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小麦3B染色体重测序及节节麦抗条锈病分析

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第一章 文献综述第12-27页
    1.1 小麦及其近缘种基因组测序研究进展第12-18页
        1.1.1 六倍体普通小麦的基因组测序第13-15页
        1.1.2 二倍体小麦的基因组测序第15-16页
        1.1.3 四倍体小麦的基因组测序第16-17页
        1.1.4 小麦近缘物种的基因组测序第17-18页
    1.2 泛基因组第18-21页
        1.2.1 细菌泛基因组研究进展第19-20页
        1.2.2 植物泛基因组研究进展第20-21页
    1.3 小麦遗传变异第21-23页
    1.4 节节麦第23-26页
        1.4.1 节节麦概述第23-24页
        1.4.2 节节麦在小麦遗传育种的应用第24页
        1.4.3 节节麦抗条锈病研究进展第24-26页
    1.5 立题依据和研究内容第26-27页
第二章 小麦染色体3B非必需基因序列分析第27-50页
    2.1 前言第27页
    2.2 材料与方法第27-33页
        2.2.1 实验材料第27-28页
        2.2.2 实验方法第28-33页
            2.2.2.1 “CRNIL1A”3B染色体的流式分选、文库构建和高通量测序第28-29页
            2.2.2.2 “CRNIL1A”3B序列与“中国春”3B分子全序列匹配第29页
            2.2.2.3 未匹配到“中国春”3B的“CRNIL1A”3B序列分析第29-30页
            2.2.2.4 “CRNIL1A”特异contigs序列的验证第30-31页
            2.2.2.5 “CRNIL1A”特异contigs序列的功能分析第31页
            2.2.2.6 六倍体小麦转录组数据的De novo组装第31-33页
    2.3 结果与分析第33-47页
        2.3.1 “CRNIL1A”3B染色体测序数据概述第33-34页
        2.3.2 未匹配到“中国春”3B染色体的“CRNIL1A”3B序列分析第34-35页
        2.3.3 “CRNIL1A”特异contigs序列的验证第35-41页
        2.3.4 “CRNIL1A”特异序列在全球不同区域六倍体小麦的分布第41-43页
        2.3.5 “CRNIL1A”特异序列的功能注释分析第43-44页
        2.3.6 不存在于“中国春”基因组中的六倍体小麦特异转录本第44-47页
    2.4 讨论第47-50页
第三章 小麦3B染色体的序列变异分析第50-59页
    3.1 前言第50页
    3.2 材料和方法第50-52页
        3.2.1 实验材料第50-51页
        3.2.2 实验方法第51-52页
            3.2.2.1 匹配“CRNIL1A”3B序列到“中国春”3B分子全序列第51页
            3.2.2.2 “CRNIL1A”3B与“中国春”3B染色体序列的变异分析第51页
            3.2.2.3 “CRNIL1A”3B染色体序列的SSR分析第51-52页
    3.3 结果与分析第52-57页
        3.3.1 “CRNIL1A”与“中国春”3B染色体序列的变异分析第52-53页
        3.3.2 变异类型在3B染色体上的分布第53-54页
        3.3.3 “CRNIL1A”3B染色体序列的SSR分析第54-57页
    3.4 讨论第57-59页
第四章 节节麦的抗条锈病分析第59-66页
    4.1 前言第59页
    4.2 材料与方法第59-61页
        4.2.1 实验材料第59-60页
        4.2.2 实验方法第60-61页
            4.2.2.1 条锈病菌生理小种第60页
            4.2.2.2 接种及成株期抗病鉴定第60-61页
    4.3 结果与分析第61-64页
        4.3.1 节节麦条锈病抗性的调查与鉴定第61-62页
        4.3.2 节节麦条锈病抗性的遗传分析第62-64页
    4.4 讨论第64-66页
参考文献第66-83页
致谢第83-85页
附录第85-99页
    附表第85-99页
在读期间已发表的文章第99页

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