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耐旱基因SiUPF3的生物信息学和功能分析

摘要第4-5页
Abstract第5页
引言第9-11页
1、文献综述第11-19页
    1.1 植物NMD受PTC位置影响第11-12页
        1.1.1 NMD的保守性和靶基因的不保守性第11页
        1.1.2 PTC位置能够影响NMD效率第11-12页
    1.2 Upf1负责激活真核生物中的NMD第12-13页
    1.3 植物NMD可选途径第13-15页
    1.4 SR蛋白家族和胁迫响应第15页
    1.5 Upf蛋白对生物和非生物胁迫具有抗性第15-18页
    1.6 本研究的目的与意义第18-19页
2、SiUPF3基因的生物信息学和表达模式分析第19-35页
    2.1 实验材料和试剂第19页
    2.2 实验设备和软件第19页
    2.3 实验方法第19-23页
        2.3.1 SiUPF3基因的生物信息学分析第19-21页
        2.3.2 SiUPF3基因的表达模式分析第21-23页
    2.4 SiUPF3生物信息学分析结果第23-29页
        2.4.1 SiUPF3基因的序列分析第23-25页
        2.4.2 SiUPF3蛋白的二级结构第25-27页
        2.4.3 SiUPF3的家族蛋白分析及系统进化树分析第27-28页
        2.4.4 SiUPF3基因的启动子预测分析第28-29页
    2.5 表达模式分析结果第29-33页
        2.5.1 SiUPF3基因在PEG诱导下的表达模式分析第29-31页
        2.5.2 SiUPF3基因在ABA胁迫下的表达模式分析第31-33页
    2.6 讨论第33-34页
    2.7 小结第34-35页
3、耐旱基因SiUPF3表达载体的构建和烟草转化第35-49页
    3.1 实验材料和仪器第35-36页
        3.1.1 试验材料第35-36页
        3.1.2 试验仪器第36页
    3.2 实验方法第36-45页
        3.2.1 谷子材料的种植及RNA的提取、cDNA的合成第36页
        3.2.2 RNA的提取第36页
        3.2.3 cDNA的获得第36页
        3.2.4 SiUPF3基因的克隆第36-41页
        3.2.5 pTF101-35s-SiUPF3表达载体的构建第41-42页
        3.2.6 pTF101.1-35s-SiUPF3质粒转化GV3101农杆菌第42-43页
        3.2.7 pTF101.1-35s-SiUPF3的农杆菌工程菌株侵染烟草植株第43-44页
        3.2.8 转基因烟草的筛选及植株再生第44页
        3.2.9 转基因烟草的PCR鉴定第44-45页
    3.3 结果第45-48页
        3.3.1 SiUPF3第45页
        3.3.2 pTF101.1-35s-SiUPF3表达载体第45-46页
        3.3.3 含有表达载体的农杆菌工程菌株鉴定第46-47页
        3.3.4 转基因烟草过表达株系的PCR鉴定第47-48页
    3.4 讨论第48页
    3.5 小结第48-49页
4 、耐旱基因SiUPF3的亚细胞定位第49-59页
    4.1 实验材料和试剂第49页
    4.2 实验仪器第49页
    4.3 实验方法第49-53页
        4.3.1 瞬时表达载体的构建第49-51页
        4.3.2 SiUPF3基因的亚细胞定位分析第51-53页
    4.4 结果与分析第53-58页
        4.4.1 瞬时表达载体第53-55页
        4.4.2 亚细胞定位第55-58页
    4.5 讨论第58页
    4.6 小结第58-59页
5、SiUPF3转基因烟草TO代植株的生理特征分析第59-67页
    5.1 试验材料第59-60页
        5.1.1 SOD的检测试剂配制第59-60页
        5.1.2 MDA含量检测试剂的配制第60页
        5.1.3 脯氨酸含量检测试剂的配制第60页
    5.2 试验方法第60-62页
        5.2.1 烟草植株的处理第60页
        5.2.2 SOD的测定第60-61页
        5.2.3 MDA的测定第61页
        5.2.4 脯氨酸含量的测定第61-62页
    5.3 结果第62-66页
        5.3.1 SiUPF3转基因的烟草植株的获得第62-63页
        5.3.2 SiUPF3转基因烟草T0代植株生理分析第63-66页
    5.4 讨论第66页
    5.5 小结第66-67页
结论第67-68页
参考文献第68-76页
附录A 荧光定量比较Ct值法测定相对表达量第76-78页
攻读硕士学位期间发表学术论文情况第78-79页
致谢第79-80页

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