| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6页 |
| 第一章 绪论 | 第10-20页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第10-12页 |
| 1.2 研究现状及进展 | 第12-16页 |
| 1.2.1 基于实验的lncRNA-蛋白质相互作用鉴定 | 第12-13页 |
| 1.2.2 基于计算的lncRNA-蛋白质相互作用预测工作 | 第13-15页 |
| 1.2.3 基于矩阵分解的预测算法 | 第15-16页 |
| 1.3 本文的内容和结构安排 | 第16-20页 |
| 第二章 矩阵分解算法相关的理论知识 | 第20-28页 |
| 2.1 非负矩阵分解 | 第20-22页 |
| 2.2 图正则化的非负矩阵分解 | 第22-23页 |
| 2.3 概率矩阵分解 | 第23-25页 |
| 2.4 核贝叶斯矩阵分解 | 第25-27页 |
| 2.5 本章总结 | 第27-28页 |
| 第三章 lncRNA-蛋白质相互作用预测所需数据的处理及分析 | 第28-36页 |
| 3.1 lncRNA-蛋白质相互作用预测所需数据来源 | 第28-32页 |
| 3.1.1 lncRNA-蛋白质相互作用数据来源 | 第28-31页 |
| 3.1.2 lncRNA表达谱数据来源 | 第31页 |
| 3.1.3 蛋白质GO信息数据来源 | 第31-32页 |
| 3.2 lncRNA-蛋白质相互作用预测所需数据处理 | 第32-34页 |
| 3.2.1 lncRNA-蛋白质相互作用数据处理 | 第32-33页 |
| 3.2.2 lncRNA表达谱数据处理 | 第33-34页 |
| 3.2.3 蛋白质GO信息数据处理 | 第34页 |
| 3.3 本章总结 | 第34-36页 |
| 第四章 面向lncRNA-蛋白质相互作用的图正则化非负矩阵分解预测算法 | 第36-54页 |
| 4.1 LPGNMF预测算法 | 第36-41页 |
| 4.1.1 LPGNMF算法介绍 | 第36-39页 |
| 4.1.2 LPGNMF算法求解 | 第39-41页 |
| 4.2 LPGNMF预测算法性能评估 | 第41-42页 |
| 4.2.1 交叉验证 | 第41页 |
| 4.2.2 预测算法的性能评估参数 | 第41-42页 |
| 4.3 LPGNMF算法与其它算法的性能比较 | 第42-48页 |
| 4.4 LPGNMF预测算法的结果分析 | 第48-51页 |
| 4.5 本章总结 | 第51-54页 |
| 第五章 面向lncRNA-蛋白质相互作用的核贝叶斯矩阵分解预测算法 | 第54-68页 |
| 5.1 LPKBMF预测算法 | 第54-60页 |
| 5.1.1 LPKBMF算法介绍 | 第54-56页 |
| 5.1.2 LPKBMF算法求解 | 第56-59页 |
| 5.1.3 LPKBMF算法应用 | 第59-60页 |
| 5.2 LPKBMF预测算法性能评估 | 第60页 |
| 5.3 LPKBMF与其它算法的性能比较 | 第60-65页 |
| 5.4 LPKBMF预测算法的结果分析 | 第65-67页 |
| 5.5 本章总结 | 第67-68页 |
| 第六章 总结与展望 | 第68-70页 |
| 6.1 本文工作总结 | 第68-69页 |
| 6.2 工作展望 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-76页 |
| 致谢 | 第76-78页 |
| 在读期间发表的学术论文 | 第78页 |
