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家蚕孵化酶基因启动子功能分析及其转录因子的初步筛选

摘要第6-8页
Abstract第8-10页
第1章 绪论第17-27页
    1.1. 研究目的及意义第17页
    1.2. 真核生物基因的表达调控第17-21页
        1.2.1. 转录水平调控的顺式作用元件第17-18页
        1.2.2. 反式作用因子第18-19页
        1.2.3. 家蚕基因转录水平表达调控研究进展第19-21页
    1.3. 启动子活性检测及功能分析常用方法第21-23页
        1.3.1. 生物信息学预测第21页
        1.3.2. 双荧光素酶报告系统第21页
        1.3.3. 凝胶阻滞迁移实验(EMSA)第21页
        1.3.4. 染色体免疫共沉淀(ChIP)第21-22页
        1.3.5. 酵母单杂交筛选系统第22-23页
    1.4. Bac to Bac杆状病毒表达系统简介第23-24页
    1.5. 孵化酶基因研究进展第24-25页
        1.5.1. 孵化酶基因概述第24页
        1.5.2. 孵化酶时空研究进展第24-25页
    1.6. 均一化文库简介第25-26页
    1.7. 课题的主要研究内容第26-27页
第2章 细胞水平分析家蚕孵化酶基因启动子的活性第27-41页
    2.1. 引言第27页
    2.2. 材料与方法第27-36页
        2.2.1. 实验材料及试剂第27-28页
        2.2.2. 试剂配制方法第28-29页
        2.2.3. 实验仪器第29页
        2.2.4. 数据分析软件及生物信息学分析软件第29页
        2.2.5. 家蚕基因组DNA的提取第29-30页
        2.2.6. 引物设计第30页
        2.2.7. BmHEⅠ启动子 5’端截短片段的克隆及生物信息学分析第30-31页
        2.2.8. 琼脂糖凝胶的制备及电泳第31-32页
        2.2.9. DNA纯化回收第32页
        2.2.10. 连接反应第32-33页
        2.2.11. 大肠杆菌Top10化学感受态细胞制备及转化第33页
        2.2.12. 质粒DNA的提取第33-34页
        2.2.13. 重组质粒DNA的酶切鉴定第34页
        2.2.14. 菌种的保存及序列测序第34-35页
        2.2.15. 报告质粒pGL-BmHEIp的构建第35页
        2.2.16. 家蚕BmN细胞培养与质粒转染第35-36页
        2.2.17. 激素对启动子活性的影响第36页
        2.2.18. 瞬时表达活性测定分析第36页
    2.3. 结果与分析第36-40页
        2.3.1. 家蚕基因组DNA的提取第36-37页
        2.3.2. BmHEⅠ基因5’侧翼区片段克隆第37-38页
        2.3.3. 瞬时转染载体构建第38页
        2.3.4. 家蚕孵化酶基因启动子的活性鉴定第38-39页
        2.3.5. 激素对家蚕孵化酶启动子活性的影响第39-40页
    2.4. 讨论第40页
    2.5. 章节小结第40-41页
第3章 组织水平分析家蚕孵化酶基因Ⅰ、Ⅱ启动子的活性第41-51页
    3.1. 引言第41页
    3.2. 实验材料及方法第41-45页
        3.2.1. 实验材料第41页
        3.2.2. 家蚕基因组DNA提取第41页
        3.2.3. PCR引物合成及扩增基因序列第41-42页
        3.2.4. 荧光素酶基因的PCR扩增第42页
        3.2.5. 家蚕孵化酶基因启动子片段的克隆第42页
        3.2.6. 转移载体构建第42-43页
        3.2.7. 鉴定重组转移载体质粒第43页
        3.2.8. 供体质粒转化DH10Bac细菌第43页
        3.2.9. 重组病毒基因组Bacmid质粒的提取第43-44页
        3.2.10. 重组杆状病毒的鉴定第44-45页
        3.2.11. 重组rBmNPV病毒的制备第45页
        3.2.12. 重组病毒接种家蚕第45页
        3.2.13. 双荧光素酶活性的测定第45页
    3.3. 结果第45-48页
        3.3.1. 双荧光素酶报告质粒的构建第45-46页
        3.3.2. 重组双荧光素酶载体的构建第46-47页
        3.3.3. 重组Bacmid鉴定第47页
        3.3.4. 家蚕孵化酶基因不同长度缺失片段的启动子在组织中活性第47-48页
    3.4. 讨论第48-49页
    3.5. 章节小结第49-51页
第4章 家蚕全长均一化酵母单/双杂交表达c DNA文库的构建第51-65页
    4.1. 引言第51页
    4.2. 实验材料与方法第51-60页
        4.2.1. 实验材料与试剂第51页
        4.2.2. 总RNA的提取第51-52页
        4.2.3. mRNA分离纯化第52-53页
        4.2.4. cDNA第一条链的合成第53-54页
        4.2.5. LD-PCR法扩增第二条链cDNA第54-55页
        4.2.6. 纯化cDNA第55页
        4.2.7. cDNA的Hybridization及均一化处理第55-56页
        4.2.8. Normalizationed cDNA的扩增第56-57页
        4.2.9. 均一化cDNA Sfi Ⅰ酶切处理第57页
        4.2.10. 均一化cDNA中短片段的去除第57页
        4.2.11. 连接反应第57-58页
        4.2.12. 电转化及库容检测和插入片段检测第58-59页
        4.2.13. 初级文库100万克隆基数扩增及提取质粒第59-60页
    4.3. 结果第60-64页
        4.3.1. 五龄第3天家蚕中肠和精巢组织的总RNA提取第60-61页
        4.3.2. cDNA合成第61页
        4.3.3. 全长均一化cDNA文库第61-62页
        4.3.4. 全长均一化表达cDNA表达文库质量评价第62-63页
        4.3.5. 文库质粒的提取第63-64页
    4.4. 讨论第64页
    4.5. 章节小结第64-65页
第5章 利用酵母单杂交法筛选家蚕孵化酶基因启动子的转录因子第65-79页
    5.1. 引言第65页
    5.2. 材料与方法第65-71页
        5.2.1. 实验试剂第65页
        5.2.2. 诱饵片段的获得第65-66页
        5.2.3. 诱饵载体的构建第66页
        5.2.4. 酵母感受态细胞的制备第66-67页
        5.2.5. 线性化诱饵质粒转化酵母感受态细胞第67-68页
        5.2.6. 诱饵菌株的鉴定第68-69页
        5.2.7. 测试诱饵菌株金担子素抗性基因(AbA~r)的本底表达水平第69页
        5.2.8. 酵母单杂交筛选第69-70页
        5.2.9. 酵母质粒DNA的提取及转化的大肠杆菌第70-71页
    5.3. 结果第71-76页
        5.3.1. 诱饵载体的构建第71-72页
        5.3.2. 诱饵菌株的鉴定第72页
        5.3.3. 诱饵菌株AbA~r本底水平表达的测定第72-74页
        5.3.4. 阳性克隆的获得第74页
        5.3.5. 阳性克隆的测序与分析第74-76页
    5.4. 讨论第76-77页
    5.5. 本章小结第77-79页
结论第79-81页
参考文献第81-85页
附录第85-87页
    附录1:BmHE Ⅰ启动子第85-86页
    附录2:BmHE Ⅱ启动子第86-87页
攻读硕士学位期间所发表的论文第87-88页
致谢第88页

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