单叶省藤cDNA全长文库构建及其表达序列标签分析
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-15页 |
| 1 棕榈藤简介 | 第9-10页 |
| 2 RNA的提取背景 | 第10-11页 |
| 3 构建cDNA文库的原理及其应用 | 第11-12页 |
| 4 DNA测序 | 第12页 |
| 5 植物EST及其研究进展 | 第12-14页 |
| 7 研究意义与技术路线 | 第14-15页 |
| 第二章 3种方法提取RNA提取 | 第15-25页 |
| 1 材料与方法 | 第15-19页 |
| ·材料来源 | 第15-16页 |
| ·CTAB法提取RNA | 第16-17页 |
| ·异硫氰酸胍法提取RNA | 第17-18页 |
| ·TRizol法提取RNA | 第18页 |
| ·电泳检测 | 第18-19页 |
| ·DNASE消化 | 第19页 |
| ·RNA二次结构消除 | 第19页 |
| ·电泳 | 第19页 |
| ·核酸蛋白仪检测RNA | 第19页 |
| 2 结果分析 | 第19-23页 |
| ·CTAB法提取RNA后检测结果 | 第19-21页 |
| ·异硫氰酸胍法提取RNA后检测结果 | 第21-22页 |
| ·TRizol法提取RNA后检测结果 | 第22页 |
| ·三种方法提取RNA对比分析 | 第22-23页 |
| 3 讨论 | 第23-25页 |
| 第三章 构建单叶省藤全长cDNA文库 | 第25-34页 |
| 1 材料与方法 | 第25-31页 |
| ·材料与试剂 | 第25页 |
| ·实验原理 | 第25-26页 |
| ·实验步骤 | 第26-31页 |
| 2 结果分析 | 第31-33页 |
| ·LD-PCR产物 | 第31页 |
| ·切胶回收后核酸蛋白仪检测 | 第31-32页 |
| ·切胶回收去除小于1000bp片段结果 | 第32页 |
| ·检测库容结果 | 第32页 |
| ·cDNA文库插入片段PCR检测 | 第32-33页 |
| 3 讨论 | 第33-34页 |
| 第四章 单叶省藤cDNA文库EST序列的测定 | 第34-45页 |
| 1 材料与方法 | 第34-38页 |
| ·实验试剂及仪器 | 第34页 |
| ·材料 | 第34页 |
| ·实验方法 | 第34-37页 |
| ·测序样品上机运行 | 第37页 |
| ·ABI3130XL测序仪的日常维护 | 第37-38页 |
| 2 结果与分析 | 第38-39页 |
| ·单克隆PCR产物浓度及其片度大小的确定 | 第38-39页 |
| ·测序结果 | 第39页 |
| 3 讨论 | 第39-45页 |
| ·单克隆的制备 | 第39-40页 |
| ·测序条件的优化及选择 | 第40页 |
| ·大规模EST序列测定及其遇到问题 | 第40-45页 |
| 第五章 单叶省藤的基因表达谱分析 | 第45-55页 |
| 1 材料与方法 | 第45-46页 |
| ·分析材 | 第45页 |
| ·生物信息学分析方法 | 第45-46页 |
| ·统计EST片段大小及contig丰度 | 第46页 |
| ·BLASTN与BLASTX比对 | 第46页 |
| ·高丰度conti gs分析 | 第46页 |
| 2 结果与分析 | 第46-53页 |
| ·获得EST分析 | 第46-48页 |
| ·独立基因分析 | 第48-51页 |
| ·BLASTN与BLASTX结果 | 第51页 |
| ·高丰度片段功能注释 | 第51-53页 |
| 3 讨论 | 第53-55页 |
| ·丰度 | 第53-54页 |
| ·BLASTN与BLASTX | 第54-55页 |
| 第六章 总结与展望 | 第55-57页 |
| 参考文献 | 第57-61页 |
| 作者简介 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62页 |
