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Familiar-Mark:基于同源性及基因组上下文方法预测细菌基因组复制起始区

中文摘要第1-5页
英文摘要第5-6页
目录第6-7页
图和附表清单第7-8页
1 引言第8-12页
   ·生物信息学方法预测基因功能第8-10页
   ·细菌基因组复制起始区预测第10-11页
   ·Familiar-Mark第11-12页
2 数据和方法第12-23页
   ·数据第12-14页
     ·细菌基因组数据第12-14页
     ·用Z-curve方法得出的复制起始区预测数据第14页
   ·用改进的DNA-walk进行辅助预测第14-15页
   ·Familiar-Mark:用保守片段的排列次序标记基因组上特定位点第15-23页
     ·建立待检基因组片段的散列索引第16-17页
     ·根据索引将短片段匹配成对第17-19页
     ·将配对的短片段延伸、标记定位到基因组第19-23页
     ·利用基因组Familiar-Mark标记找到待检位点第23页
3 结果和讨论第23-37页
   ·通过DNA-walk得到复制起始区疑似的大致位置第23-26页
   ·Familiar-Mark标记预测复制起始区位置第26-32页
   ·预测更多细菌基因组的复制起始区第32-33页
   ·理解Familiar-Mark第33-35页
   ·下一步工作打算第35-36页
   ·结论第36-37页
参考文献第37-41页
致谢第41页
在读期间发表的论文第41-42页
附件第42页

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