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玉米低温响应转录组及相关基因功能分析

符号说明第5-10页
中文摘要第10-12页
Abstract第12-14页
1 前言第15-37页
    1.1 低温胁迫对植物的影响第15-29页
        1.1.1 低温胁迫对植物生物膜的影响第15-18页
        1.1.2 低温对植物光合作用的影响第18-20页
        1.1.3 低温对植物PSⅡ的影响第20-22页
        1.1.4 低温对植物PSⅠ的影响第22-24页
        1.1.5 低温条件下的光破坏防御机制第24-28页
            1.1.5.1 依赖于叶黄素循环的热耗散第24-26页
            1.1.5.2 活性氧清除系统第26-28页
        1.1.6 植物抗低温分子生物学研究进展第28-29页
    1.2 玉米低温胁迫研究进展第29-30页
    1.3 次生代谢物质在作物抗逆中的作用第30-33页
        1.3.1 植物酚类化合物的分类第31-32页
        1.3.2 酚类化合物在植物中的生理功能第32-33页
    1.4 MYB转录因子在植物抗逆中的作用及分子机理第33-35页
    1.5 转录组测序技术研究进展第35-37页
    1.6 本研究的目的和意义第37页
2 材料与方法第37-56页
    2.1 实验材料及材料的培养方法第37-38页
    2.2 实验方法第38-56页
        2.2.1 耐低温和不耐低温玉米自交系的筛选第38-39页
            2.2.1.1 幼苗生理指标的测定第38-39页
            2.2.1.2 隶属函数综合评价方法第39页
        2.2.2 低温胁迫下玉米生理指标的测定第39-42页
            2.2.2.1 玉米荧光参数的测定第39页
            2.2.2.2 玉米膜脂含量的测定第39-40页
            2.2.2.3 玉米幼苗H_2O_2含量的测定第40页
            2.2.2.4 玉米幼苗O_2~(·?)产生速率的测定第40-41页
            2.2.2.5 玉米幼苗抗氧化酶活性的测定第41页
            2.2.2.6 玉米幼苗总酚含量的测定第41-42页
            2.2.2.7 玉米幼苗类黄酮含量的测定第42页
        2.2.3 玉米转录组的测定及差异表达基因分析第42-44页
            2.2.3.1 RNA的提取和纯化第42-43页
            2.2.3.2 测序文库的构建和Illumina测序第43页
            2.2.3.3 测序reads的去噪、拼接第43-44页
            2.2.3.4 与参考基因组比对、表达量的计算及差异表达基因筛选第44页
            2.2.3.5 差异表达基因的功能注释第44页
        2.2.4 RealtimePCR验证转录组结果第44-47页
        2.2.5 玉米MYB31和MYB-IF35基因的分离第47-51页
            2.2.5.1 玉米总RNA的提取第47页
            2.2.5.2 cDNA第一条链的合成第47-48页
            2.2.5.3 cDNA纯化第48页
            2.2.5.4 MYB31和MYB-IF35基因的克隆第48-51页
        2.2.6 真核表达载体的构建第51-52页
            2.2.6.1 正义表达载体的构建第51页
            2.2.6.2 DNA序列测定第51页
            2.2.6.3 根癌农杆菌LBA4404感受态细胞的制备与转化第51-52页
        2.2.7 利用农杆菌介导法转化拟南芥第52-54页
            2.2.7.1 花序侵染第52页
            2.2.7.2 过表达株系的抗生素筛选第52-53页
            2.2.7.3 过表达株系在DNA水平上的鉴定第53-54页
        2.2.8 玉米MYB31和MYB-IF35基因的亚细胞定位第54-55页
            2.2.8.1 pROKⅡ-GFP载体的构建第54页
            2.2.8.2 pROKⅡ-GFP瞬时表达载体转化农杆菌第54-55页
            2.2.8.3 pROKⅡ-GFP融合蛋白的亚细胞定位第55页
        2.2.9 数据分析软件第55-56页
3 结果与分析第56-123页
    3.1 玉米抗低温和不抗低温自交系的筛选第56-61页
        3.1.1 低温对玉米自交系生长状况的影响第56-58页
        3.1.2 低温对玉米自交系生理指标的影响第58-59页
        3.1.3 8个玉米自交系抗低温能力的综合评价第59-61页
    3.2 低温对玉米自交系M54和753F生长及生理指标的影响第61-68页
        3.2.1 低温处理不同时间对M54和753F中marker基因表达和幼苗生长的影响第61-62页
        3.2.2 低温处理不同时间对M54和753F荧光参数的影响第62-63页
        3.2.3 低温处理不同时间对M54和753F活性氧含量和抗氧化酶活性的影响第63-64页
        3.2.4 低温处理不同时间对M54和753F类黄酮和总酚含量的影响第64-65页
        3.2.5 低温处理不同时间对M54和753F膜脂和脂肪酸含量的影响第65-68页
    3.3 利用高通量转录组测序预测玉米自交系抗低温的分子机理第68-111页
        3.3.1 RNA-seq测序质量评估第68-69页
        3.3.2 基因表达谱数据比对效率统计第69-70页
        3.3.3 差异表达基因及其功能注释第70-71页
        3.3.4 差异表达基因的GO及COG注释第71-74页
        3.3.5 差异表达基因的KEGG注释第74-76页
        3.3.6 RT-PCR验证转录组测序结果第76页
        3.3.7 低温胁迫下光合作用过程相关差异表达基因的筛选第76-82页
        3.3.8 低温胁迫下膜脂代谢过程相关差异表达基因的筛选第82-87页
        3.3.9 低温胁迫下次生代谢过程相关差异表达基因的筛选第87-96页
        3.3.10 低温胁迫下转录因子相关差异表达基因的筛选第96-111页
    3.4 玉米次生代谢途径中参与抗低温关键基因的筛选及功能分析第111-123页
        3.4.1 玉米次生代谢途径中参与抗低温关键基因的进一步筛选第111-112页
        3.4.2 玉米MYB31和MYB-IF35基因的分离第112页
        3.4.3 玉米MYB31和MYB-IF35基因一级结构和理化性质分析第112-113页
        3.4.4 玉米MYB31和MYB-IF35蛋白与其他蛋白序列的同源性分析第113-114页
        3.4.5 玉米MYB31和MYB-IF35基因的亚细胞定位第114页
        3.4.6 玉米MYB31和MYB-IF35基因过表达载体的构建第114-117页
        3.4.7 DNA水平上拟南芥过表达株系的筛选鉴定第117页
        3.4.8 RNA水平上过表达株系的筛选鉴定第117-118页
        3.4.9 MYB31和MYB-IF35的过量表达提高拟南芥的抗低温能力第118-123页
            3.4.9.1 过量表达MYB31和MYB-IF35拟南芥的表型分析第118页
            3.4.9.2 玉米MYB31和MYB-IF35的过量表达对低温胁迫下相对电导率的影响第118-119页
            3.4.9.3 MYB31和MYB-IF35的过量表达对低温胁迫下PSⅡ光化学效率的影响第119-120页
            3.4.9.4 MYB31和MYB-IF35的过量表达对低温胁迫下SOD和APX活性的影响第120-121页
            3.4.9.5 MYB31和MYB-IF35的过量表达对低温胁迫下O2·?和H2O2含量的影响第121-123页
4 讨论第123-132页
    4.1 玉米自交系M54和753F的抗低温能力分析第123-124页
    4.2 差异表达基因所在的通路与低温响应分析第124-127页
        4.2.1 光合作用过程相关基因在玉米响应低温胁迫过程中发挥重要作用第124-125页
        4.2.2 膜脂代谢过程相关基因可能参与玉米对低温胁迫响应第125-126页
        4.2.3 次生代谢过程相关基因在玉米响应低温胁迫过程中发挥重要作用第126-127页
    4.3 转录因子在玉米响应低温胁迫过程中发挥重要作用第127-129页
    4.4 次生代谢途径中参与玉米低温响应的关键基因第129-132页
5 结论第132-134页
参考文献第134-145页
致谢第145-146页
攻读学位期间发表的论文及成果第146页

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