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猫艾滋病病毒分子流行病学调查及代表毒株全基因序列分析

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
1 绪论第10-19页
    1.1 猫免缺陷病毒概述第10-12页
        1.1.1 猫免疫缺陷病毒病原学第10页
        1.1.2 猫免疫缺陷病毒发病机理第10-11页
        1.1.3 猫免疫缺陷病毒流行病学第11页
        1.1.4 FIV感染临床症状及其变化第11-12页
    1.2 FIV基因组结构及其编码的蛋白质第12-14页
        1.2.1 Gag基因结构蛋白质主要功能第12页
        1.2.2 Pol基因编码结构蛋白质主要功能第12-13页
        1.2.3 env基因编码结构蛋白质主要功能第13页
        1.2.4 辅助ORFs基因编码蛋白质的主要功能第13-14页
    1.3 FIV诊断及预防第14页
        1.3.1 FIV常用诊断方法第14页
        1.3.2 FIV疫苗研究进展第14页
    1.4 FIV作为基因治疗载体在医学中的应用第14-16页
    1.5 流浪猫FIV感染的危害及管理现状第16-17页
    1.6 研究目的和意义第17-19页
2 材料与方法第19-26页
    2.1 样品采集第19页
    2.2 试剂及主要仪器第19-20页
    2.3 ELISA检测第20页
    2.4 PCR检测第20-24页
        2.4.1 病毒核酸的提取第20-21页
        2.4.2 巢式PCR扩增FIV gag CA片段和env V3-V5片段第21页
        2.4.3 PCR扩增FeLV第21-22页
        2.4.4 PCR产物胶回收第22页
        2.4.5 重组质粒的构建第22-23页
        2.4.6 重组质粒的提取第23页
        2.4.7 阳性重组质粒的酶切鉴定第23-24页
        2.4.8 测序第24页
    2.5 序列分析及亚型鉴定第24页
    2.6 获取代表毒株全基因序列第24-26页
        2.6.1 PCR扩增全基因序列第24-25页
        2.6.2 全基因序列拼接第25页
        2.6.3 全基因序列分析第25-26页
3 结果第26-46页
    3.1 ELISA检测结果第26页
    3.2 PCR检测及测序结果第26-27页
        3.2.1 Env V3-V5和gag CA片段PCR检测结果第26-27页
        3.2.2 Env V3-V5和gag CA片段酶切鉴定结果第27页
    3.3 序列对比和亚型鉴定第27-32页
        3.3.1 Env V3-V5和gagCA端遗传距离计算及氨基酸序列对比第27-31页
        3.3.2 FIV亚型鉴定第31-32页
    3.4 CHN17全基因序列结构分析第32-34页
        3.4.1 CHN17全基因序列PCR扩增结果第32-33页
        3.4.2 全基因序列CHN17主要ORF区识别及可靠性分析第33-34页
    3.5 CHN17 gag基因生物信息学分析第34-38页
        3.5.1 gag基因编码氨基酸预测第34-36页
        3.5.2 gag全基因遗传距离计算第36页
        3.5.3 gag基因编码氨基酸序列的信号肽预测第36页
        3.5.4 gag基因编码氨基酸序列的疏水性分析第36-37页
        3.5.5 gag编码氨基酸序列N糖基化位点预测第37-38页
    3.6 CHN17 POL基因生物信息学分析第38-40页
        3.6.1 pol基因编码氨基酸预测第38页
        3.6.2 pol基因遗传距离计算第38页
        3.6.3 pol基因编码氨基酸疏水性分析及跨膜区预测第38-39页
        3.6.4 pol基因编码氨基酸序列N糖基化位点预测第39-40页
    3.7 CHN17 env基因生物信息学分析第40-45页
        3.7.1 env全基因遗传距离计算第40页
        3.7.2 env编码蛋白质疏水性分析及蛋白跨膜区预测第40-41页
        3.7.3 env基因编码氨基酸序列N糖基化位点预测第41-42页
        3.7.4 env氨基酸预测及保守区、高变区划分第42-45页
    3.8 Vif基因遗传距离计算第45页
    3.9 LTR结构分析第45-46页
4 讨论第46-50页
    4.1 流浪猫FIV ELISA检测和巢式PCR检测第46-47页
    4.2 CHN17各片段序列变异分析第47-48页
    4.3 CHN17全基因结构及遗传进化分析第48-50页
结论第50-51页
参考文献第51-57页
附录第57-59页
攻读学位期间发表的学术论文第59-60页
致谢第60-61页

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