| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 引言 | 第13-22页 |
| 1.1 分子标记的种类 | 第13-14页 |
| 1.1.1 单核苷酸多态性标记 | 第13-14页 |
| 1.1.2 插入缺失标记 | 第14页 |
| 1.2 SNPS基因分型技术 | 第14-19页 |
| 1.2.1 基于DNA构象的SNPs分型技术 | 第14-15页 |
| 1.2.2 基于PCR和酶切的SNPs分型技术 | 第15-16页 |
| 1.2.3 基于杂交的SNPs分型技术 | 第16-19页 |
| 1.3 高通量测序在SNPS分型中的应用概况 | 第19-20页 |
| 1.3.1 高通量测序在SNPs分型中的应用 | 第19-20页 |
| 1.3.2 利用高通量测序进行SNPs分型的不足 | 第20页 |
| 1.4 研究目的意义及技术路线 | 第20-22页 |
| 1.4.1 研究目的和意义 | 第20-21页 |
| 1.4.2 技术路线 | 第21-22页 |
| 第二章 低深度测序SNP分型算法与流程的开发 | 第22-27页 |
| 2.1 试验材料 | 第22页 |
| 2.2 试验方法 | 第22-23页 |
| 2.2.1 白菜模拟重测序数据集的产生 | 第22-23页 |
| 2.2.2 模拟重测序数据的过滤与SNPs检测 | 第23页 |
| 2.2.3 Pooled Mapping流程 | 第23页 |
| 2.3 结果与分析 | 第23-26页 |
| 2.3.1 Pooled Mapping的算法和流程开发 | 第23-24页 |
| 2.3.2 常规方法检测SNPs的准确性评估 | 第24-25页 |
| 2.3.3 Pooled Mapping法检测SNPs的准确性评估 | 第25-26页 |
| 2.4 小结 | 第26-27页 |
| 第三章 Pooled Mapping在白菜和甘蓝类蔬菜中的应用 | 第27-38页 |
| 3.1 白菜和甘蓝低深度重测序Pooled Mappling分析 | 第27-29页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第27-28页 |
| 3.1.2 试验方法 | 第28页 |
| 3.1.3 结果与分析 | 第28-29页 |
| 3.2 CAPS/dCAPS与KASP基因分型验证 | 第29-37页 |
| 3.2.1 试验材料 | 第29页 |
| 3.2.2 试验方法 | 第29-31页 |
| 3.2.3 结果与分析 | 第31-37页 |
| 3.3 小结 | 第37-38页 |
| 第四章 全文结论 | 第38-39页 |
| 参考文献 | 第39-45页 |
| 附录 | 第45-48页 |
| 致谢 | 第48-49页 |
| 作者简介 | 第49页 |
