基于CUDA的蛋白质点检测快速实现方法研究
| 摘要 | 第3-4页 |
| ABSTRACT | 第4-5页 |
| 第一章 绪论 | 第8-14页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第8-9页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第9-12页 |
| 1.2.1 凝胶图像预处理研究现状 | 第9-10页 |
| 1.2.2 蛋白点检测算法研究现状 | 第10-12页 |
| 1.2.3 CUDA并行计算研究现状 | 第12页 |
| 1.3 本文的主要工作及章节安排 | 第12-14页 |
| 第二章 CUDA并行计算体系 | 第14-21页 |
| 2.1 CUDA协同处理体系 | 第14页 |
| 2.2 CUDA的软硬件体系 | 第14-17页 |
| 2.2.1 软件体系 | 第14-16页 |
| 2.2.2 硬件体系 | 第16-17页 |
| 2.3 线程模型 | 第17-18页 |
| 2.4 存储器模型 | 第18-20页 |
| 2.5 本章小结 | 第20-21页 |
| 第三章 基于CUDA的凝胶图像预处理快速实现方法 | 第21-38页 |
| 3.1 概述 | 第21页 |
| 3.2 NLM算法并行化设计 | 第21-26页 |
| 3.2.1 算法原理 | 第22-24页 |
| 3.2.2 并行化设计研究 | 第24-26页 |
| 3.3 TOP-HAT算法并行化设计 | 第26-28页 |
| 3.3.1 top-hat算法原理 | 第26-27页 |
| 3.3.2 并行化设计研究 | 第27-28页 |
| 3.4 CUDA并行化实现 | 第28-30页 |
| 3.4.1 CUDA程序主要技术实现 | 第28-29页 |
| 3.4.2 CUDA并行实现 | 第29-30页 |
| 3.5 实验及结果分析 | 第30-36页 |
| 3.5.1 实验平台介绍 | 第30-31页 |
| 3.5.2 NLM算法实验结果及分析 | 第31-34页 |
| 3.5.3 top-hat算法实验结果及分析 | 第34-36页 |
| 3.6 本章小结 | 第36-38页 |
| 第四章 基于CUDA的蛋白点检测快速实现方法 | 第38-56页 |
| 4.1 概述 | 第38-39页 |
| 4.2 蛋白质点预检测并行化研究 | 第39-43页 |
| 4.2.1 内、外标记控制分水岭算法分析 | 第39-40页 |
| 4.2.2 并行化设计研究 | 第40-43页 |
| 4.3 重叠蛋白质点分离并行化研究 | 第43-47页 |
| 4.3.1 重叠蛋白质点分离方法 | 第44-46页 |
| 4.3.2 并行化设计研究 | 第46-47页 |
| 4.4 CUDA并行实现 | 第47-48页 |
| 4.5 实验结果及分析 | 第48-54页 |
| 4.5.1 蛋白质点预检测实验结果及分析 | 第49-51页 |
| 4.5.2 重叠蛋白质点分离实验结果及分析 | 第51-54页 |
| 4.6 本章小结 | 第54-56页 |
| 第五章 总结与展望 | 第56-58页 |
| 5.1 研究工作总结 | 第56-57页 |
| 5.2 今后研究展望 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-63页 |
| 攻读硕士学位期间参与的科研项目和成果 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |
