| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第一章 引言 | 第8-17页 |
| ·研究背景 | 第8-13页 |
| ·P2P技术 | 第8-10页 |
| ·生物序列比对 | 第10-11页 |
| ·基因表达数据相似性计算 | 第11-13页 |
| ·本文研究内容及成果 | 第13-15页 |
| ·基于P2P的生物文档共享与检索 | 第13-14页 |
| ·P2P-BLAST:基于P2P的生物序列搜索 | 第14-15页 |
| ·基于相似度的基因表达数据检索 | 第15页 |
| ·本文结构 | 第15-17页 |
| 第二章 相关工作 | 第17-28页 |
| ·已有P2P系统 | 第17-22页 |
| ·早期的P2P系统 | 第17-18页 |
| ·部分集中的非结构化P2P系统 | 第18-19页 |
| ·结构化P2P系统 | 第19-22页 |
| ·其他系统 | 第22页 |
| ·生物序列比对方法 | 第22-25页 |
| ·序列两两比对算法 | 第22-25页 |
| ·多序列比对算法 | 第25页 |
| ·基因表达数据相似度计算算法 | 第25-28页 |
| ·Pearson相关系数(Pearson correlation coefficient) | 第25-26页 |
| ·基于基因本体的基因表达数据相似度计算 | 第26-28页 |
| 第三章 基于P2P的生物文档共享与检索 | 第28-39页 |
| ·系统结构 | 第28-32页 |
| ·网络拓扑 | 第28-29页 |
| ·节点结构 | 第29-31页 |
| ·工作流程 | 第31-32页 |
| ·关键技术 | 第32-37页 |
| ·超级节点的实现 | 第32-33页 |
| ·通信机制 | 第33-34页 |
| ·节点加入和退出策略 | 第34-35页 |
| ·索引机制 | 第35-36页 |
| ·路由策略 | 第36-37页 |
| ·系统介绍 | 第37-38页 |
| ·小结 | 第38-39页 |
| 第四章 P2P-BLAST:基于P2P的生物序列搜索 | 第39-47页 |
| ·体系结构 | 第39-41页 |
| ·拓扑结构 | 第39-40页 |
| ·节点功能 | 第40-41页 |
| ·系统介绍 | 第41页 |
| ·系统实现 | 第41-46页 |
| ·算法选择 | 第41-42页 |
| ·打分矩阵 | 第42-43页 |
| ·序列搜索与共享 | 第43-45页 |
| ·结果排序 | 第45-46页 |
| ·小结 | 第46-47页 |
| 第五章 基于相似度的基因表达数据检索 | 第47-53页 |
| ·基因本体上的编辑距离(GOED) | 第47-48页 |
| ·权重函数 | 第48-50页 |
| ·不同层上结点的权重定义 | 第48-49页 |
| ·结点间关系的权重 | 第49-50页 |
| ·带权重信息的基因表达数据相似度计算 | 第50-52页 |
| ·基因本体上的加权编辑距离的计算 | 第50-51页 |
| ·基因表达数据相似度的计算 | 第51-52页 |
| ·小结 | 第52-53页 |
| 第六章 总结与展望 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |