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耻垢分枝杆菌ercc3基因相互作用蛋白的串联亲和纯化

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-9页
1 引言第9-24页
   ·真核转录因子TFIIH 及其亚基XPB第9-15页
     ·解旋酶XPB 是多亚基通用转录因子TFIIH 的组分第9-10页
     ·XPB 参与转录和修复第10-12页
     ·XPB 参与细胞周期调控与凋亡控制第12-14页
     ·XPB 参与的其他途径第14页
     ·XPB 突变相关疾病第14-15页
   ·分枝杆菌的转录起始和核苷酸切除修复(NER)第15-17页
     ·分枝杆菌的转录起始第15-16页
     ·分枝杆菌的核苷酸切除修复第16-17页
   ·原核生物中存在XPB 的同源蛋白第17-19页
     ·分枝杆菌中存在真核XPB 的同源蛋白Ercc3第18页
     ·古细菌中ercc3 基因的研究进展第18-19页
   ·串联亲和纯化在研究蛋白相互作用中的应用第19-24页
     ·TAP 的原理和方法第19-22页
     ·重组工程系统(Recombineering system)第22-24页
2 材料与方法第24-41页
   ·实验材料第24-28页
     ·菌株,质粒和DNA 序列第24页
     ·培养基第24-25页
     ·试剂第25-26页
     ·溶液及缓冲液第26-27页
     ·实验仪器第27-28页
   ·实验方法第28-41页
     ·大肠杆菌的转化第28页
     ·耻垢分枝杆菌基因组的提取第28页
     ·大肠杆菌质粒的提取第28页
     ·PCR 扩增M.smegmatis ercc3 终止密码子上,下游片段,TAP 标签及潮霉素抗性基因第28-30页
     ·knock-in 载体的构建及knock-in DNA 片段的获得第30页
     ·耻构分枝杆菌的电转化第30-32页
     ·PCR 验证M.smegmatis mc2 155 ercc3-tap 重组子第32-34页
     ·westernblot 验证Ercc3-TAP 表达第34页
     ·串联亲和层析纯化Ercc3 蛋白第34-35页
     ·蛋白浓缩第35页
     ·蛋白银染第35页
     ·质谱鉴定第35页
     ·PCR 扩增 M.smegmatis rpoC 和 rpoB 基因,link-SBP 标签序列第35-37页
     ·M.smegmatis RpoC, Ercc3-SBP, His-T7-SBP 表达载体的构建第37页
     ·蛋白质的诱导生成第37页
     ·蛋白质的大量表达与纯化第37-39页
     ·SDS-PAGE 分析蛋白纯度及分子量第39页
     ·蛋白质的浓度测定第39页
     ·Far western 分析蛋白之间的相互作用第39页
     ·SBP pull-down 分析蛋白之间的相互作用第39-41页
3 结果与分析第41-50页
   ·在基因组上ercc3 基因的C 端敲入TAP-tag 片段第41-42页
   ·western blot 验证连有TAP-tag 标签的Ercc3 蛋白的表达情况第42页
   ·串联亲和纯化Ercc3 蛋白第42-43页
   ·质谱鉴定第43-45页
   ·ercc3-sbp,rpoC,rpoB 等基因的克隆和蛋白的表达与纯化第45-47页
   ·Far western 与SBP pull-down 分析Ercc3 与RpoC 间的相互作用第47-49页
   ·Ercc3 与ATPase 和MSMEG_5705 间的相互作用第49-50页
4 讨论第50-53页
参考文献第53-56页
致谢第56页

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