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MiR-918的加工调节机制及其在红系分化中的功能研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-8页
引言第13-17页
1 实验材料第17-21页
    1.1 酶制品和分子量 Marker第17页
    1.2. 主要生化试剂第17页
    1.3. 培养基、血清及抗生素第17-18页
    1.4. 细胞因子和生长因子第18页
    1.5. 试剂盒第18页
    1.6. 菌株第18页
    1.7. 质粒第18页
    1.8. 细胞系第18页
    1.9. 人脐带血标本第18-19页
    1.10. 生物信息学分析软件第19页
    1.11. 主要仪器及设备第19-21页
2 实验方法第21-39页
    2.1. 细胞学实验第21-22页
        2.1.1 细胞系的培养第21页
        2.1.2 细胞系的诱导第21页
        2.1.3 细胞系的转染第21-22页
    2.2. 造血干细胞的体外培养第22-23页
        2.2.1 人脐带血标本的收集第22页
        2.2.2 单个核细胞的分离和纯化第22-23页
        2.2.3 CD34+造血干/祖细胞体外诱导红系分化第23页
        2.2.4 流式细胞术(FACS)检测细胞表面分化 maker第23页
    2.3. Real‐time PCR第23-25页
        2.3.1 TRIZOl 法提取细胞总 RNA第23-24页
        2.3.2 RNA 质量的检测第24页
        2.3.3 M-MLV 合成 cDNA 第一链第24-25页
    2.4. 重组质粒的构建第25页
    2.5. 质粒 DNA 的提取第25-26页
        2.5.1 质粒 DNA 的小量提取和定量第25-26页
    2.6. 质粒 DNA 的大量制备及纯化第26-27页
    2.7. 慢病毒的包装第27页
        2.7.1 慢病毒的包装和收获第27页
        2.7.2 慢病毒的浓缩第27页
        2.7.3 慢病毒感染目的细胞第27页
    2.8. Western blot第27-29页
        2.8.1 蛋白的提取及定量第27-28页
        2.8.2 蛋白的 SDS-PAGE 电泳第28页
        2.8.3 蛋白电转移第28页
        2.8.4 杂交第28页
        2.8.5 二次免疫印迹第28-29页
    2.9. 双萤光报告实验第29页
    2.10. RNA –EMSA 实验第29-30页
        2.10.1 样品的制备第29页
        2.10.2 制备-PAGE 电泳第29页
        2.10.3 蛋白的电转移第29-30页
        2.10.4 紫外交联第30页
        2.10.5 杂交第30页
    2.11. RNA‐IP(RNA Binding protein immunoprecipitation) 实验第30-32页
        2.11.1 制备抗体包被的 protein A第30页
        2.11.2 裂解细胞第30-32页
    2.12. MS2‐MBP 实验第32-33页
    2.13. 5,‐race 实验第33-36页
        2.13.1 磷酸化处理第33页
        2.13.2 “去帽子”反应-使用 Tobacco Acid pyrophospharase(TAP)去掉 m RNA 的 5,帽子,保留一个磷酸集团第33-34页
        2.13.3 5,-Race Adapter 连接第34页
        2.13.4 反转录反应,按下列体系加入:第34-35页
        2.13.5 outer PCR 反应第35页
        2.13.6 inner PCR 反应第35-36页
    2.14. 3,-Race 实验第36-37页
        2.14.1 反转录反应,体系如下:第36页
        2.14.2 套式 PCR 反应第36-37页
        2.14.3 inner PCR 反应第37页
    2.15 统计学分析第37-39页
3 实验结果第39-51页
    3.1. 红系分化中 miRNA 的表达检测第39-43页
        3.1.1 MiR-918 与红系分化相关第39-40页
        3.1.2 pri-918 全长转录本的获得第40页
        3.1.3 QKI-5 促进 miR-918 的加工第40-41页
        3.1.4 RNA‐IP 实验验证 QKI‐5 和 miR‐918 的结合第41-42页
        3.1.5 RNA‐EMSA 实验验证 QKI‐5 和 miR‐918 的直接结合第42-43页
        3.1.6 MS2-MBP 实验验证 QKI-5 和 miR-918 的结合第43页
    3.2. miR‐918 在红系分化过程中的功能研究第43-47页
        3.2.1 miR-918 基因结构分析第43-44页
        3.2.2 miR-918 在红系分化中的表达第44-45页
            3.2.2.1 hemin 诱导 K562 细胞向红系分化第44页
            3.2.2.2 定向诱导 CD34+向红系分化第44-45页
        3.2.3 miR‐918 在红系分化中的功能第45-47页
            3.2.3.1 过表达 miR-918 对 K562 的影响第45-46页
            3.2.3.2 过表达 miR-918 对 CD34+造血干细胞分化的影响第46-47页
    3.3. QKI‐5 在红系分化中的功能研究第47-48页
        3.3.1 QKI-5 在 K562 红系分化中的功能第47-48页
    3.4. miR‐918 作用于红系分化的分子机制研究第48-51页
        3.4.1 miR-918 靶基因的预测和初步验证第48-49页
        3.4.2 miR-918 靶基因的突变位点分析第49页
        3.4.3 miR-918 靶基因的 western blot 验证第49-51页
4 结论第51-53页
5 讨论第53-57页
    5.1 在细胞核中 miRNA 的生物起源和加工过程第53-54页
    5.2 miRNAs 在细胞质的加工过程第54页
    5.3 红系分化中重要的转录因子第54-57页
参考文献第57-63页
文献综述第63-75页
    参考文献第71-75页
致谢第75-76页
攻读硕士期间发表和待发表的学术论文第76-77页

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