| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 引言 | 第9-13页 |
| (一) 细菌和真核生物如何识别起始密码子 | 第9页 |
| (二) 古菌翻译起始机制的讨论 | 第9-11页 |
| 1 三界说的提出 | 第9-10页 |
| 2 古菌翻译起始机制的讨论 | 第10-11页 |
| (三) 关于5′UTR中AUG的研究 | 第11-13页 |
| 第二章 三联体AUG在起始密码子上游的缺失 | 第13-20页 |
| (一) 材料与方法 | 第13-14页 |
| 1 基因组选取 | 第13-14页 |
| 2 阅读框的定义 | 第14页 |
| 3 计算三联体AUG和UAA的频率 | 第14页 |
| (二) 结果与讨论 | 第14-20页 |
| 1 三联体AUG在三个阅读框中的频率分布 | 第14-16页 |
| 2 定义AUG缺失度D和缺失度的期望值D_(exp) | 第16-17页 |
| 3 三联体UAA在三个阅读框中的频率分布 | 第17-18页 |
| 4 讨论 | 第18-20页 |
| 第三章 关于阅读框1中AUG的分析 | 第20-34页 |
| (一) 定义SD序列 | 第20-22页 |
| (二) 利用CAI值衡量密码子使用的偏好性 | 第22-23页 |
| 1 密码子适应性指数CAI | 第22页 |
| 2 用迭代的方法计算CAI值 | 第22-23页 |
| (三) 统计学方法 | 第23-25页 |
| 1 相关分析 | 第23-24页 |
| 2 成对数据的t检验 | 第24-25页 |
| (四) 对uAUG的研究 | 第25-34页 |
| 1 uAUG和uORF的定义 | 第25页 |
| 2 uAUG的数量 | 第25-27页 |
| 3 uAUG与SD序列的关系 | 第27页 |
| 4 "密码子"偏好性比较 | 第27-32页 |
| 5 讨论 | 第32-34页 |
| 参考文献 | 第34-38页 |
| 致谢 | 第38-39页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第39页 |