| 摘要 | 第4-7页 |
| Abstract | 第7-10页 |
| 缩略词 | 第13-14页 |
| 1 文献综述 | 第14-23页 |
| 1.1 水稻结实率的研究进展 | 第14-17页 |
| 1.1.1 影响水稻结实率的相关因素 | 第14-15页 |
| 1.1.2 水稻结实率的分子生物学研究 | 第15-17页 |
| 1.2 miR168对植物生长发育的调控作用 | 第17-18页 |
| 1.3 水稻基因组学的研究概况 | 第18-22页 |
| 1.3.1 水稻的结构基因组学研究 | 第18-19页 |
| 1.3.2 水稻的功能基因组学研究 | 第19-21页 |
| 1.3.3 全基因组重测序在水稻遗传育种中的应用 | 第21-22页 |
| 1.4 本研究的目的与意义 | 第22-23页 |
| 2 材料与方法 | 第23-39页 |
| 2.1 材料 | 第23-25页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第23页 |
| 2.1.2 仪器与设备 | 第23-24页 |
| 2.1.3 试剂和试剂盒 | 第24页 |
| 2.1.4 生物信息学分析所需软件及数据库 | 第24-25页 |
| 2.1.5 引物序列 | 第25页 |
| 2.2 方法 | 第25-39页 |
| 2.2.1 水稻转基因株系的分子鉴定 | 第25-27页 |
| 2.2.2 miR168a表达量的RTqPCR检测 | 第27-29页 |
| 2.2.3 转基因株系的栽培与生物学性状观察 | 第29-30页 |
| 2.2.4 基因组重测序分析 | 第30-37页 |
| 2.2.5 水稻的花形态观察、花粉的育性和活力检测 | 第37-39页 |
| 3 结果与分析 | 第39-68页 |
| 3.1 MIM168a转基因低结实率株系的获得 | 第39页 |
| 3.2 PCR阳性鉴定 | 第39-40页 |
| 3.3 MIM168a转基因低结实率株系的表型观察 | 第40-41页 |
| 3.4 MIM168a转基因低结实率株系的花形态和花粉育性检测 | 第41-43页 |
| 3.4.1 MIM168a转基因低结实率株系的花的形态观察 | 第41-42页 |
| 3.4.2 MIM168a转基因低结实率株系的花粉活力检测 | 第42-43页 |
| 3.5 miR168a的表达量与水稻结实率性状的相关性分析 | 第43-44页 |
| 3.6 MIM168a转基因低结实率株系和野生型的基因组学差异 | 第44-64页 |
| 3.6.1 MIM168a转基因低结实率株系和野生型的基因组重测序数据量的差异 | 第44-45页 |
| 3.6.2 MIM168a转基因低结实率株系和野生型SNPs和In Dels的差异 | 第45-61页 |
| 3.6.3 MIM168a转基因低结实率株系和野生型碱基替换的差异 | 第61-62页 |
| 3.6.4 MIM168a转基因低结实率株系与野生型结构变异的差异 | 第62-63页 |
| 3.6.5 MIM168a转基因低结实率株系的拷贝数变异分析结果 | 第63-64页 |
| 3.7 MIM168a转基因低结实率株系T-DNA插入位点分析 | 第64-68页 |
| 3.7.1 MIM168a转基因低结实率株系插入位点的鉴定 | 第64-67页 |
| 3.7.2 MIM168a转基因低结实率株系插入位点基因的生物信息学分析和功能预测 | 第67-68页 |
| 4 讨论 | 第68-71页 |
| 参考文献 | 第71-79页 |
| 附录 | 第79-81页 |
| 致谢 | 第81页 |
