| 摘要 | 第12-14页 |
| Abstract | 第14-15页 |
| 前言 | 第16-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-32页 |
| 1.1 植物细胞质遗传研究概况 | 第17-21页 |
| 1.1.1 植物细胞质遗传检测方法 | 第17-18页 |
| 1.1.2 植物细胞质遗传机理 | 第18-21页 |
| 1.1.3 植物细胞质遗传和细胞核遗传的关系 | 第21页 |
| 1.2 叶绿体基因组研究概况 | 第21-24页 |
| 1.2.1 叶绿体基因组结构 | 第21-23页 |
| 1.2.2 叶绿体基因组的进化 | 第23页 |
| 1.2.3 叶绿体基因组的应用 | 第23-24页 |
| 1.3 质体突变体的研究进展 | 第24-27页 |
| 1.3.1 质体突变体的来源 | 第24-25页 |
| 1.3.2 质体突变体的鉴定 | 第25页 |
| 1.3.3 质体突变体的类型 | 第25-27页 |
| 1.3.4 质体突变体的应用 | 第27页 |
| 1.4 叶绿体核糖体蛋白的研究概况 | 第27-28页 |
| 1.4.1 叶绿体核糖体核糖体的分类 | 第27-28页 |
| 1.4.2 叶绿体核糖体蛋白的突变对植物生长发育的影响 | 第28页 |
| 1.5 植物蛋白质组学的研究进展 | 第28-31页 |
| 1.5.1 植物蛋白质组学的主要研究内容 | 第28-29页 |
| 1.5.2 植物蛋白质组学的研究技术 | 第29-30页 |
| 1.5.3 蛋白质学在叶色突变体中的应用 | 第30-31页 |
| 1.6 本研究的目的及意义 | 第31-32页 |
| 第二章 大白菜黄化突变体cdm的生理特征与遗传特性 | 第32-41页 |
| 2.1 材料与方法 | 第32-34页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第32页 |
| 2.1.2 EMS诱变 | 第32页 |
| 2.1.3 倍性鉴定 | 第32-33页 |
| 2.1.4 遗传分析 | 第33页 |
| 2.1.5 光合色素提取及定量 | 第33页 |
| 2.1.6 光合作用参数测定 | 第33页 |
| 2.1.7 荧光动力学参数测定 | 第33页 |
| 2.1.8 叶绿体及线粒体超微结构观察 | 第33-34页 |
| 2.2 结果分析 | 第34-40页 |
| 2.2.1 黄化突变体cdm的创制 | 第34-35页 |
| 2.2.2 黄化突变体cdm的形态特征 | 第35页 |
| 2.2.3 黄化突变体cdm遗传特征 | 第35-36页 |
| 2.2.4 黄化突变体cdm的叶绿素含量分析 | 第36-37页 |
| 2.2.5 黄化突变体cdm叶绿体和线粒体超微结构观察 | 第37-38页 |
| 2.2.6 黄化突变体cdm光合特性分析 | 第38-39页 |
| 2.2.7 黄化突变体cdm荧光动力学参数分析 | 第39-40页 |
| 2.3 小结 | 第40-41页 |
| 第三章 黄化突变体cdm候选基因分析 | 第41-58页 |
| 3.1 材料与方法 | 第41-50页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第41页 |
| 3.1.2 叶绿体DNA提取 | 第41-43页 |
| 3.1.3 重测序文库构建及测序 | 第43页 |
| 3.1.4 与参考基因组比对 | 第43页 |
| 3.1.5 SNP及Indel检测 | 第43页 |
| 3.1.6 基因的克隆与转化 | 第43-45页 |
| 3.1.7 RNA提取 | 第45页 |
| 3.1.8 RNA反转录 | 第45-46页 |
| 3.1.9 荧光定量PCR检测 | 第46-47页 |
| 3.1.10 Northern杂交 | 第47-50页 |
| 3.2 结果与分析 | 第50-57页 |
| 3.2.1 叶绿体全基因组重测序质量分析 | 第50-51页 |
| 3.2.2 参考基因组比对分析 | 第51-52页 |
| 3.2.3 SNP/InDel分析 | 第52页 |
| 3.2.4 SNP验证分析 | 第52页 |
| 3.2.5 候选基因分析 | 第52页 |
| 3.2.6 基因表达分析 | 第52-53页 |
| 3.2.7 RPS4结构分析 | 第53-55页 |
| 3.2.8 黄化突变体叶绿体rRNA加工效率分析 | 第55-57页 |
| 3.3 小结 | 第57-58页 |
| 第四章 大白菜黄化突变体cdm蛋白质组分析 | 第58-80页 |
| 4.1 材料与方法 | 第58-62页 |
| 4.1.1 植物材料 | 第58页 |
| 4.1.2 植物总蛋白提取 | 第58页 |
| 4.1.3 植物总蛋白定量 | 第58-59页 |
| 4.1.4 SDS电泳 | 第59页 |
| 4.1.5 蛋白质酶解 | 第59页 |
| 4.1.6 iTRAQ标记 | 第59页 |
| 4.1.7 肽段分离 | 第59-60页 |
| 4.1.8 LC–MS/MS质谱分析 | 第60-61页 |
| 4.1.9 MRM验证 | 第61-62页 |
| 4.1.10 qRT-PCR分析 | 第62页 |
| 4.2 结果与分析 | 第62-78页 |
| 4.2.1 蛋白质定量分析 | 第62页 |
| 4.2.2 SDS-PAGE蛋白质质量测定 | 第62-63页 |
| 4.2.3 蛋白鉴定及质量评估 | 第63-65页 |
| 4.2.4 差异蛋白筛选及定量结果 | 第65-66页 |
| 4.2.5 差异蛋白的聚类分析 | 第66页 |
| 4.2.6 总蛋白GO聚类及KEGG富集分析 | 第66-67页 |
| 4.2.7 差异蛋白GO聚类及KEGG分析 | 第67-69页 |
| 4.2.8 响应cdm黄化突变的下调蛋白质分析 | 第69-73页 |
| 4.2.9 响应cdm黄化突变的上调蛋白质分析 | 第73-74页 |
| 4.2.10 叶绿体基因编码蛋白质差异表达分析 | 第74-76页 |
| 4.2.11 基因表达模式分析 | 第76-78页 |
| 4.3 小结 | 第78-80页 |
| 讨论 | 第80-84页 |
| 结论 | 第84-85页 |
| 参考文献 | 第85-93页 |
| 附录 | 第93-98页 |
| 致谢 | 第98-99页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第99-100页 |
