基于蛋白质网络中复合体的识别方法研究
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第12-20页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第12-14页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第14-17页 |
| 1.3 论文主要工作 | 第17-18页 |
| 1.4 论文结构安排 | 第18-20页 |
| 第2章 PPI网络中的复合体搜索算法综述 | 第20-29页 |
| 2.1 引言 | 第20页 |
| 2.2 相关概念 | 第20-22页 |
| 2.2.1 高通量大数据实验技术 | 第20页 |
| 2.2.2 蛋白质相互作用 | 第20-21页 |
| 2.2.3 PPI网络 | 第21页 |
| 2.2.4 PPI网络的研究要点 | 第21-22页 |
| 2.3 PPI数据库 | 第22-23页 |
| 2.4 常见的蛋白质复合体搜索算法 | 第23-25页 |
| 2.4.1 基于层次化的搜索算法 | 第23页 |
| 2.4.2 基于子网划分的搜索算法 | 第23-24页 |
| 2.4.3 基于稠密子网的搜索算法 | 第24页 |
| 2.4.4 基于流体模拟的搜索算法 | 第24-25页 |
| 2.4.5 基于种群随机的搜索算法 | 第25页 |
| 2.5 评价指标 | 第25-27页 |
| 2.5.1 F-measure | 第25-26页 |
| 2.5.2 Accuracy | 第26-27页 |
| 2.5.3 P-value | 第27页 |
| 2.6 小结 | 第27-29页 |
| 第3章 基于蛋白质网络拓扑特征的复合体搜索方法 | 第29-39页 |
| 3.1 引言 | 第29-30页 |
| 3.2 算法描述 | 第30-33页 |
| 3.2.1 算法原理 | 第30-31页 |
| 3.2.2 算法流程 | 第31-32页 |
| 3.2.3 算法伪代码 | 第32-33页 |
| 3.3 实验与结果分析 | 第33-37页 |
| 3.3.1 数据集 | 第33页 |
| 3.3.2 评价指标 | 第33-34页 |
| 3.3.3 实验结果分析 | 第34-37页 |
| 3.4 小结 | 第37-39页 |
| 第4章 融合多种方法的蛋白质复合体搜索研究 | 第39-49页 |
| 4.1 引言 | 第39页 |
| 4.2 算法描述 | 第39-42页 |
| 4.2.1 算法原理 | 第39-40页 |
| 4.2.2 算法流程 | 第40-41页 |
| 4.2.3 算法伪代码 | 第41-42页 |
| 4.3 实验与结果分析 | 第42-48页 |
| 4.3.1 数据集 | 第42-43页 |
| 4.3.2 评价指标 | 第43页 |
| 4.3.3 实验结果分析 | 第43-48页 |
| 4.4 小结 | 第48-49页 |
| 第5章 结论与展望 | 第49-52页 |
| 5.1 结论 | 第49-50页 |
| 5.2 展望 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 附录A 攻读学位期间所发表的学术论文及所参加项目 | 第59页 |
