |
| ·实验结果分析与算法评价 | 第40-41页 |
| ·本章小结 | 第41-42页 |
| 第五章 结束语 | 第42-44页 |
| ·总结 | 第42页 |
| ·展望 | 第42-44页 |
| 参考文献 | 第44-46页 |
| 致谢 | 第46-47页 |
| 在学期间公开发表论文及著作情况 | 第47页 |
