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角毛壳菌Chi58基因克隆与密码子优化及在毕赤酵母中的高效表达

摘要第1-6页
Abstract第6-17页
第1章 绪论第17-40页
   ·课题背景及研究的目的和意义第17-18页
   ·国内外研究综述第18-38页
     ·生物农药的研究进展第18-21页
     ·毛壳菌生防能力的研究现状及意义第21-25页
     ·几丁质酶分类及酶学特性研究进展第25-29页
     ·酵母表达系统的研究概况第29-34页
     ·影响外源基因在毕赤酵母系统中高效表达的因素第34-38页
   ·存在的问题第38-39页
   ·课题的来源及主要研究内容第39-40页
     ·课题来源第39页
     ·主要研究内容第39-40页
第2章 实验材料与方法第40-65页
   ·实验材料第40-45页
     ·菌株和质粒第40页
     ·培养基第40-42页
     ·酶和试剂第42-44页
     ·仪器设备第44-45页
   ·实验方法第45-65页
     ·角毛壳菌几丁质酶Chi58 基因的诱导表达第45-46页
     ·角毛壳菌几丁质酶Chi58 基因克隆及序列分析第46-49页
     ·酿酒酵母表达载体的构建与鉴定第49-51页
     ·毕赤酵母表达载体的构建与鉴定第51-53页
     ·Chi58 基因密码子改造突变体的构建第53-55页
     ·Chi58 基因多拷贝整合转化子的获得第55-56页
     ·Chi58 基因几丁质结合域缺失突变体的构建第56-58页
     ·重组几丁质酶活性测定及酶学特性分析第58-61页
     ·重组几丁质酶SDS-PAGE 及酶谱分析第61-62页
     ·重组几丁质酶的诱导表达及发酵条件优化第62-63页
     ·重组几丁质酶转化子与病原菌的室内拮抗试验第63-65页
第3章 角毛壳菌几丁质酶Chi58 基因的克隆及序列分析第65-79页
   ·角毛壳菌几丁质酶的诱导表达第65-66页
     ·不同碳源对角毛壳菌几丁质酶的诱导表达第65-66页
     ·半定量RT-PCR 分析Chi58 基因的表达量第66页
   ·Chi58 基因全长序列获得及生物信息学分析第66-76页
     ·Chi58 基因全长DNA 序列的获得第66-69页
     ·Chi58 基因序列同源性比对及保守区预测第69-70页
     ·CHI58 氨基酸组成分析第70-71页
     ·CHI58 信号肽预测第71-72页
     ·CHI58 多序列比对第72-74页
     ·CHI58 氨基酸结构域预测第74-75页
     ·CHI58 系统进化树的构建第75-76页
   ·Chi58 基因的诱导表达与序列分析的讨论第76-77页
     ·几丁质酶与生物防治第76页
     ·应用反向PCR 方法获得全长DNA 序列第76-77页
     ·几丁质酶基因及推导氨基酸序列的生物信息学分析第77页
   ·本章小结第77-79页
第4章 角毛壳菌几丁质酶Chi58 基因在酵母系统中的表达研究第79-94页
   ·几丁质酶Chi58 基因的酿酒酵母转化及表达第79-82页
     ·几丁质酶 Chi58 基因的扩增及与 pYES2 载体的连接第79-80页
     ·酿酒酵母 H158 的生长曲线测定第80-81页
     ·几丁质酶基因Chi58 的酿酒酵母转化及鉴定第81页
     ·酿酒酵母转化子几丁质酶活性检测第81-82页
   ·几丁质酶Chi58 基因的毕赤酵母转化及表达第82-88页
     ·几丁质酶Chi58 的扩增及表达载体的构建第82-83页
     ·几丁质酶Chi58 基因在毕赤酵母中的转化第83-84页
     ·转化子产酶最适pH 值的测定第84页
     ·转化子最适发酵时间的测定第84-85页
     ·转化子产酶最适温度的测定第85页
     ·转化子产酶热稳定性的测定第85-86页
     ·不同底物对几丁质酶活性的影响第86页
     ·不同金属离子及化合物对几丁质酶活性的影响第86-87页
     ·转化子遗传稳定性分析第87页
     ·SDS-PAGE 及酶谱鉴定第87-88页
   ·几丁质酶CHI58 酶学特性及表达分析第88-93页
     ·几丁质酶CHI58 在两种酵母系统中的表达分析第88-89页
     ·载体构建及毕赤酵母转化第89-90页
     ·几丁质酶CHI58 酶学特性分析第90-92页
     ·酶谱分析及蛋白活性电泳第92-93页
   ·本章小结第93-94页
第5章 几丁质酶Chi58 基因在毕赤酵母中的高效表达研究第94-116页
   ·几丁质酶Chi58 基因密码子改造的研究第94-103页
     ·毕赤酵母表达系统对外源基因密码子选择的偏爱性第94-95页
     ·几丁质酶Chi58 基因密码子使用分析第95-97页
     ·几丁质酶CHI58A 三级结构分析第97-98页
     ·几丁质酶基因Chi58A 的密码子改造及鉴定第98-99页
     ·毕赤酵母表达载体的构建第99-100页
     ·电转化毕赤酵母 GS115 及转化子的筛选第100-101页
     ·几丁质酶活性的比较分析第101-102页
     ·SDS-PAGE 比较分析第102页
     ·重组酵母的遗传稳定性分析第102-103页
   ·几丁质酶Chi58 基因多拷贝整合的研究第103-105页
     ·G418 筛选不同拷贝数的转化子第103-104页
     ·几丁质酶Chi58 基因的二次转化第104-105页
   ·发酵条件优化第105-109页
     ·菌体初始接种量对几丁质酶表达量的影响第105-106页
     ·不同pH 值对外源蛋白表达的影响第106-107页
     ·诱导阶段甲醇浓度对蛋白表达量的影响第107页
     ·油酸对蛋白表达量的影响第107-108页
     ·正交设计法优化培养基配方试验第108-109页
   ·几丁质酶Chi58 基因高效表达的讨论第109-115页
     ·密码子选择的偏爱性对几丁质酶 CHI58 表达量的影响第109-110页
     ·SOE-PCR 方法在密码子改造中的应用第110-112页
     ·几丁质酶Chi58 基因多拷贝整合对表达量的影响第112页
     ·几丁质酶 Chi58 基因多拷贝整合对表达量的影响第112-115页
   ·本章小结第115-116页
第6章 几丁质酶Chi58 基因结构域的功能验证及抑菌效能研究第116-136页
   ·几丁质酶 CHI58 分子结构预测第116-119页
     ·CHI58 结构域预测第116-117页
     ·CHI58 二级结构预测第117-118页
     ·CHI58D 三级结构预测第118-119页
   ·ChBD 缺失突变体的构建及在毕赤酵母中的转化第119-122页
     ·结构域缺失突变体的构建第119-120页
     ·结构域缺失突变体Chi58D 表达载体的构建第120页
     ·转化毕赤酵母及其表型鉴定第120-121页
     ·SDS-PAGE 比较分析第121-122页
   ·转化子的几丁质酶活性检测第122-125页
     ·基于可溶性底物的几丁质酶活性检测第122-123页
     ·基于不溶性底物的几丁质酶活性检测第123页
     ·以真菌细胞壁为底物的几丁质酶活性检测第123-124页
     ·CHI58 与 CHI58D 最适温度与最适 pH 值的比较第124-125页
   ·基因工程菌株发酵液对植物病原菌的抑制作用第125-127页
     ·应用含毒介质法测定抑菌效果的研究第125-126页
     ·应用平板打孔法测定抑菌效果的研究第126-127页
   ·角毛壳菌与植物病原菌的室内拮抗试验第127-131页
     ·角毛壳菌对立枯丝核菌的拮抗作用第127-128页
     ·角毛壳菌对杨树叶枯病菌的拮抗作用第128-129页
     ·角毛壳菌对核盘菌的拮抗作用第129页
     ·角毛壳菌对杨树烂皮病菌的拮抗作用第129-130页
     ·角毛壳菌对尖孢镰刀菌的拮抗作用第130-131页
   ·几丁质酶基因结构域及其抑菌活性分析第131-135页
     ·几丁质酶几丁质结合域分析第131-133页
     ·几丁质酶抑菌活性分析第133-135页
   ·本章小结第135-136页
结论第136-138页
参考文献第138-155页
攻读博士学位期间发表的论文及其它成果第155-157页
致谢第157-158页
个人简历第158页

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