| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 前言 | 第9-17页 |
| ·研究背景 | 第9-11页 |
| ·比较基因组学 | 第11-14页 |
| ·基因组学分析内容 | 第14-17页 |
| ·比较分析基因组结构 | 第14-15页 |
| ·比较分析编码区域 | 第15-16页 |
| ·比较分析基因组非编码区域 | 第16-17页 |
| 第二章 比较基因组学研究 | 第17-26页 |
| ·比较算法基础 | 第17-20页 |
| ·序列比对定义 | 第17页 |
| ·序列比对的分类 | 第17-20页 |
| ·比较基因组学工具 | 第20-23页 |
| ·双基因组比对(pair-wise genome alignment) | 第20-21页 |
| ·多基因组比对(multiple genome alignment) | 第21-22页 |
| ·基因组可视化工具 | 第22-23页 |
| ·比较基因组学网络服务资源 | 第23-24页 |
| ·比较基因组学平台设计的意义 | 第24-26页 |
| 第三章 比较基因组学平台的设计与实现 | 第26-43页 |
| ·总体设计 | 第26-28页 |
| ·基本构架 | 第26-27页 |
| ·平台运行环境与开发工具 | 第27-28页 |
| ·平台的功能设计 | 第28-38页 |
| ·基因组比较 | 第30-32页 |
| ·基因组分析 | 第32-36页 |
| ·基因组比较浏览器 | 第36-38页 |
| ·程序设计 | 第38-42页 |
| ·用户页面制作 | 第38页 |
| ·数据处理流程 | 第38-42页 |
| ·小结 | 第42-43页 |
| 第四章 比较基因组学平台的应用研究 | 第43-54页 |
| ·新型甲型流感病毒A/H1N1同源性分析 | 第43-45页 |
| ·结核分枝杆菌及相关菌株基因组比较 | 第45-53页 |
| ·基因组基本特性比较 | 第45-46页 |
| ·基因组同线性分析 | 第46-50页 |
| ·基因组间单核苷酸多态性分析(SNPS) | 第50页 |
| ·重复序列分析 | 第50-53页 |
| ·小结 | 第53-54页 |
| 第五章 总结和展望 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-60页 |
| 论文附件清单 | 第60-61页 |
| 攻读硕士期间发表的论著 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62-64页 |
| 统计学证明 | 第64-65页 |