| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 引言 | 第9-10页 |
| 1 文献综述 | 第10-21页 |
| 1.1 可变启动子研究现状 | 第10-14页 |
| 1.1.1 真核生物启动子 | 第10-11页 |
| 1.1.2 可变启动子 | 第11-12页 |
| 1.1.3 可变启动子与表观遗传学 | 第12-14页 |
| 1.2 转录因子与剪接因子研究现状 | 第14-16页 |
| 1.2.1 转录因子 | 第14页 |
| 1.2.2 剪接因子 | 第14-16页 |
| 1.2.3 转录因子与剪接因子的相互作用 | 第16页 |
| 1.3 数据库介绍 | 第16-18页 |
| 1.3.1 启动子数据库和表观遗传信息数据库 | 第16-17页 |
| 1.3.2 转录因子、剪接因子以及蛋白与蛋白相互作用数据库 | 第17-18页 |
| 1.4 本文的研究内容及意义 | 第18-19页 |
| 1.5 技术路线 | 第19-21页 |
| 2 人类可变启动子与组成型启动子的系统分析 | 第21-33页 |
| 2.1 材料和方法 | 第21-25页 |
| 2.1.1 数据集 | 第21页 |
| 2.1.2 启动子序列特征的统计分析方法 | 第21-24页 |
| 2.1.3 启动子表观遗传信息分析方法 | 第24-25页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第25-31页 |
| 2.2.1 人类、小鼠、斑马鱼和红藻启动子比较分析 | 第25-28页 |
| 2.2.2 人类启动子DNA信息量和DNA变形能分析 | 第28-29页 |
| 2.2.3 人类启动子的表观信息分析 | 第29-31页 |
| 2.3 本章小结 | 第31-33页 |
| 3 人类转录因子与剪接因子互作网络的构建分析 | 第33-43页 |
| 3.1 材料和方法 | 第33-36页 |
| 3.1.1 数据集 | 第33-34页 |
| 3.1.2 转录因子与剪接因子互作网络构建方法 | 第34页 |
| 3.1.3 网络参数 | 第34-36页 |
| 3.1.4 蛋白质相互作用相对倾向性因子 | 第36页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第36-42页 |
| 3.2.1 度分析 | 第36-37页 |
| 3.2.2 聚类系数分析 | 第37-38页 |
| 3.2.3 与SF或其他蛋白相连通的TF个数统计 | 第38-39页 |
| 3.2.4 中心度分析 | 第39-40页 |
| 3.2.5 蛋白质相互作用相对倾向性因子 | 第40-42页 |
| 3.3 本章小结 | 第42-43页 |
| 结论 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-49页 |
| 附录A 剪接因子列表 | 第49-50页 |
| 附录B 转录因子列表 | 第50-52页 |
| 在学研究成果 | 第52-53页 |
| 致谢 | 第53页 |
