摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
1 绪论 | 第10-19页 |
1.1 猫免缺陷病毒概述 | 第10-12页 |
1.1.1 猫免疫缺陷病毒病原学 | 第10页 |
1.1.2 猫免疫缺陷病毒发病机理 | 第10-11页 |
1.1.3 猫免疫缺陷病毒流行病学 | 第11页 |
1.1.4 FIV感染临床症状及其变化 | 第11-12页 |
1.2 FIV基因组结构及其编码的蛋白质 | 第12-14页 |
1.2.1 Gag基因结构蛋白质主要功能 | 第12页 |
1.2.2 Pol基因编码结构蛋白质主要功能 | 第12-13页 |
1.2.3 env基因编码结构蛋白质主要功能 | 第13页 |
1.2.4 辅助ORFs基因编码蛋白质的主要功能 | 第13-14页 |
1.3 FIV诊断及预防 | 第14页 |
1.3.1 FIV常用诊断方法 | 第14页 |
1.3.2 FIV疫苗研究进展 | 第14页 |
1.4 FIV作为基因治疗载体在医学中的应用 | 第14-16页 |
1.5 流浪猫FIV感染的危害及管理现状 | 第16-17页 |
1.6 研究目的和意义 | 第17-19页 |
2 材料与方法 | 第19-26页 |
2.1 样品采集 | 第19页 |
2.2 试剂及主要仪器 | 第19-20页 |
2.3 ELISA检测 | 第20页 |
2.4 PCR检测 | 第20-24页 |
2.4.1 病毒核酸的提取 | 第20-21页 |
2.4.2 巢式PCR扩增FIV gag CA片段和env V3-V5片段 | 第21页 |
2.4.3 PCR扩增FeLV | 第21-22页 |
2.4.4 PCR产物胶回收 | 第22页 |
2.4.5 重组质粒的构建 | 第22-23页 |
2.4.6 重组质粒的提取 | 第23页 |
2.4.7 阳性重组质粒的酶切鉴定 | 第23-24页 |
2.4.8 测序 | 第24页 |
2.5 序列分析及亚型鉴定 | 第24页 |
2.6 获取代表毒株全基因序列 | 第24-26页 |
2.6.1 PCR扩增全基因序列 | 第24-25页 |
2.6.2 全基因序列拼接 | 第25页 |
2.6.3 全基因序列分析 | 第25-26页 |
3 结果 | 第26-46页 |
3.1 ELISA检测结果 | 第26页 |
3.2 PCR检测及测序结果 | 第26-27页 |
3.2.1 Env V3-V5和gag CA片段PCR检测结果 | 第26-27页 |
3.2.2 Env V3-V5和gag CA片段酶切鉴定结果 | 第27页 |
3.3 序列对比和亚型鉴定 | 第27-32页 |
3.3.1 Env V3-V5和gagCA端遗传距离计算及氨基酸序列对比 | 第27-31页 |
3.3.2 FIV亚型鉴定 | 第31-32页 |
3.4 CHN17全基因序列结构分析 | 第32-34页 |
3.4.1 CHN17全基因序列PCR扩增结果 | 第32-33页 |
3.4.2 全基因序列CHN17主要ORF区识别及可靠性分析 | 第33-34页 |
3.5 CHN17 gag基因生物信息学分析 | 第34-38页 |
3.5.1 gag基因编码氨基酸预测 | 第34-36页 |
3.5.2 gag全基因遗传距离计算 | 第36页 |
3.5.3 gag基因编码氨基酸序列的信号肽预测 | 第36页 |
3.5.4 gag基因编码氨基酸序列的疏水性分析 | 第36-37页 |
3.5.5 gag编码氨基酸序列N糖基化位点预测 | 第37-38页 |
3.6 CHN17 POL基因生物信息学分析 | 第38-40页 |
3.6.1 pol基因编码氨基酸预测 | 第38页 |
3.6.2 pol基因遗传距离计算 | 第38页 |
3.6.3 pol基因编码氨基酸疏水性分析及跨膜区预测 | 第38-39页 |
3.6.4 pol基因编码氨基酸序列N糖基化位点预测 | 第39-40页 |
3.7 CHN17 env基因生物信息学分析 | 第40-45页 |
3.7.1 env全基因遗传距离计算 | 第40页 |
3.7.2 env编码蛋白质疏水性分析及蛋白跨膜区预测 | 第40-41页 |
3.7.3 env基因编码氨基酸序列N糖基化位点预测 | 第41-42页 |
3.7.4 env氨基酸预测及保守区、高变区划分 | 第42-45页 |
3.8 Vif基因遗传距离计算 | 第45页 |
3.9 LTR结构分析 | 第45-46页 |
4 讨论 | 第46-50页 |
4.1 流浪猫FIV ELISA检测和巢式PCR检测 | 第46-47页 |
4.2 CHN17各片段序列变异分析 | 第47-48页 |
4.3 CHN17全基因结构及遗传进化分析 | 第48-50页 |
结论 | 第50-51页 |
参考文献 | 第51-57页 |
附录 | 第57-59页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第59-60页 |
致谢 | 第60-61页 |