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选择性剪接顺式调控元件的位置效应

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-11页
第一章 引言第11-31页
 1 前体MRNA剪接与选择性剪接简介第11-13页
 2 剪接反应的化学机制和催化机制(剪接体的组装)第13-15页
 3 前体MRNA上的顺式作用元件(CIS-ACTING ELEMENTS/SEQUENCES)和反式作用蛋白因子(SPLICING FACTORS)第15-18页
 4 PTB蛋白及其功能简介第18-22页
 5 顺式作用元件的位置效应第22-23页
 6 二级结构对顺式作用元件的影响第23-27页
 7 SMN基因和选择性剪接第27-30页
 8 本课题的研究内容和意义第30-31页
第二章 材料与方法第31-52页
 1 材料第31-42页
   ·菌株、细胞系及质粒第31-33页
   ·主要生化药品以及来源第33页
   ·细胞操作相关试剂第33页
   ·酶类第33-34页
   ·本研究所用引物第34-39页
   ·分析软件第39页
   ·溶液的配置第39-42页
 2 方法第42-52页
   ·普通克隆的构建第42页
   ·搭桥构建插入或删除克隆第42-44页
   ·oligo插入构建克隆第44-45页
   ·Qucikchange构建克隆第45-46页
   ·大肠杆菌DH5a感受态细胞的制备第46页
   ·转染用超纯质粒的制备第46页
   ·细胞实验操作第46-47页
   ·细胞转染第47-48页
   ·RT-PCR第48-50页
   ·western第50-51页
   ·基因组DNA的提取第51-52页
第三章 结果与讨论第52-82页
 PARTⅠ ESE在内含子中可以促进可变外显子的剪接,并且存在显著的位置效应第52-56页
 PARTⅡ第56-71页
  1 PTB-ISE不能促进SMN2外显子7的选择性剪接,却包含一个强的5’剪接位点第56-61页
  2 PTB-ISE里的强5’剪接位点在SMN1外显子7里也具有竞争能力第61-65页
  3 5 ’剪接位点的位置效应:一个新概念第65-66页
  4 PTB-ISE的剪接增强功能确实不依赖于PTB结合序列第66-69页
  5 全长的PTB-ISE里的强5’剪接位点的选择依赖PTB和NPTB第69-71页
 PARTⅢ 二级结构对顺式作用元件ESE功能的多向性调节第71-82页
  1 稳定的二级结构以碱基配对的方式屏蔽位于颈区的ESE的功能第71-73页
  2 稳定的二级结构可以影响位于环区的ESE的功能第73-75页
  3 位于稳定的二级结构下游的ESE具有较强活性第75-76页
  4 二级结构和多ESE簇蛋白结合间的竞争作用第76-78页
  5 单碱基突变可能同时导致顺式作用元件的改变和二级结构的改变从而影响剪接第78-79页
  6 二级结构和顺式作用元件互做的模型第79-82页
第四章 研究工作总结与展望第82-83页
讨论和展望第83-84页
参考文献第84-90页
研究生期间待发表论文第90-91页
致谢第91页

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