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玉米抗禾谷镰刀菌茎腐病主效QTL基因ZmCCT的克隆、功能分析及表观调控研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
缩略词表第10-12页
第一章 文献综述第12-48页
    1.1 玉米茎腐病的研究进展第12-16页
        1.1.1 玉米茎腐病的分布及危害第12页
        1.1.2 玉米茎腐病的致病菌及致病机理第12-13页
        1.1.3 玉米茎腐病的抗性遗传及QTL定位第13-15页
        1.1.4 Bin 10.04主效QTL-qRfg1的精细定位第15-16页
    1.2 植物中的CCT基因家族第16-25页
        1.2.1 CCT基因家族的结构分类第17-19页
        1.2.2 CCT家族基因的功能与调控第19-21页
        1.2.3 CCT家族基因的一因多效第21-25页
    1.3 植物中的转座子第25-35页
        1.3.1 转座子的类型与复制机制第25-26页
        1.3.2 转座子的功能第26-35页
    1.4 植物中的DNA与组蛋白甲基化第35-47页
        1.4.1 植物中的DNA甲基化第35-41页
        1.4.2 植物中的组蛋白甲基化第41-46页
        1.4.3 植物中DNA甲基化与组蛋白甲基化的相关性第46-47页
    1.5 本研究的意义第47-48页
第二章 QTL-qRfg1候选基因ZmCCT的功能验证第48-70页
    2.1 前言第48页
    2.2 材料第48-53页
        2.2.1 植物材料第48页
        2.2.2 病原菌第48-49页
        2.2.3 转基因载体第49页
        2.2.4 培养基第49-51页
        2.2.5 试剂第51页
        2.2.6 溶液配制第51-53页
    2.3 方法第53-62页
        2.3.1 禾谷镰刀菌的田间接种及抗性鉴定(成熟期)第53-55页
        2.3.2 禾谷镰刀菌的实验室接种及抗性鉴定(苗期)第55-56页
        2.3.3 植物组织DNA的提取(SDS碱式裂解法)第56页
        2.3.4 PCR程序及反应第56-57页
        2.3.5 PCR产物的克隆第57页
        2.3.6 质粒的小量提取第57-58页
        2.3.7 DNA的割胶回收第58页
        2.3.8 转基因载体的构建第58-60页
        2.3.9 质粒转化农杆菌第60页
        2.3.10 转基因后代鉴定第60页
        2.3.11 植物组织RNA的提取第60-61页
        2.3.12 第一链cCDA的合成第61页
        2.3.13 qRT-PCR第61-62页
        2.3.14 基于转座子等位变异的候选基因关联分析第62页
    2.4 结果与分析第62-68页
        2.4.1 转座子的插入/缺失与抗病性的相关性分析第62-63页
        2.4.2 转基因验证ZmCCT的功能第63-68页
    2.5 讨论第68-70页
第三章 ZmCCT的表达模式及表观遗传调控第70-90页
    3.1 前言第70页
    3.2 材料第70-73页
        3.2.1 植物材料第70-71页
        3.2.2 试剂第71页
        3.2.3 溶液配制第71-73页
        3.2.4 其他第73页
    3.3 方法第73-76页
        3.3.1 DNA甲基化的测定(Bisulfite sequencing)及分析第73-74页
        3.3.2 组蛋白甲基化的测定(ChIP-qPCR)及分析第74-76页
        3.3.3 其他方法第76页
    3.4 结果与分析第76-88页
        3.4.1 ZmCCT响应病原菌侵染的表达模式第76-78页
        3.4.2 ZmCCT启动子区域DNA甲基化的状态及对病原菌侵染的响应第78-86页
        3.4.3 ZmCCT启动子区域组蛋白甲基化的状态及对病原菌侵染的响应第86-88页
    3.5 讨论第88-90页
第四章 ZmCCT功能的一因多效性分析第90-113页
    4.1 前言第90页
    4.2 材料第90-95页
        4.2.1 植物材料第90-91页
        4.2.2 表达载体第91-92页
        4.2.3 培养基第92页
        4.2.4 溶液配制第92-95页
    4.3 方法第95-98页
        4.3.1 开花期相关性状的调查与统计第95页
        4.3.2 半定量PCR与检测第95页
        4.3.3 载体构建第95-96页
        4.3.4 洋葱表皮亚细胞定位第96页
        4.3.5 玉米原生质体亚细胞定位第96-97页
        4.3.6 农杆菌转化烟草及GUS染色第97页
        4.3.7 拟南芥转基因(浸花法)第97页
        4.3.8 苗期玉米的水培、营养胁迫处理及性状调查第97-98页
        4.3.9 其他方法第98页
    4.4 结果与分析第98-111页
        4.4.1 ZmCCT对开花期相关性状的影响第98-103页
        4.4.2 叶片中ZmCCT的光周期诱导表达模式第103页
        4.4.3 叶片中ZmCCT启动子的DNA甲基化状态第103-104页
        4.4.4 叶片中ZmCCT启动子的光诱导活性第104-106页
        4.4.5 ZmCCT对玉米非生物胁迫抗性的影响第106-109页
        4.4.6 ZmCCT介导的光周期反应与茎腐病抗性第109-111页
    4.5 讨论第111-113页
第五章 结论第113-114页
参考文献第114-130页
附录第130-151页
    附录1 本研究所用引物序列第130-132页
    附录2. 47份玉米材料的基因型和抗性表型第132-134页
    附录3. 病原菌接种前后Y331-△TE和Y331中ZmCCT启动子甲基化状态发生变化的cis-element第134-139页
    附录4. 病原菌接种前后1145中ZmCCT启动子甲基化状态发生变化的cis-element第139-144页
    附录5. 病原菌接种前后HZS中ZmCCT启动子甲基化状态发生变化的cis-element第144-151页
致谢第151-153页
个人简历第153-154页

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