中文摘要 | 第1-5页 |
英文摘要 | 第5-6页 |
目录 | 第6-7页 |
图和附表清单 | 第7-8页 |
1 引言 | 第8-12页 |
·生物信息学方法预测基因功能 | 第8-10页 |
·细菌基因组复制起始区预测 | 第10-11页 |
·Familiar-Mark | 第11-12页 |
2 数据和方法 | 第12-23页 |
·数据 | 第12-14页 |
·细菌基因组数据 | 第12-14页 |
·用Z-curve方法得出的复制起始区预测数据 | 第14页 |
·用改进的DNA-walk进行辅助预测 | 第14-15页 |
·Familiar-Mark:用保守片段的排列次序标记基因组上特定位点 | 第15-23页 |
·建立待检基因组片段的散列索引 | 第16-17页 |
·根据索引将短片段匹配成对 | 第17-19页 |
·将配对的短片段延伸、标记定位到基因组 | 第19-23页 |
·利用基因组Familiar-Mark标记找到待检位点 | 第23页 |
3 结果和讨论 | 第23-37页 |
·通过DNA-walk得到复制起始区疑似的大致位置 | 第23-26页 |
·Familiar-Mark标记预测复制起始区位置 | 第26-32页 |
·预测更多细菌基因组的复制起始区 | 第32-33页 |
·理解Familiar-Mark | 第33-35页 |
·下一步工作打算 | 第35-36页 |
·结论 | 第36-37页 |
参考文献 | 第37-41页 |
致谢 | 第41页 |
在读期间发表的论文 | 第41-42页 |
附件 | 第42页 |