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枯草芽孢杆菌ATCC6051宿主构建及表达元件、蛋白折叠功能基因的研究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
英文缩略词表第14-15页
第一章 绪论第15-34页
    1.1 枯草芽孢杆菌概述第15页
    1.2 枯草芽孢杆菌表达系统概述第15-31页
        1.2.1 枯草芽胞杆菌表达系统的特点第15-16页
        1.2.2 枯草芽胞杆菌表达宿主第16-18页
        1.2.3 枯草芽胞杆菌表达系统的载体第18-20页
        1.2.4 枯草芽胞杆菌表达系统的元件第20-26页
        1.2.5 枯草芽孢杆菌蛋白质分泌机制第26-29页
        1.2.6 枯草芽孢杆菌表达系统的应用第29-30页
        1.2.7 存在的问题第30-31页
    1.3 本论文立题依据与研究内容第31-34页
        1.3.1 立题依据及研究意义第31-32页
        1.3.2 主要研究内容第32页
        1.3.3 技术路线第32-34页
第二章 B.subtilisATCC6051宿主的构建及其表达特性、胞外蛋白组学的研究第34-60页
    2.1 引言第34-35页
    2.2 实验材料与方法第35-40页
        2.2.1 主要仪器和设备第35页
        2.2.2 菌种和质粒第35-37页
        2.2.3 主要试剂第37-38页
        2.2.4 所用引物序列第38-40页
        2.2.5 细菌培养基第40页
    2.3 实验方法第40-47页
        2.3.1 细菌的培养第40页
        2.3.2 质粒的构建第40-44页
        2.3.3 枯草芽孢杆菌的转化第44页
        2.3.4 枯草芽孢杆菌基因缺陷菌株的构建第44-45页
        2.3.5 枯草芽孢杆菌的发酵培养第45页
        2.3.6 枯草芽孢杆菌基因缺陷株的胞外分泌蛋白分析第45-46页
        2.3.7 蛋白表达重组菌株的培养第46页
        2.3.8 酶活测定方法第46-47页
    2.4 结果与讨论第47-59页
        2.4.1 B.subtilisATCC6051生长特性及宿主的构建第47-50页
        2.4.2 B.subtilisATCC6051宿主胞外分泌蛋白谱的研究第50-55页
        2.4.3 B.subtilisATCC6051宿主表达特性的研究第55-59页
    2.5 本章小结第59-60页
第三章 基于转录组数据对芽孢杆菌中不同类型启动子的研究第60-86页
    3.1 引言第60-61页
    3.2 实验材料与方法第61-65页
        3.2.1 主要仪器和设备第61页
        3.2.2 菌种和质粒第61-63页
        3.2.3 主要试剂第63页
        3.2.4 细菌培养基第63页
        3.2.5 所用引物序列第63-65页
    3.3 实验方法第65-69页
        3.3.1 细菌的培养第65页
        3.3.2 RNA-seq样品的制备第65-66页
        3.3.3 cDNA建库及测序第66页
        3.3.4 RNA-Seq数据的拼接及基因表达情况第66页
        3.3.5 RNA-seq生物信息学分析第66页
        3.3.6 质粒的构建第66-67页
        3.3.7 启动子筛选菌株的构建及培养第67-68页
        3.3.8 启动子的序列分析第68页
        3.3.9 强启动子的应用第68页
        3.3.10 酶活测定方法第68-69页
    3.4 结果与讨论第69-85页
        3.4.1 RNA样品的制备与分析第69-70页
        3.4.2 基于RNA-Seq数据对三株芽孢杆菌的分析第70-75页
        3.4.3 芽孢杆菌不同类型启动子的研究第75-82页
        3.4.4 强启动子的重组表达效率的研究第82-85页
    3.5 本章小结第85-86页
第四章 Sec途径类型信号肽的分泌效率研究第86-103页
    4.1 引言第86页
    4.2 实验仪器和材料第86-88页
        4.2.1 主要仪器设备第86页
        4.2.2 主要试剂第86页
        4.2.3 细菌培养基第86-87页
        4.2.4 菌种和质粒第87-88页
        4.2.5 所用引物序列第88页
    4.3 实验方法第88-92页
        4.3.1 菌体的培养第88页
        4.3.2 质粒的构建第88-90页
        4.3.3 信号肽重组菌株的构建第90-91页
        4.3.4 酶活测定方法第91页
        4.3.5 信号肽的分析第91-92页
        4.3.6 高效分泌信号肽的应用第92页
    4.4 结果与讨论第92-102页
        4.4.1 枯草芽孢杆菌信号肽筛选载体的构建第92-93页
        4.4.2 Sec类型信号肽对BgaB分泌效率的研究第93-95页
        4.4.3 信号肽LytF对不同外源蛋白分泌效率的研究第95-97页
        4.4.4 Sec途径类型信号肽对proMTG分泌效率的研究第97-98页
        4.4.5 Sec类型信号肽对AmyM分泌效率的研究第98-100页
        4.4.6 信号肽AprE对不同外源蛋白分泌效率的研究第100-102页
    4.5 本章小结第102-103页
第五章 转谷氨酰胺酶酶原在枯草芽孢杆菌中高效表达的应用研究第103-111页
    5.1 引言第103页
    5.2 实验材料与方法第103-104页
        5.2.1 主要仪器设备第103页
        5.2.2 菌种和质粒第103页
        5.2.3 主要试剂第103-104页
        5.2.4 培养基和溶液的配制第104页
        5.2.5 所用引物序列第104页
    5.3 实验方法第104-106页
        5.3.1 菌体的培养第104页
        5.3.2 质粒的构建第104-105页
        5.3.3 重组菌株的发酵培养第105页
        5.3.4 发酵液中葡萄糖含量的测定第105页
        5.3.5 胞外总蛋白分泌量的检测第105页
        5.3.6 重组蛋白样品的亲和层析纯化第105-106页
        5.3.7 酶活测定方法第106页
    5.4 结果与讨论第106-110页
        5.4.1 重组表达载体的构建第106页
        5.4.2 proMTG高效表达系统重组菌在摇瓶发酵的研究第106-108页
        5.4.3 proMTG高效表达系统重组菌在5L发酵罐培养的研究第108-109页
        5.4.4 proMTG高效表达系统重组菌的SDS-PAGE分析第109-110页
    5.5 本章小结第110-111页
第六章 Sec分泌途径中折叠相关功能基因研究第111-128页
    6.1 引言第111-112页
    6.2 实验材料与方法第112-114页
        6.2.1 主要仪器设备第112页
        6.2.2 菌种和质粒第112-113页
        6.2.3 主要试剂第113页
        6.2.4 细菌培养基第113页
        6.2.5 所用引物序列第113-114页
    6.3 实验方法第114-116页
        6.3.1 菌体的培养第114页
        6.3.2 基因序列预测及分析第114页
        6.3.3 质粒的构建第114-115页
        6.3.4 重组菌的构建第115-116页
        6.3.5 重组菌的培养和酶活测定方法第116页
    6.4 结果与讨论第116-127页
        6.4.1 Sec分泌途径基因改造工程菌株的构建第116-118页
        6.4.2 Sec分泌途径折叠相关基因改造的研究第118-122页
        6.4.3 三个不同来源PrsA蛋白与proMTG共表达的研究第122-126页
        6.4.4 B.megateriumPrsA蛋白与AmyM共表达的研究第126-127页
    6.5 本章小结第127-128页
结论和展望第128-132页
    结论第128-130页
    本论文创新点第130页
    展望第130-132页
参考文献第132-152页
附录第152-176页
攻读博士学位期间取得的研究成果第176-178页
致谢第178-179页
附件第179页

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