| 摘要 | 第7-10页 |
| Abstract | 第10-13页 |
| 缩略语表（Abbreviation） | 第14-16页 |
| 第1章 文献综述 | 第16-33页 |
| 1.1 PR的危害及流行现状 | 第16-21页 |
| 1.1.1 临床特点与危害 | 第16-17页 |
| 1.1.2 国外流行情况 | 第17-18页 |
| 1.1.3 我国流行情况 | 第18-21页 |
| 1.2 PRV结构与主要蛋白功能 | 第21-28页 |
| 1.2.1 病毒粒子结构 | 第21页 |
| 1.2.2 PRV基因组 | 第21-23页 |
| 1.2.3 核衣壳蛋白 | 第23-24页 |
| 1.2.4 被膜蛋白 | 第24-25页 |
| 1.2.5 囊膜蛋白 | 第25-27页 |
| 1.2.6 毒力相关蛋白 | 第27-28页 |
| 1.3 PR防控措施 | 第28-31页 |
| 1.3.1 新型疫苗研究 | 第29-30页 |
| 1.3.2 根除净化措施 | 第30-31页 |
| 1.4 基因组测序技术 | 第31-33页 |
| 第2章 PRV（HNX株）生物学特性研究 | 第33-72页 |
| 2.1 研究目的和意义 | 第33页 |
| 2.2 材料 | 第33-37页 |
| 2.2.1 组织样品 | 第33页 |
| 2.2.2 菌株与病毒株 | 第33-34页 |
| 2.2.3 试验动物 | 第34页 |
| 2.2.4 主要试剂 | 第34页 |
| 2.2.5 培养基与相关试剂的配制 | 第34-35页 |
| 2.2.6 感受态细胞制备 | 第35页 |
| 2.2.7 引物和反应条件 | 第35-37页 |
| 2.2.8 主要试验器材 | 第37页 |
| 2.3 方法 | 第37-44页 |
| 2.3.1 组织样品的收集与处理 | 第37页 |
| 2.3.2 病毒DNA提取 | 第37-38页 |
| 2.3.3 PRV分子特征测定方法 | 第38页 |
| 2.3.4 病毒分离 | 第38页 |
| 2.3.5 病毒空斑纯化 | 第38-39页 |
| 2.3.6 间接免疫荧光（IFA）实验 | 第39页 |
| 2.3.7 病毒组织培养半数感染量（TCID50）测定 | 第39页 |
| 2.3.8 病毒一步生长曲线绘制 | 第39页 |
| 2.3.9 病毒粒子的纯化和形态观察 | 第39-40页 |
| 2.3.10 小鼠感染试验 | 第40-41页 |
| 2.3.11 PRV HNX株对PRV Bartha株母源抗体仔猪的感染试验 | 第41-43页 |
| 2.3.12 PRV HNX株对Bartha疫苗免疫仔猪感染试验 | 第43-44页 |
| 2.4 结果与分析 | 第44-70页 |
| 2.4.1 PR现场流行病学特点 | 第44页 |
| 2.4.2 PRV病原感染率 | 第44-45页 |
| 2.4.3 八株PRV重要基因同源性与进化分析 | 第45-49页 |
| 2.4.4 病毒的分离纯化 | 第49-50页 |
| 2.4.5 病毒IFA鉴定 | 第50页 |
| 2.4.6 病毒增殖效价 | 第50页 |
| 2.4.7 病毒生长特性 | 第50-51页 |
| 2.4.8 病毒形态学特点 | 第51-52页 |
| 2.4.9 PRV对小鼠的致病性 | 第52-57页 |
| 2.4.10 PRV HNX株可感染有母源抗体仔猪 | 第57-62页 |
| 2.4.11 PRV HNX株可感染被动免疫仔猪 | 第62-70页 |
| 2.5 讨论 | 第70-72页 |
| 2.5.1 我国PRV毒株致病力分析 | 第70-71页 |
| 2.5.2 PRV免疫原性基因功能域分析 | 第71-72页 |
| 第3章 PRV全基因组测序和比较基因组学研究 | 第72-108页 |
| 3.1 研究目的和意义 | 第72页 |
| 3.2 材料 | 第72-73页 |
| 3.2.1 菌株与病毒株 | 第72页 |
| 3.2.2 主要试验材料 | 第72页 |
| 3.2.3 引物和反应条件 | 第72-73页 |
| 3.3 方法 | 第73-79页 |
| 3.3.1 PRV HNX株、HNB株、Fa株全基因组测序和拼接 | 第73-74页 |
| 3.3.2 PRV HNX株、HNB株、Fa株的基因组Gap序列的测定 | 第74-76页 |
| 3.3.3 PRV Ea株全基因组序列测定和拼接 | 第76-77页 |
| 3.3.4 四株PRV全基因组序列分析 | 第77-79页 |
| 3.3.5 基因同源性和进化树分析 | 第79页 |
| 3.3.6 重组分析方法 | 第79页 |
| 3.4 结果与分析 | 第79-103页 |
| 3.4.1 PRV HNX株、HNB株、Fa株基因组序列特征 | 第79-86页 |
| 3.4.2 PRV Ea株基因组序列特征 | 第86页 |
| 3.4.3 PRV基因组水平同源性 | 第86-89页 |
| 3.4.4 PRV毒株间重要基因同源性 | 第89-96页 |
| 3.4.5 PRV重要基因进化树 | 第96-101页 |
| 3.4.6 四株PRV基因组未发现重组 | 第101-103页 |
| 3.5 讨论 | 第103-108页 |
| 3.5.1 PRV全基因组测序方法选择 | 第103-104页 |
| 3.5.2 PRV全基因组和部分基因进化关系 | 第104-105页 |
| 3.5.3 PRV差异较大基因与功能 | 第105-106页 |
| 3.5.4 PRV非编码区基因的功能 | 第106页 |
| 3.5.5 PRV基因组重组现象 | 第106-108页 |
| 第4章 结论 | 第108-109页 |
| 参考文献 | 第109-127页 |
| 附录 | 第127-157页 |
| 附表1 测定PRV HNX株Gap序列所用的引物列表 | 第127-129页 |
| 附表2 测定PRV HNB株Gap序列所用的引物列表 | 第129-131页 |
| 附表3 测定PRV Fa株Gap序列所用的引物列表 | 第131-133页 |
| 附表4 测定PRV Ea株全基因组序列所用的Gap引物列表 | 第133-135页 |
| 附表5 测定PRV Ea株全基因组序列所用的引物列表 | 第135-137页 |
| 附表6 HNX株与Bartha株、Kaplan株、Becker株各基因的氨基酸变异分析 | 第137-139页 |
| 附表7 HNB株与Bartha株、Kaplan株、Becker株各基因的氨基酸变异分析 | 第139-141页 |
| 附表8 HNX株与Bartha、Kaplan和Becker株比较基因组中各基因编码氨基酸的变化 | 第141-153页 |
| 附表9 HNX株与Fa和Ea株比较基因组中各基因编码氨基酸的变化 | 第153-157页 |
| 作者简历（Curriculum Vitae） | 第157-159页 |
| 致谢 | 第159-161页 |
