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免培养法对新疆热气泉土壤原核微生物多样性及生物地理的研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-11页
第一章 文献综述第11-15页
   ·热气泉特征、分布及其土壤微生物研究进展第11页
   ·微生物生物地理学及研究进展第11-12页
   ·微生物生态学研究方法第12-14页
     ·培养方法第12页
     ·免培养方法第12-14页
       ·不依赖于PCR 技术的免培养方法第12-13页
       ·依赖于PCR 技术的免培养方法第13-14页
   ·本研究的目的和意义第14-15页
第二章 新疆玛纳斯热气泉土壤细菌多样性分析第15-24页
   ·材料与方法第15-16页
     ·材料第15页
       ·样品采集第15页
       ·主要试剂和仪器第15页
     ·土壤细菌群落16S rDNA 基因文库的构建第15-16页
       ·土壤总DNA 提取与纯化第15页
       ·细菌16S rDNA 基因扩增第15-16页
       ·细菌16S rDNA 基因克隆文库的构建及阳性克隆的筛选第16页
     ·RFLP 分析第16页
       ·RFLP 分型第16页
       ·克隆文库分析第16页
     ·系统发育分析及核酸序列收录号第16页
   ·结果与分析第16-22页
     ·土壤总DNA 提取与纯化第16-17页
     ·细菌16S rDNA 基因扩增第17页
     ·细菌16S rDNA 基因克隆文库构建及阳性克隆的筛选第17-18页
     ·16S rDNA 基因克隆文库的RFLP 分型第18页
     ·克隆文库覆盖率分析第18-19页
     ·细菌16S rDNA 系统发育分析第19-22页
       ·厚壁菌门(Firmicutes)第19页
       ·变形菌门(Proteobacteria)第19-20页
       ·酸杆菌门(Acidobacteria)第20页
       ·拟杆菌门(Bacteroidetes)第20-22页
       ·浮霉菌门(Planctomycetes)第22页
       ·放线菌门(Actinobacteria)第22页
       ·未确定分类(Unidentified)第22页
   ·讨论第22-24页
第三章 新疆玛纳斯热气泉土壤古菌多样性分析第24-31页
   ·材料与方法第24-25页
     ·材料第24页
       ·样品采集第24页
       ·主要试剂和仪器第24页
     ·土壤古菌群落16S rDNA 文库的构建及RFLP 分析第24-25页
       ·土壤总DNA 提取与纯化第24页
       ·古菌16S rDNA PCR 扩增第24-25页
       ·古菌16S rDNA 克隆文库的构建及阳性克隆筛选第25页
     ·RFLP 分型第25页
       ·RFLP 分型第25页
       ·克隆文库分析第25页
     ·系统发育分析及核酸序列收录号第25页
   ·结果与分析第25-29页
     ·古菌16S rDNA 扩增与纯化第25-26页
     ·古菌16S rDNA 克隆文库的构建及阳性克隆的筛选第26页
     ·16S rDNA 克隆文库的RFLP 分型第26-27页
     ·克隆文库覆盖率分析第27页
     ·古菌16S rDNA 系统发育分析第27-29页
       ·组群Ⅰ第28-29页
       ·组群Ⅱ第29页
   ·讨论第29-31页
第四章 新疆热气泉土壤硫氧化和硫还原菌生物地理第31-41页
   ·材料与方法第31-33页
     ·材料第31页
       ·样品采集第31页
       ·主要试剂和仪器第31页
     ·土壤样品理化参数测定第31-32页
     ·土壤硫氧化和硫还原菌aprA 基因扩增第32页
       ·土壤总DNA 提取与纯化第32页
       ·硫氧化和硫还原菌aprA 基因扩增第32页
     ·硫氧化和硫还原菌aprA 基因T-RFLP 分析第32页
     ·基于T-RFLP 图谱的微生物多样性分析第32-33页
   ·结果与分析第33-39页
     ·土壤样品理化性质第33-34页
     ·土壤总DNA 的提取与纯化第34页
     ·硫氧化和硫还原菌aprA 基因扩增第34页
     ·硫氧化和硫还原菌aprA 基因T-RFLP 分析第34-35页
     ·基于aprA 基因T-RFLP 图谱的功能多样性分析第35-39页
       ·硫氧化和硫还原菌多样性指数第35-36页
       ·硫氧化和硫还原菌群落组成的聚类分析第36-37页
       ·多样性指数与理化因子的主成分分析第37页
       ·硫氧化和硫还原菌多样性指数与理化因子的典型相关分析第37-38页
       ·硫氧化和硫还原菌多样性指数与温度和pH 值的关系第38-39页
   ·讨论第39-41页
第五章 新疆热气泉土壤细菌的生物地理第41-49页
   ·材料和方法第41-42页
     ·材料第41页
     ·土壤样品理化性质测定第41页
     ·土壤细菌16S rDNA 扩增第41页
     ·细菌16S rDNA 的T-RFLP 分析第41-42页
     ·基于T-RFLP 图谱的微生物多样性分析第42页
   ·结果与分析第42-47页
     ·细菌16S rDNA 扩增与纯化第42-43页
     ·细菌16S rDNA 的T-RFLP 分析第43页
     ·基于细菌16S rDNA T-RFLP 图谱的微生物多样性分析第43-47页
       ·细菌多样性指数第43-44页
       ·土壤细菌主要群落组成第44-45页
       ·细菌群落组成的聚类分析第45-46页
       ·细菌多样性指数与理化因子的主成分分析第46-47页
       ·细菌多样性指数与理化因子的典型相关分析第47页
   ·讨论第47-49页
第六章 结论与展望第49-50页
   ·结论第49页
   ·展望第49-50页
参考文献第50-56页
主要英文缩略词表第56-57页
硕士研究生期间发表论文第57-58页
附录A第58-60页
附录B第60-62页
致谢第62页

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