摘要 | 第9-11页 |
ABSTRACT | 第11-12页 |
第1章 前言 | 第13-22页 |
1.1 人催乳素 | 第13-14页 |
1.1.1 人催乳素的基因与结构 | 第13页 |
1.1.2 人催乳素的功能 | 第13-14页 |
1.2 人催乳素受体 | 第14-17页 |
1.2.1 人催乳素受体的结构 | 第15-16页 |
1.2.2 人催乳素受体介导的信号转导 | 第16-17页 |
1.2.3 变异催乳素受体(△S2SF1a-PRLR) | 第17页 |
1.3 人催乳素及人催乳素受体与乳腺癌 | 第17-18页 |
1.3.1 人催乳素与乳腺癌 | 第17-18页 |
1.3.2 人催乳素受体与乳腺癌 | 第18页 |
1.4 microRNA | 第18-20页 |
1.4.1 microRNA的结构与特征 | 第18页 |
1.4.2 microRNA作用及作用方式 | 第18-19页 |
1.4.3 microRNA与乳腺癌 | 第19-20页 |
1.5 本研究的目的、意义和创新点 | 第20页 |
1.5.1 研究目的与意义 | 第20页 |
1.5.2 研究的创新点 | 第20页 |
1.6 研究内容与技术路线 | 第20-22页 |
1.6.1 研究内容 | 第20-21页 |
1.6.2 研究技术路线 | 第21-22页 |
第2章 SF1a-PRLR与△S2SF1a-PRLR稳转人乳腺癌MCF-7细胞株构建与鉴定 | 第22-34页 |
2.1 材料 | 第22-25页 |
2.1.1 细胞系 | 第22页 |
2.1.2 质粒与菌株 | 第22-23页 |
2.1.3 主要实验设备 | 第23-24页 |
2.1.4 主要实验试剂 | 第24-25页 |
2.1.5 扩增引物 | 第25页 |
2.2 方法 | 第25-28页 |
2.2.1 慢病毒载体构建与鉴定 | 第25-27页 |
2.2.2 慢病毒包装 | 第27页 |
2.2.3 稳转细胞细胞株构建、筛选、鉴定 | 第27页 |
2.2.4 MTS检测细胞增殖 | 第27-28页 |
2.3 结果与分析 | 第28-32页 |
2.3.1 重组质粒鉴定 | 第28页 |
2.3.2 慢病毒包装结果鉴定 | 第28-30页 |
2.3.3 稳转细胞株鉴定 | 第30-31页 |
2.3.4 MTS检测细胞增殖 | 第31-32页 |
2.4 讨论 | 第32-34页 |
2.4.1 外源基因转染细胞 | 第32-33页 |
2.4.2 SF1a-PRLR、△S2SF1a-PRLR促进乳腺癌细胞增殖 | 第33-34页 |
第3章 △S2SF1a-PRLR对乳腺癌细胞microRNA表达的影响 | 第34-65页 |
3.1 材料 | 第34-35页 |
3.1.1 细胞株 | 第34页 |
3.1.2 仪器设备 | 第34页 |
3.1.3 实验试剂 | 第34-35页 |
3.1.4 软件及数据库 | 第35页 |
3.2 方法 | 第35-37页 |
3.2.1 稳转细胞复苏与传代 | 第35页 |
3.2.2 RNA样品的制备与质检 | 第35-36页 |
3.2.3 SmallRNA测序 | 第36页 |
3.2.4 数据质控和基本序列分析 | 第36页 |
3.2.5 公共序列及基因组比对分析 | 第36-37页 |
3.2.6 已知microRNA鉴定及其表达分析 | 第37页 |
3.2.7 microRNA差异表达分析 | 第37页 |
3.2.8 新microRNA的预测及其表达分析 | 第37页 |
3.2.9 GO和KEGG显著性富集分析 | 第37页 |
3.3 结果与分析 | 第37-61页 |
3.3.1 RNA质量检测 | 第37-39页 |
3.3.2 原始数据质控统计结果 | 第39-40页 |
3.3.3 样本间sRNA公共序列分析及在基因组的分布 | 第40页 |
3.3.4 smallRNA在基因组上的分布 | 第40页 |
3.3.5 已知microRNA表达量统计及其表达分析 | 第40-41页 |
3.3.6 microRNA差异表达分析 | 第41-57页 |
3.3.7 新microRNA预测及表达情况 | 第57-58页 |
3.3.8 差异microRNA靶基因GO、KEGG显著性富集分析 | 第58-61页 |
3.4 讨论 | 第61-65页 |
3.4.1 关于实验设计与数据分析 | 第61-62页 |
3.4.2 差异表达 | 第62-63页 |
3.4.3 富集分析 | 第63-65页 |
第4章 结束语 | 第65-67页 |
4.1 结论 | 第65页 |
4.2 展望 | 第65-67页 |
致谢 | 第67-68页 |
参考文献 | 第68-73页 |
作者在学期间取得的学术成果 | 第73-74页 |
附录 | 第74-132页 |
附录A 重组质粒测序结果 | 第74-75页 |
附录B cleanreads与参考基因组比对 | 第75-77页 |
附录C 已知microRNA的表达量(TPM值) | 第77-102页 |
附录D 新预测的microRNA表达量TPM统计 | 第102-118页 |
附录E 仅在MCF7-SF1a中表达的microRNA(83) | 第118-120页 |
附录F 仅在MCF7-SF1a中不表达的microRNA | 第120-122页 |
附录G 仅在MCF7-Con中表达的microRNA(175) | 第122-126页 |
附录H 仅在MCF7-Con中不表达的microRNA | 第126-128页 |
附录I 靶基因相关信号通路 | 第128-131页 |
附录J 部分极显著性差异的microRNAs的功能简况 | 第131-132页 |