| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第1章 引言 | 第9-38页 |
| 1.1 核糖体的组成与结构 | 第9-13页 |
| 1.1.1 核糖体的结构 | 第9-11页 |
| 1.1.2 核糖体上的重要功能位点 | 第11-13页 |
| 1.2 蛋白质的翻译过程 | 第13-14页 |
| 1.3 核糖体的组装 | 第14-29页 |
| 1.3.1 核糖体小亚基的体外组装 | 第15-18页 |
| 1.3.2 核糖体小亚基的体内组装 | 第18-19页 |
| 1.3.3 16S rRNA 的成熟过程 | 第19-23页 |
| 1.3.4 核糖体小亚基组装因子 | 第23-29页 |
| 1.4 电子显微学 | 第29-34页 |
| 1.4.1 电子显微学基础 | 第29-30页 |
| 1.4.2 单颗粒三维重构技术 | 第30-31页 |
| 1.4.3 三维分类方法简介 | 第31-33页 |
| 1.4.4 分辨率评估方法 | 第33-34页 |
| 1.5 本研究的重要意义 | 第34-38页 |
| 第2章 核糖体组装因子 RsgA 的功能研究 | 第38-64页 |
| 2.1 材料与方法 | 第38-48页 |
| 2.1.1 实验仪器 | 第38-39页 |
| 2.1.2 质粒构建和蛋白纯化表达 | 第39-40页 |
| 2.1.3 核糖体纯化 | 第40-41页 |
| 2.1.4 核糖体拆分和重组 | 第41页 |
| 2.1.5 体内核糖体组成分析（ribosome profile） | 第41页 |
| 2.1.6 30S 复合物的组装和冷冻样品制备 | 第41-42页 |
| 2.1.7 冷冻电镜数据收集 | 第42-45页 |
| 2.1.8 冷冻电镜数据处理 | 第45-46页 |
| 2.1.9 原子模型搭建 | 第46-48页 |
| 2.2 实验结果 | 第48-58页 |
| 2.2.1 RsgA 与核糖体小亚基结合能力的研究 | 第48页 |
| 2.2.2 RsgA 与核糖体小亚基的结合位点 | 第48-51页 |
| 2.2.3 RsgA 蛋白各个结构域和核糖体的相互作用 | 第51-55页 |
| 2.2.4 RsgA 与核糖体结合引起的构象变化 | 第55-57页 |
| 2.2.5 RsgA 阻止核糖体 70S 的形成 | 第57-58页 |
| 2.3 讨论与分析 | 第58-64页 |
| 2.3.1 RsgA 调控 RbfA 与核糖体解离的分子机制 | 第58-59页 |
| 2.3.2 RsgA 在核糖体组装过程中的作用 | 第59-61页 |
| 2.3.3 核糖体对 RsgA 的 GTPase 活性的激活 | 第61-62页 |
| 2.3.4 RsgA 可能是一个核糖体成熟后期的质量控制检查点 | 第62-64页 |
| 第3章 核糖体组装因子 RimM 的功能研究 | 第64-87页 |
| 3.1 材料与方法 | 第64-71页 |
| 3.1.1 实验仪器 | 第64页 |
| 3.1.2 质粒构建和蛋白纯化表达 | 第64-65页 |
| 3.1.3 菌株构建 | 第65页 |
| 3.1.4 生长速率测定 | 第65-66页 |
| 3.1.5 核糖体纯化 | 第66页 |
| 3.1.6 rRNA 的提取、分析 | 第66-68页 |
| 3.1.7 核糖体蛋白的质谱定量检测 | 第68-69页 |
| 3.1.8 沉淀实验 | 第69页 |
| 3.1.9 冷冻样品制备及数据收集 | 第69页 |
| 3.1.10 冷冻电镜数据处理 | 第69-70页 |
| 3.1.11 原子模型搭建和 temperature map 构建 | 第70-71页 |
| 3.2 实验结果 | 第71-84页 |
| 3.2.1 构建菌株的表型 | 第71-72页 |
| 3.2.2 不成熟核糖体的组成分析 | 第72-77页 |
| 3.2.3 A19ΔrimM 中提取的不成熟核糖体的结构特征 | 第77-79页 |
| 3.2.4 A19ΔrimM 中提取的不成熟核糖体与 RimM 结合后的结构特征 | 第79-81页 |
| 3.2.5 RimM 在 30S 上的结合位点 | 第81-84页 |
| 3.3 讨论与分析 | 第84-87页 |
| 3.3.1 RimM 在核糖体组装过程中的作用 | 第84页 |
| 3.3.2 RimM，RsgA 及 RbfA 在核糖体组装后期的相互联系 | 第84-87页 |
| 第4章 核糖体 17S rRNA 末端的结构 | 第87-93页 |
| 4.1 引言 | 第87页 |
| 4.2 材料和方法 | 第87-89页 |
| 4.2.1 实验仪器 | 第87页 |
| 4.2.2 高盐处理不成熟核糖体的提取 | 第87-88页 |
| 4.2.3 冷冻样品制备及数据收集 | 第88页 |
| 4.2.4 电镜图像处理 | 第88-89页 |
| 4.3 实验结果和分析 | 第89-93页 |
| 4.3.1 高盐处理对核糖体蛋白组成的影响 | 第89-90页 |
| 4.3.2 高盐处理后不成熟核糖体的结构 | 第90-91页 |
| 4.3.3 17S rRNA 末端的可能结构 | 第91-93页 |
| 第5章 高分辨率真核生物核糖体结构研究 | 第93-100页 |
| 5.1 引言 | 第93-94页 |
| 5.2 材料方法 | 第94-96页 |
| 5.2.1 核糖体的提取 | 第94页 |
| 5.2.2 冷冻样品制备及电镜数据收集 | 第94页 |
| 5.2.3 数据处理 | 第94-96页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第96-100页 |
| 5.3.1 阴道滴虫 80S 核糖体的电镜结构 | 第96-98页 |
| 5.3.2 阴道滴虫 80S 核糖体的组成分析 | 第98-100页 |
| 第6章 总结与展望 | 第100-104页 |
| 6.1 总结 | 第100-102页 |
| 6.1.1 冷冻电镜方法学总结 | 第100-101页 |
| 6.1.2 生物学意义总结 | 第101-102页 |
| 6.2 展望 | 第102-104页 |
| 参考文献 | 第104-116页 |
| 致谢 | 第116-118页 |
| 个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第118-119页 |
