| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 绪论 | 第13-29页 |
| 1.1 研究背景与目的意义 | 第13-14页 |
| 1.1.1 玉米 | 第13-14页 |
| 1.1.2 杨树 | 第14页 |
| 1.2 C3植物与C4植物 | 第14-19页 |
| 1.2.1 光合作用及C3植物 | 第14-16页 |
| 1.2.2 C4植物 | 第16-17页 |
| 1.2.3 C3植物与C4植物的差异 | 第17-19页 |
| 1.3 植物中的光调控 | 第19-23页 |
| 1.3.1 植物光受体及光形态建成 | 第20-22页 |
| 1.3.2 玉米与杨树光调控的研究进展 | 第22-23页 |
| 1.4 转录组学研究进展 | 第23-26页 |
| 1.4.1 测序技术 | 第23-24页 |
| 1.4.2 转录组在植物科学研究中的应用 | 第24-25页 |
| 1.4.3 转录组与转录后调控 | 第25-26页 |
| 1.5 蛋白质组学研究进展 | 第26-29页 |
| 1.5.1 蛋白质组学技术 | 第26-27页 |
| 1.5.2 蛋白质组学在植物科学研究中的应用 | 第27-29页 |
| 2 不同光质下玉米黄化苗转绿过程的组学分析 | 第29-75页 |
| 2.1 实验材料及实验方法 | 第29-35页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第29页 |
| 2.1.2 实验仪器 | 第29页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第29页 |
| 2.1.4 主要溶液配制 | 第29-30页 |
| 2.1.5 叶绿素含量测定 | 第30-31页 |
| 2.1.6 透射电镜检测样品制备 | 第31页 |
| 2.1.7 叶片伸长速率测定 | 第31页 |
| 2.1.8 生长素提取 | 第31-32页 |
| 2.1.9 原叶绿素酸酯含量检测 | 第32页 |
| 2.1.10 总RNA提取 | 第32页 |
| 2.1.11 实时荧光定量PCR | 第32页 |
| 2.1.12 苯酚抽提法提取总蛋白 | 第32-33页 |
| 2.1.13 蛋白浓度测定 | 第33-34页 |
| 2.1.14 iTRAQ样品制备 | 第34页 |
| 2.1.15 iTRAQ标记肽段的液相分离 | 第34页 |
| 2.1.16 Nano LC-MS/MS分析 | 第34-35页 |
| 2.1.17 转录组样品检测 | 第35页 |
| 2.1.18 转录组文库构建与质量控制(Quanlity Control) | 第35页 |
| 2.2 试验结果 | 第35-71页 |
| 2.2.1 不同光质处理下玉米黄化苗叶片的生理、生化变化 | 第35-44页 |
| 2.2.2 不同光质处理下玉米幼苗叶片的转录组分析 | 第44-65页 |
| 2.2.2.1 转录组原始数据初步 | 第44-46页 |
| 2.2.2.2 新可变剪切及新转录本的鉴定与验证 | 第46-51页 |
| 2.2.2.3 不同光质对玉米幼苗差异外显子利用的影响 | 第51-59页 |
| 2.2.2.4 不同光质对玉米幼苗中代谢及转录因子的影响 | 第59-64页 |
| 2.2.2.5 经6h不同光质处理的玉米黄化幼苗转录组分析 | 第64-65页 |
| 2.2.3 经6h不同光质处理的玉米黄化幼苗蛋白质组分析 | 第65-71页 |
| 2.3 讨论 | 第71-74页 |
| 2.3.1 不同光质对玉米黄化苗叶片表型调控的差异性 | 第71-72页 |
| 2.3.2 不同光质对玉米幼苗中基因转录、翻译的调控具有差异性 | 第72-73页 |
| 2.3.3 转录组及蛋白质组数据完善玉米基因组注释 | 第73-74页 |
| 2.4 结论 | 第74-75页 |
| 3 不同光质下杨树转录组分析 | 第75-85页 |
| 3.1 实验材料及实验方法 | 第75-76页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第75页 |
| 3.1.2 实验仪器 | 第75页 |
| 3.1.3 总RNA提取 | 第75页 |
| 3.1.4 实时荧光定量PCR | 第75-76页 |
| 3.1.5 转录组样品检测转录组样品检测 | 第76页 |
| 3.1.6 转录组文库构建与质量控制(Quanlity Control) | 第76页 |
| 3.2 实验结果 | 第76-83页 |
| 3.2.1 转录组原始数据分析 | 第76-78页 |
| 3.2.2 转录组中基因的差异表达分析 | 第78-79页 |
| 3.2.3 GO富集及Mapman注释分析 | 第79-80页 |
| 3.2.4 核酸代谢及转录调控相关基因 | 第80-81页 |
| 3.2.5 氨基酸及蛋白质代谢相关基因 | 第81页 |
| 3.2.6 细胞发育及细胞壁代谢相关基因 | 第81页 |
| 3.2.7 胁迫相关基因 | 第81-82页 |
| 3.2.8 基础代谢相关基因 | 第82页 |
| 3.2.9 激素代谢及调控相关基因 | 第82页 |
| 3.2.10 光合作用相关基因 | 第82-83页 |
| 3.3 讨论 | 第83-84页 |
| 3.4 结论 | 第84-85页 |
| 4 不同物种间PEPCK酶活差异及点突变对其酶活的影响 | 第85-94页 |
| 4.1 实验材料及实验方法 | 第85-87页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第85页 |
| 4.1.2 实验仪器 | 第85页 |
| 4.1.3 主要试剂 | 第85页 |
| 4.1.4 总RNA提取 | 第85-86页 |
| 4.1.5 蛋白浓度测定 | 第86页 |
| 4.1.6 PEPCK克隆和定点突变 | 第86-87页 |
| 4.1.7 蛋白表达和体外酶测定 | 第87页 |
| 4.2 实验结果 | 第87-92页 |
| 4.2.1 磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶 | 第87页 |
| 4.2.2 PEPCK蛋白进化分析 | 第87-88页 |
| 4.2.3 C3、C4植物中PEPCK序列差异比较分析 | 第88-89页 |
| 4.2.4 PEPCK在C4和C3植物中的酶活性 | 第89-90页 |
| 4.2.5 PEPCK活性与磷酸化位点和磷酸化水平的关系 | 第90-92页 |
| 4.3 讨论 | 第92-93页 |
| 4.4 结论 | 第93-94页 |
| 5 结论 | 第94-95页 |
| 参考文献 | 第95-110页 |
| 附录 | 第110-117页 |
| 附录Ⅰ 英文缩略词 | 第110-111页 |
| 附录Ⅱ 附表 | 第111-117页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第117-118页 |
| 致谢 | 第118-120页 |
| 附件 | 第120-121页 |
